novice logo novice z odseka za biokemijo in molekularno biologijo ijs letnik st januar dogodki in novosti kadrovske zadeve diplomanti podiplomci predavanja obiski clanki racunalniki razpisi konference financno stanje interni pravilniki in navodila arhiv prispevki ce znakov s stresicami ne vidite pravilno poskusite tole klik v biokemijskih novicah lahko preberete kaj se dogaja na odseku in ob njem hkrati pa bi tu morali najti najpomembnejse informacije o razpisih pravilnikih in podobnem ce v biokemijskih novicah cesa potrebnega ni mi povejte mogoce lahko dodamo napisite kaj tudi sami dogodki in novosti novembra je v casopisu delo izsel celostranski oglas s podpisi v katerem raziskovalci pozivamo drzavljane in drzavljanke rs k vecji financni podpori za znanost saj gre pri tem za nalozbo v prihodnost cilj naj bi bil proracunsko financiranje vsaj v visini sredstev iz leta objavo oglasa smo placali raziskovalci sami vsak je placal sit v decembru pa so natisnili se plakat z enakim besedilom in s podpisi decembra so na reaktorju svecano odprli novi nizkoenergijski tandemski pospesevalnik mev ki bo nadomestil let starega van de graffovega ki je lociran na jamovi pospesevalnik je namenjen raziskavam v eksperimentalni atomski fiziki in za izobrazevanje strokovnjakov decembra je v delovi prilogi znanje za razvoj izsel uvodnik vita turka v katerem dodatno osvetljuje potrebo po vecjih sredstvih za znanost naslednji vecer pa je prof turk nastopil tudi v zadnjem dnevniku na programu rts v cetrtek decembra se je na za javnost odprtem delu seje znanstvenega sveta predstavil boris turk edini prijavljeni kandidat za razpisano mesto vodje nasega odseka upravni odbor ijs je na seji odobril njegovo imenovanje decembra je prisel na vecmesecni strokovni obisk prof federico aragon iz kostarike federico je doktoriral v zgodnjih tih letih z delom ki ga je opravil na nasem odseku med tokratnim obiskom bo poskusil izolirati enega od lektinov iz kacjega strupa enega pa kristalizirati decembra nas je obiskal dr federico mayor generalni direktor unesco ogledal si je nekaj nasih laboratorijev v nadstropju in rentgenski spektrograf v kleti pred tem je ob vhodu v naso stavbo odkril plosco ki oznacuje da nas odsek sodeluje v unescovi svetovni mrezi za molekularno in celicno biologijo global network for molecular and cell biology mcbn o obisku je bil objavljen krajsi prispevek v oddaji ur na pop tv in v tv dnevniku nacionalne televizije naslednji dan pa je slika z odkritja plosce bila objavljena na prvi strani casopisa delo na drugi strani pa krajsi pogovor z visokim gostom veronika stoka je za nekaj vec kot tedne na delovnem obisku v laboratoriju guya salvesena v san diegu kalifornija kjer testira nekatere vzorce pripravljene na nasem odseku s decembrom sta odsla v pokoj igor kregar in vladimir cotic tudi v bodoce bosta sodelovala z nasim odsekom igor kregar pogodbeno vladimir cotic pa redno v pokoj sta odsla tudi institutski fotograf inz marjan smrke in bivsi pomocnik direktorja dr viktor dimic decembra zvecer smo imeli prednovoletno odsecno vecerjo na kateri smo se spomnili tudi letnice vita turka organizacijo je imela v rokah nastja zakrajsek pri izvedbi pa sta pomagala tudi jerca rozman in gregor anderluh razen velike vecine sodelavcev odseka so se srecanja udelezili tudi nekateri zunanji in bivsi sodelavci tako da nas je bilo skupaj okrog bozicne in novoletne cestitke smo kot odsek doslej dobili od secom computers sezana joze babnik nase upokojene sodelavke in veronike stoka ki je trenutno v kaliforniji kadrovske zadeve boris rogelj je se vedno na nizozemskem na cpro dlo v wageningnu bo vsaj se do konca marca trenutno pa je na obisku doma sitrje sodelavci so na porodniskem dopustu en pa na podaljsanem podoktorskem izpopolnjevanju tako da nas je na odseku skupaj zaposlenih imamo pa se dva starejsa stipendista adrijano in rogerja na odseku delata tudi gostujoca raziskovalca mag fan xiaohui dr med s kitajske in prof dr federico aragon iz kostarike januarja se iztece imenovanje marka dolinarja