------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 2233 1hlb ) ( 25 1a28_A) 0.5706 0.2857 7.8377 ( 0 4 6) 0 0.5706 0.2857 7 14 ( 2233 1hlb ) ( 41 1a4i_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 51 1a6c_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 62 1a79_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 64 1a7s ) nil ( 2233 1hlb ) ( 77 1a8r_A) 0.2944 0.2553 11.2208 ( 2 6 6) 0 0.2944 0.2553 7 13 ( 2233 1hlb ) ( 91 1aa6 ) 0.4866 0.1142 14.8251 ( 1 6 6) 0 0.4866 0.1314 7 35 ( 2233 1hlb ) ( 96 1aba ) nil ( 2233 1hlb ) ( 129 1ahs_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 136 1aiu ) nil ( 2233 1hlb ) ( 147 1all_A) 0.8555 0.7492 5.5246 ( 0 12 15) 0 0.8555 0.7492 7 8 ( 2233 1hlb ) ( 150 1aln ) nil ( 2233 1hlb ) ( 153 1aly ) nil ( 2233 1hlb ) ( 155 1am7_A) 0.6729 0.6025 6.9244 ( 1 10 10) 0 0.6729 0.6025 7 8 ( 2233 1hlb ) ( 157 1amf ) nil ( 2233 1hlb ) ( 161 1an8 ) nil ( 2233 1hlb ) ( 162 1an8 ) nil ( 2233 1hlb ) ( 169 1aoh_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 177 1aoz_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 191 1aqz_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 198 1at0 ) nil ( 2233 1hlb ) ( 207 1aua ) 0.1993 0.1920 5.6842 ( 2 4 6) 0 0.1993 0.1920 7 13 ( 2233 1hlb ) ( 233 1axi_B) nil ( 2233 1hlb ) ( 259 1b0b ) 0.8570 0.8570 3.2228 ( 0 13 15) 0 0.8570 0.8570 7 7 ( 2233 1hlb ) ( 293 1b5l ) nil ( 2233 1hlb ) ( 300 1b6a ) nil ( 2233 1hlb ) ( 305 1b6r_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 307 1b74_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 315 1b8a_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 317 1b8d_A) 0.7921 0.6458 4.2804 ( 1 11 15) 0 0.7921 0.6458 7 9 ( 2233 1hlb ) ( 329 1b9o_A) 0.2477 0.2477 10.5993 ( 2 5 6) 0 0.2477 0.2477 7 7 ( 2233 1hlb ) ( 340 1bb9 ) nil ( 2233 1hlb ) ( 350 1bd7_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 351 1bd8 ) 0.5703 0.4441 8.4376 ( 0 2 6) 0 0.5703 0.4441 7 9 ( 2233 1hlb ) ( 360 1beb_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 361 1bed ) 0.5698 0.3332 9.0940 ( 0 6 6) 0 0.7139 0.4166 7 12 ( 2233 1hlb ) ( 365 1bf2 ) nil ( 2233 1hlb ) ( 367 1bf2 ) nil ( 2233 1hlb ) ( 372 1bfg ) nil ( 2233 1hlb ) ( 387 1bhg_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 405 1bih_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 417 1bkf ) nil ( 2233 1hlb ) ( 420 1bkz_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 433 1bo4_A) 0.5712 0.4000 5.7646 ( 0 5 6) 0 0.5712 0.4000 7 10 ( 2233 1hlb ) ( 442 1bou_B) 0.4443 0.1987 11.6750 ( 1 5 6) 0 0.4443 0.1987 7 20 ( 2233 1hlb ) ( 460 1btn ) nil ( 2233 1hlb ) ( 472 1bup_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 491 1byf_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 495 1byr_A) 0.3787 0.3020 10.5887 ( 1 4 6) 0 0.5703 0.3333 7 12 ( 2233 1hlb ) ( 541 1c8b_A) 0.1992 0.1763 13.2577 ( 2 4 6) 0 0.1992 0.1763 7 18 ( 2233 1hlb ) ( 543 1c8n_A) 0.4910 0.2821 9.1385 ( 1 6 6) 0 0.4910 0.2821 7 14 ( 2233 1hlb ) ( 553 1cb8_A) 0.4453 0.2615 7.8833 ( 1 5 6) 0 0.4453 0.2615 7 15 ( 2233 1hlb ) ( 561 1cc8_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 584 1cg2_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 587 1cgh_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 609 1cjc_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 619 1ckm_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 624 1cl1_A) 0.5695 0.1481 9.5713 ( 0 5 6) 0 0.5695 0.1763 7 27 ( 2233 1hlb ) ( 635 1cmx_A) 0.3786 0.2853 11.1693 ( 1 4 6) 0 0.3786 0.2853 7 13 ( 2233 1hlb ) ( 672 1cs8_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 678 1ct9_A) 0.6547 0.2270 8.3988 ( 1 9 10) 0 0.6553 0.2394 7 22 ( 2233 1hlb ) ( 683 1cuk ) nil ( 2233 1hlb ) ( 719 1d0n_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 729 1d2f_A) 0.2945 0.1834 8.5832 ( 1 3 6) 0 0.2945 0.1834 7 21 ( 2233 1hlb ) ( 735 1d2p_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 740 1d3b_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 765 1d7p_M) nil ( 2233 1hlb ) ( 767 1d7y_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 782 1dbh_A) 0.5661 0.2855 12.3579 ( 0 5 6) 0 0.5661 0.2892 7 14 ( 2233 1hlb ) ( 792 1dce_B) 0.5685 0.2856 10.6234 ( 0 6 6) 0 0.5685 0.2856 7 14 ( 2233 1hlb ) ( 795 1dcj_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 796 1dcp_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 801 1dcz_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 812 1de4_C) nil ( 2233 1hlb ) ( 818 1df7_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 819 1df9_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 824 1dfc_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 834 1dgs_A) 0.5691 0.3076 10.0009 ( 0 6 6) 0 0.7134 0.3846 7 13 ( 2233 1hlb ) ( 861 1dki_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 901 1doz_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 904 1dp7_P) nil ( 2233 1hlb ) ( 913 1dq3_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 928 1drk ) nil ( 2233 1hlb ) ( 937 1dtj_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 943 1dus_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 945 1duv_G) nil ( 2233 1hlb ) ( 949 1dv1_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 960 1dx4_A) 0.5703 0.1212 8.3417 ( 0 6 6) 0 0.5703 0.1891 7 33 ( 2233 1hlb ) ( 978 1dys_A) 0.4450 0.2201 9.3225 ( 1 5 6) 0 0.4450 0.2201 7 18 ( 2233 1hlb ) ( 980 1dz3_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 1005 1e29_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 1007 1e2t_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 1008 1e2w_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 1034 1e4f_T) 0.3789 0.2854 8.5953 ( 1 4 6) 0 0.4454 0.2975 7 13 ( 2233 1hlb ) ( 1043 1e5k_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 1082 1ea5_A) 0.5702 0.1176 8.5325 ( 0 6 6) 0 0.5702 0.1379 7 34 ( 2233 1hlb ) ( 1084 1eaf ) nil ( 2233 1hlb ) ( 1121 1eej_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 1124 1eem_A) 0.5696 0.4990 9.4889 ( 0 5 6) 0 0.5696 0.4990 7 8 ( 2233 1hlb ) ( 1165 1ehy_A) 0.2945 0.1994 10.2764 ( 2 6 6) 0 0.3451 0.2455 7 19 ( 2233 1hlb ) ( 1167 1ei1_A) 0.2477 0.2412 10.7399 ( 2 5 6) 0 0.2477 0.2412 7 10 ( 2233 1hlb ) ( 1169 1ei5_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 1195 1ekm_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 1201 1el5_A) 0.2476 0.1771 14.0329 ( 2 5 6) 0 0.2476 0.1771 7 21 ( 2233 1hlb ) ( 1204 1elj_A) 0.4417 0.1535 15.5364 ( 1 5 6) 0 0.5902 0.1920 7 26 ( 2233 1hlb ) ( 1210 1elw_A) 0.5698 0.5698 9.1262 ( 0 2 6) 0 0.5698 0.5698 7 7 ( 2233 1hlb ) ( 1211 1em2_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 1217 1enf_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 1224 1eo9_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 1233 1ep3_B) nil ( 2233 1hlb ) ( 1267 1euh_A) 0.2474 0.1196 17.3487 ( 2 5 6) 0 0.2474 0.1196 7 33 ( 2233 1hlb ) ( 1268 1eup_A) 0.5696 0.1667 9.4189 ( 0 5 6) 0 0.5696 0.2359 7 24 ( 2233 1hlb ) ( 1294 1ex0_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 1301 1exj_A) 0.4909 0.4909 9.4051 ( 1 6 6) 0 0.4909 0.4909 7 7 ( 2233 1hlb ) ( 1324 1ezg_A) nil ( 2233 1hlb ) ( 1345 1f0i_A) 0.5700 0.2353 8.8774 ( 0 5 6) 0 0.5700 0.2353 7 17 ( 2233 1hlb ) ( 1366 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