------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 1724 1g4u_S) ( 25 1a28_A) 0.3660 0.2694 14.3626 ( 1 4 6) 0 0.3660 0.2694 8 14 ( 1724 1g4u_S) ( 41 1a4i_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 51 1a6c_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 62 1a79_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 64 1a7s ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 77 1a8r_A) 0.2462 0.2284 8.6685 ( 2 5 6) 0 0.4201 0.2975 8 13 ( 1724 1g4u_S) ( 91 1aa6 ) 0.4998 0.1143 6.2273 ( 0 3 6) 0 0.4998 0.1143 8 35 ( 1724 1g4u_S) ( 96 1aba ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 129 1ahs_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 136 1aiu ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 147 1all_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 150 1aln ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 153 1aly ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 155 1am7_A) 0.4197 0.4197 11.2084 ( 1 5 6) 0 0.4197 0.4197 8 8 ( 1724 1g4u_S) ( 157 1amf ) 0.1987 0.1682 8.3842 ( 3 6 6) 0 0.1987 0.1682 8 20 ( 1724 1g4u_S) ( 161 1an8 ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 162 1an8 ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 169 1aoh_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 177 1aoz_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 191 1aqz_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 198 1at0 ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 207 1aua ) 0.4186 0.2972 13.8778 ( 1 5 6) 0 0.4186 0.2972 8 13 ( 1724 1g4u_S) ( 233 1axi_B) nil ( 1724 1g4u_S) ( 259 1b0b ) 0.4200 0.4450 9.5018 ( 1 5 6) 0 0.4200 0.4450 8 7 ( 1724 1g4u_S) ( 293 1b5l ) 0.4994 0.6640 8.5973 ( 0 0 6) 0 0.4994 0.6640 8 6 ( 1724 1g4u_S) ( 300 1b6a ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 305 1b6r_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 307 1b74_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 315 1b8a_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 317 1b8d_A) 0.4972 0.4429 12.4634 ( 0 3 6) 0 0.4972 0.4429 8 9 ( 1724 1g4u_S) ( 329 1b9o_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 340 1bb9 ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 350 1bd7_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 351 1bd8 ) 0.4987 0.4437 10.2808 ( 0 0 6) 0 0.4987 0.4437 8 9 ( 1724 1g4u_S) ( 360 1beb_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 361 1bed ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 365 1bf2 ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 367 1bf2 ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 372 1bfg ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 387 1bhg_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 405 1bih_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 417 1bkf ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 420 1bkz_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 433 1bo4_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 442 1bou_B) nil ( 1724 1g4u_S) ( 460 1btn ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 472 1bup_A) 0.1987 0.1940 14.0534 ( 3 6 6) 0 0.1987 0.1940 8 12 ( 1724 1g4u_S) ( 491 1byf_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 495 1byr_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 541 1c8b_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 543 1c8n_A) 0.1497 0.1473 13.2005 ( 2 3 6) 0 0.1497 0.1473 8 14 ( 1724 1g4u_S) ( 553 1cb8_A) 0.4999 0.2667 5.2130 ( 0 1 6) 0 0.6243 0.3333 8 15 ( 1724 1g4u_S) ( 561 1cc8_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 584 1cg2_A) 0.1987 0.1723 10.6877 ( 1 2 6) 0 0.2462 0.1901 8 19 ( 1724 1g4u_S) ( 587 1cgh_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 609 1cjc_A) 0.4996 0.2857 7.4853 ( 0 4 6) 0 0.4996 0.2857 8 14 ( 1724 1g4u_S) ( 619 1ckm_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 624 1cl1_A) 0.2908 0.1460 13.2714 ( 1 3 6) 0 0.4998 0.1481 8 27 ( 1724 1g4u_S) ( 635 1cmx_A) 0.4989 0.3076 9.8693 ( 0 4 6) 0 0.4989 0.3076 8 13 ( 1724 1g4u_S) ( 672 1cs8_A) 0.1249 0.1206 14.5629 ( 4 5 6) 0 0.1249 0.1206 8 20 ( 1724 1g4u_S) ( 678 1ct9_A) 0.4988 0.1818 9.9657 ( 0 1 6) 0 0.4988 0.1818 8 22 ( 1724 1g4u_S) ( 683 1cuk ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 719 1d0n_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 729 1d2f_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 735 1d2p_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 740 1d3b_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 765 1d7p_M) nil ( 1724 1g4u_S) ( 767 1d7y_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 782 1dbh_A) 0.4998 0.2857 6.3567 ( 0 4 6) 0 0.5505 0.4045 8 14 ( 1724 1g4u_S) ( 792 1dce_B) 0.4989 0.2856 9.8361 ( 0 3 6) 0 0.4989 0.2856 8 14 ( 1724 1g4u_S) ( 795 1dcj_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 796 1dcp_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 801 1dcz_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 812 1de4_C) nil ( 1724 1g4u_S) ( 818 1df7_A) 0.4200 0.2975 9.9896 ( 1 5 6) 0 0.4200 0.2975 8 13 ( 1724 1g4u_S) ( 819 1df9_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 824 1dfc_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 834 1dgs_A) 0.4198 0.2974 10.7088 ( 1 5 6) 0 0.4998 0.3077 8 13 ( 1724 1g4u_S) ( 861 1dki_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 901 1doz_A) 0.2908 0.1834 11.9564 ( 2 6 6) 0 0.2908 0.1834 8 21 ( 1724 1g4u_S) ( 904 1dp7_P) nil ( 1724 1g4u_S) ( 913 1dq3_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 928 1drk ) nil ( 1724 1g4u_S) ( 937 1dtj_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 943 1dus_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 945 1duv_G) nil ( 1724 1g4u_S) ( 949 1dv1_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 960 1dx4_A) 0.3669 0.1210 9.0015 ( 1 4 6) 0 0.3669 0.1468 8 33 ( 1724 1g4u_S) ( 978 1dys_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 980 1dz3_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 1005 1e29_A) 0.2462 0.2477 9.4171 ( 2 5 6) 0 0.2462 0.2477 8 7 ( 1724 1g4u_S) ( 1007 1e2t_A) 0.4203 0.2201 7.1498 ( 1 5 6) 0 0.4203 0.2204 8 18 ( 1724 1g4u_S) ( 1008 1e2w_A) nil ( 1724 1g4u_S) ( 1034 1e4f_T) nil ( 1724 1g4u_S) ( 1043 1e5k_A) 0.1987 0.1919 9.7482 ( 3 6 6) 0 0.1987 0.1919 8 13 ( 1724 1g4u_S) ( 1082 1ea5_A) 0.4969 0.1176 12.7550 ( 0 4 6) 0 0.4969 0.1176 8 34 ( 1724 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