za v d vodje odseka kot novi vodja je bil imenovan za dobo let boris turk v casu njegovega sluzbenega potovanja in dopusta ga bo do konca februarja nadomescal igor krizaj ki bo v tem casu tudi podpisoval naloge za nabavo in izdajo materiala iz skladisca diplomanti podiplomci v novembru je z diplomsko nalogo zacela tina lenasi ki bo pod mentorstvom brigite lenarcic pripravila domeno ekvistatina delovni naslov je ekspresija in izolacija domene ekvistatina zanekrat je prosta samo se ena razpisana tema za diplomsko nalogo ponovno bi rad spomnil da naj vsak sodelavec odseka ki ima idejo za diplomsko nalogo izpolni formular v katerega naj vpise najnujnejse podatke o temi priporoceni literaturi in tehnikah ter ga odda v d vodji odseka ali kateremu od vodij projektov vodje projektov morajo vsekakor biti obvesceni o predlogu za dipl nalogo formular je dostopen vsem in ga najdete na odsecni mrezi naslov e \user\odsek\dform doc tam je tudi izpolnjen primer dprim doc obe datoteki sta pripravljeni s programom word prosim ne izpolnjujte formularja na racunalniku dokler ga ne preimenujete v decembru je zacela obcasno delati na nasem odseku ursa pecar dipl biol ki je zdaj stipendistka znanstvene fundacije delala pa bo od mentorstvom boruta struklja zagovori v zadnjem mesecu dni je diplomsko delo uspesno zagovarjala maja pevec dolenc fkkt ki je diplomsko nalogo pripravila pod delovnim mentorstvom marjetke kidric predavanja obiski zimska serija odsecnih cetrtkovih seminarjev v anglescini za katere skrbi roger pain je v pripravi je v veliki predavalnici ijs predaval prof stephen h white dept of physiology biophysics univ of california irvine naslov njegovega predavanja je bil protin folding on membranes mechanism of the induction of secondary structure nas je za kratko obiskal federico mayor generalni direktor unesco na nasem odseku si je ogledal laboratorije za spektroskopske meritve za proteinsko analizo in rentgensko spektrografijo clanki jeseni so izsli naslednji clanki nasih sodelavcev janko kos borut stabuc ana schweiger marta krasovec nina cimerman natasa kopitar jerala ivan vrhovec cathepsins b h and l and their inhibitors stefin a and cystatin c in sera of melanoma patients clinical cancer res faktor citiranosti se ni dolocen ker gre za relativno novo revijo reprint s na serumskih vzorcih zdravih pacientov z metastatskim melanomom in z zdravljenim koznim melanomom so s kvantitativnim elisa testom ugotovili da je koncentracija katepsina h v serumu znacilno povisana pri pacientih ki se ne odzivajo na kemoimunoterapijo katepsin h pa tudi katepsin b sta se izkazala za dobra prognostnicna pokazatelja pacienti z metstazami ki so imeli nizje koncentracije obeh encimov so ziveli bistveno dalj od tistih ki so imeli visoke koncentracije teh encimov stefin a cistatin c in katepsin l v serumu se niso izkazali kot prognosticni faktorji tamara t lah janko kos andrej blejec snezana frkovic georgio rastko golouh ivan vrhovec vito turk the expression of lysosomal proteinases and their inhibitors in breast cancer possible relationship to prognosis of disease pathol oncol res faktor citiranosti se ni dolocen reprint s avtorji so preucevali vzorce tkiv raka na dojki in okoliskega zdravega tkiva in ugotovili da je koncentracija katepsina d krat katepsina b krat in katepsina l krat vecja kot v zdravem tkivu povecana je bila tudi aktivnost katepsina b x in katepsina l x dolocili so korelacije bioloskih in histo patoloskih parametrov analiza prezivetja pa je pokazala da je najboljsi prognostik stefin a katepsina l in d pa ne eva zerovnik nina cimerman janko kos vito turk karl lohner thermal denaturation of human cystatin c and two of its variants comparison to chicken cystatin biol chem faktor citiranosti reprint s studij termicne denaturacije cistatina c njegove n terminalne delecijske mutante leu in mutante w s je razkril da sta si naravna oblika in delecijska mutanta med seboj podobni tm °c medtem ko ima mutanta w s za stopinje visjo tocko talisca razlog za to je verjetno narava inhibitorja