------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 1415 1f68_A) ( 25 1a28_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 41 1a4i_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 51 1a6c_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 62 1a79_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 64 1a7s ) nil ( 1415 1f68_A) ( 77 1a8r_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 91 1aa6 ) 0.6640 0.1143 8.5282 ( 0 3 6) 0 0.6640 0.1143 6 35 ( 1415 1f68_A) ( 96 1aba ) nil ( 1415 1f68_A) ( 129 1ahs_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 136 1aiu ) nil ( 1415 1f68_A) ( 147 1all_A) 0.6472 0.4951 14.3023 ( 0 3 6) 0 0.6472 0.4951 6 8 ( 1415 1f68_A) ( 150 1aln ) nil ( 1415 1f68_A) ( 153 1aly ) nil ( 1415 1f68_A) ( 155 1am7_A) 0.3878 0.3670 8.7602 ( 1 4 6) 0 0.3878 0.3670 6 8 ( 1415 1f68_A) ( 157 1amf ) nil ( 1415 1f68_A) ( 161 1an8 ) nil ( 1415 1f68_A) ( 162 1an8 ) nil ( 1415 1f68_A) ( 169 1aoh_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 177 1aoz_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 191 1aqz_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 198 1at0 ) nil ( 1415 1f68_A) ( 207 1aua ) nil ( 1415 1f68_A) ( 233 1axi_B) nil ( 1415 1f68_A) ( 259 1b0b ) 0.6654 0.5708 7.0820 ( 0 5 6) 0 0.6654 0.5708 6 7 ( 1415 1f68_A) ( 293 1b5l ) nil ( 1415 1f68_A) ( 300 1b6a ) nil ( 1415 1f68_A) ( 305 1b6r_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 307 1b74_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 315 1b8a_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 317 1b8d_A) 0.6630 0.4440 9.3010 ( 0 2 6) 0 0.6630 0.4440 6 9 ( 1415 1f68_A) ( 329 1b9o_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 340 1bb9 ) nil ( 1415 1f68_A) ( 350 1bd7_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 351 1bd8 ) 0.6624 0.4439 9.6134 ( 0 1 6) 0 0.6662 0.4444 6 9 ( 1415 1f68_A) ( 360 1beb_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 361 1bed ) 0.1996 0.1940 9.6559 ( 1 2 6) 0 0.1996 0.1940 6 12 ( 1415 1f68_A) ( 365 1bf2 ) nil ( 1415 1f68_A) ( 367 1bf2 ) nil ( 1415 1f68_A) ( 372 1bfg ) nil ( 1415 1f68_A) ( 387 1bhg_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 405 1bih_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 417 1bkf ) nil ( 1415 1f68_A) ( 420 1bkz_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 433 1bo4_A) 0.2488 0.2413 7.9069 ( 2 5 6) 0 0.2488 0.2413 6 10 ( 1415 1f68_A) ( 442 1bou_B) 0.3874 0.1970 11.3213 ( 1 4 6) 0 0.3874 0.1970 6 20 ( 1415 1f68_A) ( 460 1btn ) nil ( 1415 1f68_A) ( 472 1bup_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 491 1byf_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 495 1byr_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 541 1c8b_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 543 1c8n_A) 0.1996 0.1895 11.0556 ( 2 4 6) 0 0.1996 0.1895 6 14 ( 1415 1f68_A) ( 553 1cb8_A) 0.1996 0.1867 7.0084 ( 2 4 6) 0 0.1996 0.1867 6 15 ( 1415 1f68_A) ( 561 1cc8_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 584 1cg2_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 587 1cgh_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 609 1cjc_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 619 1ckm_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 624 1cl1_A) 0.3852 0.1474 17.0663 ( 1 4 6) 0 0.3852 0.1474 6 27 ( 1415 1f68_A) ( 635 1cmx_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 672 1cs8_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 678 1ct9_A) 0.6651 0.1818 7.4502 ( 0 0 6) 0 0.6661 0.1818 6 22 ( 1415 1f68_A) ( 683 1cuk ) nil ( 1415 1f68_A) ( 719 1d0n_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 729 1d2f_A) 0.2969 0.1834 8.9930 ( 1 3 6) 0 0.2969 0.1834 6 21 ( 1415 1f68_A) ( 735 1d2p_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 740 1d3b_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 765 1d7p_M) nil ( 1415 1f68_A) ( 767 1d7y_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 782 1dbh_A) 0.1996 0.1895 12.9895 ( 2 4 6) 0 0.1996 0.1895 6 14 ( 1415 1f68_A) ( 792 1dce_B) 0.1996 0.1895 12.5050 ( 2 4 6) 0 0.1996 0.1895 6 14 ( 1415 1f68_A) ( 795 1dcj_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 796 1dcp_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 801 1dcz_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 812 1de4_C) nil ( 1415 1f68_A) ( 818 1df7_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 819 1df9_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 824 1dfc_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 834 1dgs_A) 0.3874 0.2853 11.7392 ( 1 4 6) 0 0.3874 0.2853 6 13 ( 1415 1f68_A) ( 861 1dki_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 901 1doz_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 904 1dp7_P) nil ( 1415 1f68_A) ( 913 1dq3_A) nil ( 1415 1f68_A) ( 928 1drk ) 0.6643 0.1905 8.2872 ( 0 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