diskusijska skupina za molekularno biologijo povzetki molecular biology discussion group abstracts nazaj na informacijsko stran dsmb uvajanje metod molekularne biologije za diagnosticiranje limfomov ira todorovi´c diagnostika malignih limfoidnih neoplazem vecinoma temelji na histopatoloskih kriterijih oziroma rezultatih morfoloskih in imunohistokemicnih analiz v stevilnih primerih pa so rezultati omenjenih analiz nejasni in ne zadostujejo za diagnostiko limfoproliferativnih procesov zato se cedalje bolj uporabljajo metode molekularne biologije predvsem southern blot analiza in reakcija veriznega pomnozevanja angl polymerase chain reaction pcr obe metodi southern blot analiza in reakcija veriznega pomnozevanja omogocata strukturno analizo genov za antigenske receptorje na b in t limfocitih s tem pa dolocanje klonalnosti limfoidnih proliferacij dolocanje klonalnosti limfoproliferativnih procesov je velikega diagnosticnega pomena monoklonalnost je namrec diagnosticni kriterij za neoplazijo ceprav ni nujno sinonim za malignost obratno poliklonalnost je znacilna za benigne reaktivne limfoproliferacije ceprav obstajajo tudi odstopanja npr poliklonalni limfomi b celic povzroceni z ebv torej prisotnost monoklonalne populacije celic v dolocenem vzorcu govori v prid diagnoze malignega limfoma seveda pa se rezultati molekularno bioloskih analiz lahko interpretirajo le skupaj z rezultati morfoloskih in imunohistokemicnih analiz dolocanje klonalnosti limfoidnih proliferacij s pomocjo metod molekularne biologije temelji na procesu preureditve v genih ki kodirajo posamezne polipeptidne verige antigenskih receptorjev na povrsini b in t limfocitov antigenski receptorji b celic so imunoglobulini antigenski receptorji t celic angl t cell receptor tcr pa so heterodimeri ki so povezani s cd molekulami na povrsini t limfocitov angl cluster of differentiation cd geni ki kodirajo razlicne polipeptidne verige antigenskih receptorjev se nahajajo na razlicnih kromosomih v prekurzorskih klicnih celicah je vsak gen sestavljen iz velikega stevila segmentov variabilnih v spajalnih angl joining j segmentov raznolikosti angl diversity d in konstantnih angl constant c segmentov tekom dozorevanja b in t limfocitov poteka proces somatske rekombinacije v katerem se med seboj povezejo po en v d in j segment tekom rekombinacije preureditve encim terminalna deoksinukleotidna transferaza nakljucno vgrajuje posamezne nukleotide med d in j ter v in d genskimi segmenti in tako tvori t i n segmente razlicnih dolzin poleg tega lahko pride tudi do somatskih delecij vsi nasteti procesi omogocajo veliko raznolikost molekul imunoglobulinov in receptorjev t limfocitov ter spoznavanje razlicnih antigenov southern blot hibridizacija je osnovna metoda za strukturno analizo genov za antigenske receptorje s katero lahko dolocamo klonalnost proliferacij b in t celic z obcutljivostjo pomanjkljivosti te metode so da zahteva veliko kolicino svezega ali zamrznjenega materiala oz veliko kolicino visokokvalitetne dna uporabo radioaktivno oznacenih sond je dolgotrajna tedna in precej draga zaradi omenjenih pomanjkljivosti je neprakticna za rutinsko analizo vzorcev zlasti tistih ki so fiksirani v formalinu in vklopljeni v parafin reakcija veriznega pomnozevanja pcr je bolj enostavna hitra rezultat se lahko dobi v dveh dneh ne zahteva uporabo radioaktivno oznacenega materiala predvsem pa omogoca analizo dna izolirane iz parafinskih rezin zaradi nastetih prednosti se lahko uporablja kot rutinska vendar dopolnilna metoda za diagnostiko limfoidnih proliferacij literatura s diaz cano pcr based alternative for diagnosis of immunoglobulin heavy chain gene rearrangement diagnostic molecular pathology roger a warnke lawrence m weiss john k c chan michael l cleary ronald f dorfman tumors of the lymph nodes and spleen atlas of tumor pathology third series fascicle michael h whittaker cheryl l willman a practical guide to the use of molecular genetic techniques in the diagnosis of lymphoid malignancies molecular diagnostics in pathology dominic v spagnolo