pred termicno denaturacijo mutanta w s je monomerna medtem ko sta drugi dve molekuli homodimerni hkrati so objavili tudi tocke talisca za stefin a °c stefin b °c in kokosji cistatin °c racunalniki se vedno velja da za dostop do racunalniskega omrezja uporabljajte svoja uporabniska imena in gesla splosen dostop je mogoc samo v knjiznici po zakljucku dela na racunalnikih se ne pozabite izkljuciti z omrezja kadarkoli se prikljucite s svojim geslom ne glede na to s katerega racunalnika imate na voljo dostop do diska n kamor ne more spravljati datotek nihce drug razen vas na odsecnih racunalnikih se redno pojavljajo virusi v zadnjem casu gre predvsem za virus cap ki okuzi samo datoteke pripravljene s programom word prvic so ga v svetu zasledili v februarju gre pa za klasicni makro virus virus namrec napise vec kratkih programov makro s katerim skrije nekatere ukaze v wordu in prepreci nekatere funkcije podobna virusa sta concept in concept bb ter npad slednji je bil pripravljen leta v indoneziji in je ze vec kot pol leta na seznamu najpogosteje opazenih virusov v svetu vsi ti virusi se prenasajo z disketami in po interni mrezi z elektronsko posto pa samo ce vam kdo poslje okuzeno datoteko kot prilogo attachment ce ob uporabi worda opazite karkoli sumljivega npr da dokumenta ne morete shraniti drugace kot s koncnico dot povejte komu od tistih ki se na racunalnike bolje spoznajo cim odprete okuzeno datoteko na racunalniku ki ni bil okuzen se bo virus preselil na racunalnik in okuzil vse dokumente ki jih bo kdorkoli od tedaj naprej pripravil popravil odprl z wordom na tem racunalniku novembra smo med prvimi v sloveniji dobili novi mrezni tiskalnik hewlett packard laserjet nt verjetno ste ga ze vsi preizkusili in ugotovili njegove prednosti tiska do strani na minuto z resolucijo tock na inco dpi softversko do dpi zastojev kakrsnim smo bili prica s starim laserjetom iiid je konec cim bo proizvajalec dal na trg dodatek za dvostransko tiskanje ga bomo narocili in s tem zmanjsali porabo papirja dobili smo program za evaluacijo gelskih elektroforez in dot blotov mozno je direktno skeniranje mogoc pa je tudi vnos predhodno skeniranih slik shranjenih v formatu tiff ali bmp program pretvori lise v vrhove glede na njihovo intenziteto in debelino izracuna povrsino pod vrhovi preracuna molekulske mase na podlagi vnesenih podatkov o standardih in omogoca prenos tabeliziranih rezultatov v npr excel kjer lahko podatke obdelujete naprej program quantiscan je nalozen na racunalniku 'tea' v sobi b ob skenerju ikona je modre barve z napisom qscan razpisi razpisi za mednarodne projekte prihajajo skoraj vsak mesec in visijo najprej nekaj dni na oglasni deski v nadstropju kasneje pa jih vecino premestimo v nadstropje kjer naj bi bila oglasna deska rezervirana za obvestila o kongresih mednarodnem sodelovanju in stipendijah izsel je program mosbacher kolloquium tradiocionalnega srecanja nemskega drustva za biokemijo in molekulrano biologijo znanstveno srecanje bo aprila v mosbachu baden tokrat pa je posveceno caperonom naslov je molecular chaperones in biology and medicine kotizacija je dem sekcije pa so hsp ali so prionske bolezni bolezni narobe zvitih proteinov hsp hsp v medicini in drugi molekulski caperoni in katalizatorji zvijanja podrobnejse informacije pri marku na voljo so stipendije nato za raziskave in predavanja na grskih institutcijah informacije pri gospej tatjani mocnik int prijave zbirajo od januarja do maja ' evropska znanstvena fundacija organizira konference pod skupnim imenom euresco seznam in prijavni obrazi so na voljo na internetu http www esf org euresco ijs je izdal razpis za zlati znak jozefa stefana za leto rok za prijavo je financno stanje v decembru so me opozorili da podatki o financnem stanju ne sodijo na internet saj so ti podatki interne narave ceprav to ni nikjer oznaceno zato sem kakrsnekoli navedbe o financnem stanju teh mimogrede ni bilo kaj dosti zbrisal tudi iz starejsih stevilk biokemijskih novic vseeno pa se mi zdi prav da vas se naprej obvescam