------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 1665 1fzr_A) ( 25 1a28_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 41 1a4i_A) 0.5545 0.7106 8.5018 ( 0 0 10) 0 0.6663 0.8559 9 7 ( 1665 1fzr_A) ( 51 1a6c_A) 0.4441 0.3635 8.6069 ( 0 1 6) 1 0.4441 0.3635 9 11 ( 1665 1fzr_A) ( 62 1a79_A) 0.4444 0.5713 4.8649 ( 0 2 6) 0 0.4444 0.5713 9 7 ( 1665 1fzr_A) ( 64 1a7s ) nil ( 1665 1fzr_A) ( 77 1a8r_A) 0.4439 0.3076 9.5867 ( 0 1 6) 0 0.4439 0.3076 9 13 ( 1665 1fzr_A) ( 91 1aa6 ) 0.7750 0.2000 7.1290 ( 0 11 21) 0 0.7750 0.2000 9 35 ( 1665 1fzr_A) ( 96 1aba ) 0.5541 0.7092 9.2392 ( 0 1 10) 0 0.5541 0.7092 9 7 ( 1665 1fzr_A) ( 129 1ahs_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 136 1aiu ) 0.4443 0.4997 7.2084 ( 0 2 6) 0 0.4443 0.4997 9 8 ( 1665 1fzr_A) ( 147 1all_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 150 1aln ) 0.5555 0.6249 3.8639 ( 0 3 10) 0 0.5555 0.6249 9 8 ( 1665 1fzr_A) ( 153 1aly ) 0.4370 0.4370 18.4950 ( 0 1 6) 0 0.4370 0.4370 9 9 ( 1665 1fzr_A) ( 155 1am7_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 157 1amf ) 0.6665 0.3000 3.9260 ( 0 1 15) 0 0.6665 0.3000 9 20 ( 1665 1fzr_A) ( 161 1an8 ) 0.2861 0.2861 10.9544 ( 1 3 6) 0 0.2861 0.2861 9 9 ( 1665 1fzr_A) ( 162 1an8 ) 0.4440 0.4993 8.8899 ( 0 2 6) 0 0.4440 0.4993 9 8 ( 1665 1fzr_A) ( 169 1aoh_A) 0.4444 0.3636 6.0553 ( 0 4 6) 0 0.4444 0.3636 9 11 ( 1665 1fzr_A) ( 177 1aoz_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 191 1aqz_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 198 1at0 ) nil ( 1665 1fzr_A) ( 207 1aua ) 0.6664 0.4615 4.8927 ( 0 1 15) 0 0.6664 0.4615 9 13 ( 1665 1fzr_A) ( 233 1axi_B) nil ( 1665 1fzr_A) ( 259 1b0b ) nil ( 1665 1fzr_A) ( 293 1b5l ) nil ( 1665 1fzr_A) ( 300 1b6a ) 0.3521 0.2412 12.2774 ( 1 4 6) 0 0.3521 0.2412 9 16 ( 1665 1fzr_A) ( 305 1b6r_A) 0.4443 0.2500 7.0783 ( 0 1 6) 0 0.5554 0.3125 9 16 ( 1665 1fzr_A) ( 307 1b74_A) 0.5555 0.6249 3.7300 ( 0 2 10) 0 0.5555 0.6249 9 8 ( 1665 1fzr_A) ( 315 1b8a_A) 0.4440 0.4440 9.0473 ( 0 2 6) 0 0.4440 0.4440 9 9 ( 1665 1fzr_A) ( 317 1b8d_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 329 1b9o_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 340 1bb9 ) nil ( 1665 1fzr_A) ( 350 1bd7_A) 0.4438 0.2353 9.8222 ( 0 3 6) 0 0.4438 0.2353 9 17 ( 1665 1fzr_A) ( 351 1bd8 ) nil ( 1665 1fzr_A) ( 360 1beb_A) 0.4444 0.3636 5.3458 ( 0 2 6) 0 0.4444 0.3636 9 11 ( 1665 1fzr_A) ( 361 1bed ) 0.5550 0.4165 7.3274 ( 0 4 10) 0 0.5550 0.4165 9 12 ( 1665 1fzr_A) ( 365 1bf2 ) 0.4443 0.5708 7.2325 ( 0 4 6) 0 0.4443 0.5708 9 7 ( 1665 1fzr_A) ( 367 1bf2 ) 0.4442 0.3999 7.5957 ( 0 4 6) 0 0.4442 0.3999 9 10 ( 1665 1fzr_A) ( 372 1bfg ) nil ( 1665 1fzr_A) ( 387 1bhg_A) 0.4435 0.4435 10.9514 ( 0 4 6) 0 0.4435 0.4435 9 9 ( 1665 1fzr_A) ( 405 1bih_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 417 1bkf ) 0.4439 0.5695 9.5164 ( 0 3 6) 0 0.4442 0.5704 9 7 ( 1665 1fzr_A) ( 420 1bkz_A) 0.1979 0.1969 14.9450 ( 1 2 6) 0 0.1979 0.1969 9 10 ( 1665 1fzr_A) ( 433 1bo4_A) 0.4443 0.3999 6.7993 ( 0 2 6) 0 0.4443 0.3999 9 10 ( 1665 1fzr_A) ( 442 1bou_B) 0.4444 0.2000 5.4441 ( 0 4 6) 0 0.4444 0.2000 9 20 ( 1665 1fzr_A) ( 460 1btn ) 0.1980 0.1987 6.6633 ( 1 2 6) 1 0.1980 0.1987 9 8 ( 1665 1fzr_A) ( 472 1bup_A) 0.1248 0.1244 18.6720 ( 4 5 6) 0 0.1248 0.1244 9 12 ( 1665 1fzr_A) ( 491 1byf_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 495 1byr_A) 0.5555 0.4167 2.5938 ( 0 1 10) 0 0.6662 0.4999 9 12 ( 1665 1fzr_A) ( 541 1c8b_A) 0.4444 0.2222 5.2259 ( 0 1 6) 0 0.6661 0.3333 9 18 ( 1665 1fzr_A) ( 543 1c8n_A) 0.5553 0.3571 6.1976 ( 0 5 10) 0 0.5554 0.3571 9 14 ( 1665 1fzr_A) ( 553 1cb8_A) 0.1979 0.1867 15.4231 ( 2 4 6) 0 0.1979 0.1867 9 15 ( 1665 1fzr_A) ( 561 1cc8_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 584 1cg2_A) 0.4443 0.2105 6.5586 ( 0 1 6) 0 0.7347 0.3672 9 19 ( 1665 1fzr_A) ( 587 1cgh_A) 0.2862 0.2362 6.8755 ( 2 6 6) 0 0.2862 0.2362 9 15 ( 1665 1fzr_A) ( 609 1cjc_A) 0.5554 0.3571 4.8227 ( 0 1 10) 0 0.5554 0.3571 9 14 ( 1665 1fzr_A) ( 619 1ckm_A) 0.5553 0.2778 6.0962 ( 0 7 10) 0 0.5554 0.3121 9 18 ( 1665 1fzr_A) ( 624 1cl1_A) 0.5555 0.1852 2.7552 ( 0 2 10) 0 0.6666 0.2222 9 27 ( 1665 1fzr_A) ( 635 1cmx_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 672 1cs8_A) 0.1331 0.1275 9.2492 ( 3 4 6) 0 0.1331 0.1275 9 20 ( 1665 1fzr_A) ( 678 1ct9_A) 0.5555 0.2273 3.4680 ( 0 3 10) 0 0.5555 0.2273 9 22 ( 1665 1fzr_A) ( 683 1cuk ) 0.4438 0.6622 9.7620 ( 0 4 6) 0 0.4438 0.6622 9 6 ( 1665 1fzr_A) ( 719 1d0n_A) 0.4444 0.5713 4.7361 ( 0 2 6) 0 0.4444 0.5713 9 7 ( 1665 1fzr_A) ( 729 1d2f_A) 0.5555 0.2381 2.7299 ( 0 3 10) 0 0.5555 0.2381 9 21 ( 1665 1fzr_A) ( 735 1d2p_A) 0.4439 0.4990 9.5509 ( 0 4 6) 0 0.4439 0.4990 9 8 ( 1665 1fzr_A) ( 740 1d3b_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 765 1d7p_M) 0.4437 0.3076 10.4159 ( 0 4 6) 0 0.4437 0.3076 9 13 ( 1665 1fzr_A) ( 767 1d7y_A) 0.4444 0.2667 2.4237 ( 0 1 6) 0 0.5555 0.3333 9 15 ( 1665 1fzr_A) ( 782 1dbh_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 792 1dce_B) nil ( 1665 1fzr_A) ( 795 1dcj_A) 0.5555 0.8329 4.0181 ( 0 2 10) 0 0.5555 0.8329 9 6 ( 1665 1fzr_A) ( 796 1dcp_A) 0.4443 0.6659 6.1848 ( 0 0 6) 0 0.5554 0.8324 9 6 ( 1665 1fzr_A) ( 801 1dcz_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 812 1de4_C) 0.6663 0.4999 5.1657 ( 0 5 15) 0 0.6663 0.4999 9 12 ( 1665 1fzr_A) ( 818 1df7_A) 0.4444 0.3077 4.4295 ( 0 1 6) 0 0.7187 0.5275 9 13 ( 1665 1fzr_A) ( 819 1df9_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 824 1dfc_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 834 1dgs_A) nil ( 1665 1fzr_A) ( 861 1dki_A) 0.4443 0.2353 7.0163 ( 0 3 6) 0 0.4667 0.3339 9 17 ( 1665 1fzr_A) ( 901 1doz_A) 0.5555 0.2381 3.9568 ( 0 2 10) 0 0.5555 0.2381 9 21 ( 1665 1fzr_A) ( 904 1dp7_P) nil ( 1665 1fzr_A) ( 913 1dq3_A) 0.3526 0.3879 6.4833 ( 1 4 6) 0 0.3526 0.3879 9 6 ( 1665 1fzr_A) ( 928 1drk ) 0.5555 0.2381 2.5400 ( 0 2 10) 0 0.5555 0.2696 9 21 ( 1665 1fzr_A) ( 937 1dtj_A) 0.4440 0.6636 8.8376 ( 0 2 6) 0 0.4442 0.6652 9 6 ( 1665 1fzr_A) ( 943 1dus_A) 0.5555 0.3571 3.3580 ( 0 1 10) 0 0.5555 0.3571 9 14 ( 1665 1fzr_A) ( 945 1duv_G) 0.6665 0.4615 4.1140 ( 0 5 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