molecular strategies in the diagnosis of non hodgkin's lymphomas joel w goodman imunoglobulini i struktura i funkcija osnovna i kliniflorinka imunologija prevod vi izdanja appleton lange savremena administracija beograd k lennert and a c feller histopathology of non hodgkin's lymphomas bruce alberts dennis bray julian lewis martin raff keith roberts james j watson the immune system molecular biology of the cell third adition l jeffrey mederios lawrence m weiss the utility of the polymerase chain reaction as a screening method for the detection of antigen receptor gene rearrangements human pathology henrik grisser applied molecular genetics in the diagnosis of malignant non hodgkin's lymphoma diagnostic molecular pathology d n slack k p mccarthy l m wiedemann and j p sloane evaluation of sensitivity specificity and reproducibility of an optimized method for detecting clonal rearrangements of immunoglobulin and t cell receptor genes in formalin fixed paraffin embedded sections diagnostics molecular pathology k p mccarthy j p sloane l m wiedemann rapid method for distinguishing clonal from polyclonal b cell populations in surgical biopsy specimens j clin pathol thomas j reed ann reid karen wallberg timothy j o'leary and glauco frizzera determination of b cell clonality in paraffin embedded lymph nodes using the polymerase chain reaction diagnostic molecular pathology giorgio inghirami matthias j szabolcs herman t yee paolo corradini ethel cesarman and daniel m knowles detection of immunoglobulin gene rearrangement of b cell non hodgkin's lymphomas and leukemias in fresh unfixed and formalin fixed paraffin embedded tissue by polymerase chain reaction laboratory investigation yao tseng chen kathleen d whitney and yachi chen clonality analysis of b cell lymphoma in fresh frozen and paraffin embedded tissues the effects of variable polymerase chain reaction parameters modern pathology povzetek je bil pripravljen za www januarja pripombe in vprasanja vezana na vsebino posljite iri na lanin naslov strmecki ibmi mf uni lj si glede oblikovanja strani pa na naslov marko dolinar ijs si nazaj na informacijsko stran dsmb signalna transdukcija aljosa bavec junij g proteinski receptorji heterotrimerni g proteini in g proteinski efektorji na tisoce razlicnih kemicnih in fizikalnih signalov konstantno bombardira povrsino celicne membrane nekateri izmed njih ne vstopajo v celico temvec se vezejo na posebne proteinske strukture na povrsini celice imenovane receptorji in sprozijo tok informacije v notranjost celice vezava liganda na receptor aktivira skupino sklopljenih proteinov t i g proteinov vezejo gtp ki aktivirajo razlicne encime in ionske kanale tarcni encimi in ionski kanali se imenujejo efektorji zato ker spremembe v njihovi aktivnosti povzrocijo spremembe v ionski kompozicji ali spremembe v nivoju sekundarnih obvescevalcev camp ali inozitol fosfat ki posredno vodijo do celicnega odziva vsaka evkariontska celica vsebuje receptorje za razlicne kemicne ali in fizikalne signale razlicne tipe g proteinov in stevilne efektorje vsakega s svojim subtipom celica lahko odgovori na tiste signale za katere ima pripadajoce receptorje vendar le specificnost interakcije receptor g protein doloci obmocje odziva celice tematika g protein sklopljeni receptorji struktura in funkcija tmr desenzitacija tmr g protein sklopljeni efektorji fosfolipaza c plc fosfolipaza a pla adenilil ciklaza retinalna fotoreceptorska ' ' ciklicna gmp fosfodiesteraza cgmp pde heterotrimerni g proteini biokemijski cikel g proteinov vloga a in bg podenote g proteinov pri signalni transdukciji struktura a podenote struktura bg podenote kontrola transmembranskih signalov poleg omenjene transducerske poti obstajajo tudi drugi nacini znotrajcelicne komunikacije posredovane preko g proteinov ras proteini rab proteini tu faktorji povzetek je bil pripravljen za www junija pripombe in vprasanja vezana na vsebino posljite aljosi na naslov bavec ibmi mf uni lj si glede oblikovanja strani pa na naslov marko dolinar ijs si nazaj na informacijsko stran dsmb