------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 259 1b0b ) ( 25 1a28_A) 0.5707 0.2857 7.5770 ( 0 4 6) 0 0.5707 0.2972 7 14 ( 259 1b0b ) ( 41 1a4i_A) nil ( 259 1b0b ) ( 51 1a6c_A) nil ( 259 1b0b ) ( 62 1a79_A) nil ( 259 1b0b ) ( 64 1a7s ) nil ( 259 1b0b ) ( 77 1a8r_A) nil ( 259 1b0b ) ( 91 1aa6 ) 0.5676 0.1143 11.3812 ( 0 3 6) 0 0.5676 0.1348 7 35 ( 259 1b0b ) ( 96 1aba ) nil ( 259 1b0b ) ( 129 1ahs_A) nil ( 259 1b0b ) ( 136 1aiu ) nil ( 259 1b0b ) ( 147 1all_A) 0.8532 0.7480 6.8820 ( 0 11 15) 0 0.8532 0.7480 7 8 ( 259 1b0b ) ( 150 1aln ) nil ( 259 1b0b ) ( 153 1aly ) nil ( 259 1b0b ) ( 155 1am7_A) 0.4911 0.4527 8.7894 ( 1 6 6) 0 0.4911 0.4527 7 8 ( 259 1b0b ) ( 157 1amf ) 0.2477 0.1835 11.7960 ( 2 5 6) 0 0.2477 0.1835 7 20 ( 259 1b0b ) ( 161 1an8 ) nil ( 259 1b0b ) ( 162 1an8 ) nil ( 259 1b0b ) ( 169 1aoh_A) nil ( 259 1b0b ) ( 177 1aoz_A) nil ( 259 1b0b ) ( 191 1aqz_A) nil ( 259 1b0b ) ( 198 1at0 ) nil ( 259 1b0b ) ( 207 1aua ) 0.1664 0.1633 9.4969 ( 3 5 6) 0 0.1664 0.1633 7 13 ( 259 1b0b ) ( 233 1axi_B) nil ( 259 1b0b ) ( 259 1b0b ) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 19 21) 0 1.0000 1.0000 7 7 ( 259 1b0b ) ( 293 1b5l ) 0.2945 0.2970 8.2670 ( 1 3 6) 0 0.2945 0.2970 7 6 ( 259 1b0b ) ( 300 1b6a ) nil ( 259 1b0b ) ( 305 1b6r_A) nil ( 259 1b0b ) ( 307 1b74_A) nil ( 259 1b0b ) ( 315 1b8a_A) nil ( 259 1b0b ) ( 317 1b8d_A) 0.7914 0.6455 5.4255 ( 1 11 15) 0 0.7914 0.6455 7 9 ( 259 1b0b ) ( 329 1b9o_A) 0.2477 0.2477 9.0004 ( 2 5 6) 0 0.2977 0.2977 7 7 ( 259 1b0b ) ( 340 1bb9 ) nil ( 259 1b0b ) ( 350 1bd7_A) nil ( 259 1b0b ) ( 351 1bd8 ) 0.1498 0.1495 12.4546 ( 2 3 6) 0 0.1498 0.1495 7 9 ( 259 1b0b ) ( 360 1beb_A) nil ( 259 1b0b ) ( 361 1bed ) 0.5694 0.3332 9.6708 ( 0 3 6) 0 0.5694 0.3332 7 12 ( 259 1b0b ) ( 365 1bf2 ) nil ( 259 1b0b ) ( 367 1bf2 ) nil ( 259 1b0b ) ( 372 1bfg ) nil ( 259 1b0b ) ( 387 1bhg_A) nil ( 259 1b0b ) ( 405 1bih_A) nil ( 259 1b0b ) ( 417 1bkf ) nil ( 259 1b0b ) ( 420 1bkz_A) nil ( 259 1b0b ) ( 433 1bo4_A) nil ( 259 1b0b ) ( 442 1bou_B) 0.3785 0.1970 11.5369 ( 1 4 6) 0 0.3785 0.1970 7 20 ( 259 1b0b ) ( 460 1btn ) nil ( 259 1b0b ) ( 472 1bup_A) nil ( 259 1b0b ) ( 491 1byf_A) nil ( 259 1b0b ) ( 495 1byr_A) 0.3787 0.3020 10.5276 ( 1 4 6) 0 0.3787 0.3020 7 12 ( 259 1b0b ) ( 541 1c8b_A) nil ( 259 1b0b ) ( 543 1c8n_A) 0.4901 0.2821 11.1282 ( 1 6 6) 0 0.4901 0.2821 7 14 ( 259 1b0b ) ( 553 1cb8_A) 0.5705 0.2666 7.9432 ( 0 3 6) 0 0.5705 0.2666 7 15 ( 259 1b0b ) ( 561 1cc8_A) nil ( 259 1b0b ) ( 584 1cg2_A) nil ( 259 1b0b ) ( 587 1cgh_A) nil ( 259 1b0b ) ( 609 1cjc_A) nil ( 259 1b0b ) ( 619 1ckm_A) nil ( 259 1b0b ) ( 624 1cl1_A) 0.5605 0.1481 14.8918 ( 0 5 6) 0 0.5690 0.1681 7 27 ( 259 1b0b ) ( 635 1cmx_A) 0.1992 0.1919 11.2799 ( 2 4 6) 0 0.1992 0.1919 7 13 ( 259 1b0b ) ( 672 1cs8_A) 0.2477 0.1835 12.8051 ( 2 5 6) 0 0.4454 0.1987 7 20 ( 259 1b0b ) ( 678 1ct9_A) 0.5705 0.1818 