vsaj o nekaterih cenah saj so te vcasih precej visje kot bi kdo pricakoval tako smo za popravilo hladilnih naprav v decembru placali sit en gram papaina pa stane priblizno sit kot ze veste od sredine februarja vsa narocila ki gredo z odseka evidentiramo racunalnisko odsecna tajnica gospa alenka vpise vse kar narocate v tabelo skupaj z vasim imenom in kontom s katerega bo naroceno blago placano s tem bodo vodje projektov dobili boljsi vpogled v narocila ki se placujejo z njihovega projekta veliko drobnih stvari ki jih rabijo raziskovalci z vec projektov bremenijo enotni odsecni konto ti stroski se ob obracunu delijo proporcionalno glede na izplacane place s posameznega konta vse kar pa gre za rabo na samo enem projektu pa bremeni konte teh nalog naloge za nabavo razen mene podpise v tem primeru tudi nosilec naloge za nalogo prof vita turka pa boris turk postopno bomo presli na kupovanje vecine drazjih kemikalij po kontih posameznih projektov od julija naprej velja locevanje stroskov tudi pri institutskem fotografu ko mu predate material za fotografiranje mu morate povedati tudi na katerem projektu delate da bo lahko obremenil konto projekta pri prvem narocilu s posameznega projekta morate s seboj prinesti tudi podpisano narocilnico za delo dobite jo pri tajnici narocilnici za projektni skupini prof turka in jozeta brzina sta ze izdani zato jih sodelavci s teh dveh projektov ne nosite ponovno slike za diplomske naloge naj pripravi fotograf le v primeru da jih boste kasneje lahko vkljucili v clanek sicer pa jih fotokopirajte posnemite na polaroiodni film ali poskenirajte ter natisnite ena slika iz negativa stane na ijs sit ne glede na to ali narocite eno ali vec povecav en diapozitiv pa stane sit kar je izredno drago saj nas na odseku ce diapozitiv pripravimo sami stane vsega sit pod pogojem da poslikamo ves film naenkrat racun za institutskega fotografa bo za prvega pol leta znasal priblizno sit lani celo leto sit predlani sit kar pomeni da stroski sicer upadajo so pa se vedno zelo visoki vsaj pri pripravi diapozitivov pa bi lahko se veliko prihranili saj jih znamo sami pripraviti skoraj tako dobro kot profesionalni fotograf interni pravilniki in navodila v zacetku novembra smo se vsi ki delamo v nadstropju dogovorili za nekatere spremembe v razporeditvi aparatur in pri organizaciji dezurstev namesto dezurstev po tednih smo se odlocili za zadolzitve po aparaturah in pultih edino v zadnjem zgornjem laboratoriju ostanejo v veljavi nespremenjena dezurstva razen institutskih pravilnikov imamo na odseku dva interna pravilnika in sicer za delo z radioaktivnimi snovmi oba sta na voljo v laboratorijih kjer te izotope uporabljamo za delo z jodom v laboratoriju v stavbi hlevcka za delo z zveplom in fosforjem pa v izotopnem laboratoriju v nadstropju po en izvod je na vpogled tudi v odsecni pisarni februarja ' smo zaceli z dezurstvi ki naj bi zagotovili vec reda v skupnih delovnih prostorih predvsem merilnicah in digestorijih ce kje naletite na nered poklicite dezurnega ki mora poskrbeti da so delovne povrsine ciste in urejene seznam je nalepljen na vrata merilnice v nadstropju in na steno temnice v nadstropju konec leta ga bomo dopolnili z novimi sodelavci treba pa bo narediti tudi nov senam zadolzitev za aparature arhiv seznam za zdravje nevarnih snovi ki jih uporabljamo na odseku o prijavi diplomskih nalog delovni mentorji seznam vseh objavljenih clankov z nasega odseka za leta in prejsnje stevilke novic i letnik stevilka april stevilka maj stevilka junij stevilka julij avgust stevilka oktober november stevilka december prispevki posiljajte obvestila o dogodkih problemih predloge za izboljsave in ideje na naslov marko dolinar ijs si hvala vsem ki ste mi doslej pisali in sporocali popravke in predloge ker bom odslej bolj oddaljen od virov informacij bo morda v naslednjih stevilkah manj podatkov vendar mislim da bodo te vrste novice se vedno dobrodoslo branje nazaj na domaco stran odseka za biokemijo in molekularno biologijo ijs st izdana decembra zadnja sprememba decembra