------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 1324 1ezg_A) ( 25 1a28_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 41 1a4i_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 51 1a6c_A) 0.6606 0.3633 10.5412 ( 0 0 6) 0 0.6606 0.3633 6 11 ( 1324 1ezg_A) ( 62 1a79_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 64 1a7s ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 77 1a8r_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 91 1aa6 ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 96 1aba ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 129 1ahs_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 136 1aiu ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 147 1all_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 150 1aln ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 153 1aly ) 0.6583 0.4433 11.4521 ( 0 0 6) 0 0.8269 0.5547 6 9 ( 1324 1ezg_A) ( 155 1am7_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 157 1amf ) 0.6627 0.2000 9.4773 ( 0 0 6) 0 0.6627 0.2000 6 20 ( 1324 1ezg_A) ( 161 1an8 ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 162 1an8 ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 169 1aoh_A) 0.6619 0.3634 9.9315 ( 0 0 6) 0 0.6619 0.3634 6 11 ( 1324 1ezg_A) ( 177 1aoz_A) 0.6645 0.4442 8.0741 ( 0 0 6) 0 0.8217 0.5540 6 9 ( 1324 1ezg_A) ( 191 1aqz_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 198 1at0 ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 207 1aua ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 233 1axi_B) nil ( 1324 1ezg_A) ( 259 1b0b ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 293 1b5l ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 300 1b6a ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 305 1b6r_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 307 1b74_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 315 1b8a_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 317 1b8d_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 329 1b9o_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 340 1bb9 ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 350 1bd7_A) 0.6650 0.2353 7.5501 ( 0 0 6) 0 0.9942 0.3529 6 17 ( 1324 1ezg_A) ( 351 1bd8 ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 360 1beb_A) 0.6661 0.3636 5.8885 ( 0 0 6) 0 0.8317 0.4545 6 11 ( 1324 1ezg_A) ( 361 1bed ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 365 1bf2 ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 367 1bf2 ) 0.6626 0.3997 9.5329 ( 0 0 6) 0 0.6626 0.3997 6 10 ( 1324 1ezg_A) ( 372 1bfg ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 387 1bhg_A) 0.6661 0.4444 5.8188 ( 0 0 6) 0 0.6661 0.4444 6 9 ( 1324 1ezg_A) ( 405 1bih_A) 0.6629 0.4439 9.3247 ( 0 0 6) 0 0.8299 0.5551 6 9 ( 1324 1ezg_A) ( 417 1bkf ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 420 1bkz_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 433 1bo4_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 442 1bou_B) nil ( 1324 1ezg_A) ( 460 1btn ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 472 1bup_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 491 1byf_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 495 1byr_A) 0.6658 0.3333 6.5375 ( 0 0 6) 0 0.9962 0.4999 6 12 ( 1324 1ezg_A) ( 541 1c8b_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 543 1c8n_A) 0.6614 0.2856 10.1739 ( 0 0 6) 0 0.6614 0.2856 6 14 ( 1324 1ezg_A) ( 553 1cb8_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 561 1cc8_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 584 1cg2_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 587 1cgh_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 609 1cjc_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 619 1ckm_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 624 1cl1_A) 0.6659 0.1481 6.2657 ( 0 0 6) 0 0.6659 0.1481 6 27 ( 1324 1ezg_A) ( 635 1cmx_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 672 1cs8_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 678 1ct9_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 683 1cuk ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 719 1d0n_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 729 1d2f_A) 0.8328 0.2381 4.4128 ( 0 0 10) 0 0.8328 0.2381 6 21 ( 1324 1ezg_A) ( 735 1d2p_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 740 1d3b_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 765 1d7p_M) 0.6622 0.3076 9.7768 ( 0 0 6) 0 0.6622 0.3076 6 13 ( 1324 1ezg_A) ( 767 1d7y_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 782 1dbh_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 792 1dce_B) nil ( 1324 1ezg_A) ( 795 1dcj_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 796 1dcp_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 801 1dcz_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 812 1de4_C) nil ( 1324 1ezg_A) ( 818 1df7_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 819 1df9_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 824 1dfc_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 834 1dgs_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 861 1dki_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 901 1doz_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 904 1dp7_P) nil ( 1324 1ezg_A) ( 913 1dq3_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 928 1drk ) 0.6665 0.1905 4.1378 ( 0 0 6) 0 0.9989 0.2857 6 21 ( 1324 1ezg_A) ( 937 1dtj_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 943 1dus_A) 0.6653 0.2857 7.1645 ( 0 0 6) 0 0.6653 0.2857 6 14 ( 1324 1ezg_A) ( 945 1duv_G) nil ( 1324 1ezg_A) ( 949 1dv1_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 960 1dx4_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 978 1dys_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 980 1dz3_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1005 1e29_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1007 1e2t_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1008 1e2w_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1034 1e4f_T) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1043 1e5k_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1082 1ea5_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1084 1eaf ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1121 1eej_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1124 1eem_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1165 1ehy_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1167 1ei1_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1169 1ei5_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1195 1ekm_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1201 1el5_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1204 1elj_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1210 1elw_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1211 1em2_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1217 1enf_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1224 1eo9_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1233 1ep3_B) 0.6661 0.3636 5.7997 ( 0 0 6) 0 0.8330 0.4545 6 11 ( 1324 1ezg_A) ( 1267 1euh_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1268 1eup_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1294 1ex0_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1301 1exj_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1324 1ezg_A) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 0 15) 0 1.0000 1.0000 6 6 ( 1324 1ezg_A) ( 1345 1f0i_A) 0.6654 0.2353 7.0871 ( 0 0 6) 0 0.9897 0.3529 6 17 ( 1324 1ezg_A) ( 1366 1f1u_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1388 1f3v_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1395 1f45_B) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1410 1f60_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1415 1f68_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1425 1f7d_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1435 1f8f_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1447 1f9a_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1451 1f9z_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1464 1fc6_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1470 1fch_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1472 1fcy_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1476 1fdr ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1481 1feh_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1497 1fgj_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1501 1fgy_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1508 1fi6_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1513 1fj2_A) 0.6628 0.2353 9.3971 ( 0 0 6) 0 0.6628 0.2353 6 17 ( 1324 1ezg_A) ( 1514 1fj7_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1577 1fno_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1591 1fob_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1595 1fp1_D) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1604 1fpz_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1622 1fsz ) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1624 1ft9_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1643 1fwx_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1644 1fwx_A) 0.6647 0.3998 7.9133 ( 0 0 6) 0 0.9771 0.5981 6 10 ( 1324 1ezg_A) ( 1665 1fzr_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1690 1g1l_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1692 1g1t_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1724 1g4u_S) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1731 1g5c_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1736 1g5t_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1738 1g61_A) 0.6663 0.2105 5.1571 ( 0 0 6) 0 0.9977 0.3158 6 19 ( 1324 1ezg_A) ( 1747 1g72_A) 0.9887 0.1304 7.4355 ( 0 0 15) 0 0.9932 0.1304 6 46 ( 1324 1ezg_A) ( 1756 1g7s_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1759 1g86_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1761 1g8a_A) 0.6653 0.2222 7.2161 ( 0 0 6) 0 0.9962 0.3333 6 18 ( 1324 1ezg_A) ( 1763 1g8f_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1776 1g97_A) nil ( 1324 1ezg_A) ( 1777 1g97_A) 0.9998 0.5454 2.6300 ( 0 0 15) 0 0.9998 0.5454 6 11 ( 1324 1ezg_A) ( 1778 1g99_A) 0.8312 0.4544 6.0987 ( 0 0 10) 0 0.8312 0.4544 6 11 ( 1324 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