7.8767 ( 0 4 6) 0 0.5705 0.2182 7 22 ( 259 1b0b ) ( 683 1cuk ) nil ( 259 1b0b ) ( 719 1d0n_A) nil ( 259 1b0b ) ( 729 1d2f_A) nil ( 259 1b0b ) ( 735 1d2p_A) nil ( 259 1b0b ) ( 740 1d3b_A) nil ( 259 1b0b ) ( 765 1d7p_M) nil ( 259 1b0b ) ( 767 1d7y_A) nil ( 259 1b0b ) ( 782 1dbh_A) 0.5665 0.2856 12.1524 ( 0 5 6) 0 0.6250 0.3533 7 14 ( 259 1b0b ) ( 792 1dce_B) 0.5708 0.2857 7.1405 ( 0 6 6) 0 0.5708 0.3158 7 14 ( 259 1b0b ) ( 795 1dcj_A) nil ( 259 1b0b ) ( 796 1dcp_A) nil ( 259 1b0b ) ( 801 1dcz_A) nil ( 259 1b0b ) ( 812 1de4_C) nil ( 259 1b0b ) ( 818 1df7_A) 0.2944 0.2553 11.9961 ( 2 6 6) 0 0.2944 0.2553 7 13 ( 259 1b0b ) ( 819 1df9_A) nil ( 259 1b0b ) ( 824 1dfc_A) nil ( 259 1b0b ) ( 834 1dgs_A) 0.5709 0.3077 6.8445 ( 0 5 6) 0 0.6305 0.3796 7 13 ( 259 1b0b ) ( 861 1dki_A) nil ( 259 1b0b ) ( 901 1doz_A) 0.4412 0.1894 16.0366 ( 1 5 6) 0 0.4412 0.2190 7 21 ( 259 1b0b ) ( 904 1dp7_P) nil ( 259 1b0b ) ( 913 1dq3_A) nil ( 259 1b0b ) ( 928 1drk ) nil ( 259 1b0b ) ( 937 1dtj_A) nil ( 259 1b0b ) ( 943 1dus_A) nil ( 259 1b0b ) ( 945 1duv_G) 0.4447 0.2974 10.6820 ( 1 5 6) 0 0.4447 0.2974 7 13 ( 259 1b0b ) ( 949 1dv1_A) nil ( 259 1b0b ) ( 960 1dx4_A) 0.5698 0.1212 9.1910 ( 0 5 6) 0 0.6285 0.1515 7 33 ( 259 1b0b ) ( 978 1dys_A) 0.5694 0.2222 9.6280 ( 0 4 6) 0 0.5694 0.2222 7 18 ( 259 1b0b ) ( 980 1dz3_A) nil ( 259 1b0b ) ( 1005 1e29_A) nil ( 259 1b0b ) ( 1007 1e2t_A) 0.2945 0.2081 9.6418 ( 2 6 6) 0 0.2945 0.2081 7 18 ( 259 1b0b ) ( 1008 1e2w_A) nil ( 259 1b0b ) ( 1034 1e4f_T) 0.1664 0.1633 10.8755 ( 3 5 6) 0 0.1664 0.1633 7 13 ( 259 1b0b ) ( 1043 1e5k_A) 0.1664 0.1633 8.6383 ( 3 5 6) 0 0.1664 0.1633 7 13 ( 259 1b0b ) ( 1082 1ea5_A) 0.4904 0.1176 10.7012 ( 1 6 6) 0 0.4904 0.1568 7 34 ( 259 1b0b ) ( 1084 1eaf ) nil ( 259 1b0b ) ( 1121 1eej_A) 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) ( 1388 1f3v_A) 0.5666 0.3631 12.0459 ( 0 5 6) 0 0.5666 0.3631 7 11 ( 259 1b0b ) ( 1395 1f45_B) nil ( 259 1b0b ) ( 1410 1f60_A) nil ( 259 1b0b ) ( 1415 1f68_A) 0.5708 0.6654 7.0820 ( 0 5 6) 0 0.5708 0.6654 7 6 ( 259 1b0b ) ( 1425 1f7d_A) nil ( 259 1b0b ) ( 1435 1f8f_A) nil ( 259 1b0b ) ( 1447 1f9a_A) 0.2477 0.2333 13.1653 ( 2 5 6) 0 0.2477 0.2333 7 12 ( 259 1b0b ) ( 1451 1f9z_A) nil ( 259 1b0b ) ( 1464 1fc6_A) nil ( 259 1b0b ) ( 1470 1fch_A) 0.5707 0.2353 7.6007 ( 0 4 6) 0 0.5707 0.2353 7 17 ( 259 1b0b ) ( 1472 1fcy_A) 0.5711 0.3636 5.9882 ( 0 3 6) 0 0.6300 0.4431 7 11 ( 259 1b0b ) ( 1476 1fdr ) nil ( 259 1b0b ) ( 1481 1feh_A) nil ( 259 1b0b ) ( 1497 1fgj_A) 0.5708 0.1481 7.2347 ( 0 4 6) 0 0.8046 0.2221 7 27 ( 259 1b0b ) ( 1501 1fgy_A) nil ( 259 1b0b ) ( 1508 1fi6_A) nil ( 259 1b0b ) ( 1513 1fj2_A) 0.4904 0.2339 10.7294 ( 1 6 6) 0 0.4904 0.2339 7 17 ( 259 1b0b ) ( 1514 1fj7_A) nil ( 259 1b0b ) ( 1577 1fno_A) nil ( 259 1b0b ) ( 1591 1fob_A) nil ( 259 1b0b ) ( 1595 1fp1_D) nil ( 259 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