------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 1664 1fzp_B) ( 288 1b4a_A) 0.1499 0.1499 10.9585 ( 4 6 6) 0 0.1499 0.1499 6 6 ( 1664 1fzp_B) ( 328 1b9m_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 410 1bja_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 424 1bm9_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 509 1c20_A) 0.2487 0.2462 10.8940 ( 2 5 6) 0 0.2487 0.2462 6 8 ( 1664 1fzp_B) ( 576 1cf7_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 904 1dp7_P) nil ( 1664 1fzp_B) ( 997 1e17_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 1461 1fc3_A) 0.3876 0.3668 10.3537 ( 1 4 6) 0 0.6654 0.4997 6 8 ( 1664 1fzp_B) ( 1576 1fnn_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 1595 1fp1_D) 0.2970 0.2910 8.7059 ( 2 6 6) 0 0.2970 0.2910 6 8 ( 1664 1fzp_B) ( 1597 1fp2_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 1664 1fzp_B) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 12 15) 0 1.0000 1.0000 6 6 ( 1664 1fzp_B) ( 1973 1gvj_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 1999 1gxq_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 2162 1hbx_G) nil ( 1664 1fzp_B) ( 2224 1hkq_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 2278 1hsj_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 2410 1i5z_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 2482 1ig6_A) 0.6619 0.6619 9.9176 ( 0 5 6) 0 0.6619 0.6619 6 6 ( 1664 1fzp_B) ( 2544 1in4_A) 0.3876 0.3787 10.3782 ( 1 4 6) 0 0.4655 0.4445 6 7 ( 1664 1fzp_B) ( 2703 1j1v_A) 0.5270 0.5270 10.5703 ( 1 6 6) 0 0.5270 0.5270 6 6 ( 1664 1fzp_B) ( 2862 1jgs_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 2871 1jhg_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 3237 1ka8_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 3296 1kgs_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 3338 1kkx_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 3438 1ku9_A) 0.2483 0.2458 18.7856 ( 2 5 6) 0 0.2483 0.2458 6 8 ( 1664 1fzp_B) ( 3604 1ldj_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 3639 1lj9_A) 0.3876 0.3668 10.2838 ( 1 4 6) 0 0.3876 0.3668 6 8 ( 1664 1fzp_B) ( 3681 1lnw_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 3746 1lva_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 3748 1lva_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 3934 1mij_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 3960 1mkm_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 4082 1mzb_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 4537 1o7f_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 4697 1okr_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 4714 1omi_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 4745 1opc ) nil ( 1664 1fzp_B) ( 4840 1oyw_A) 0.1996 0.1970 10.7721 ( 2 4 6) 0 0.1996 0.1970 6 10 ( 1664 1fzp_B) ( 4872 1p2f_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 4894 1p4x_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 4895 1p4x_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 4986 1pdn_C) 0.2968 0.2908 11.9387 ( 2 6 6) 0 0.2968 0.2908 6 8 ( 1664 1fzp_B) ( 5074 1pp7_U) 0.4644 0.3664 13.0737 ( 1 5 6) 0 0.4644 0.3664 6 10 ( 1664 1fzp_B) ( 5110 1pue_E) nil ( 1664 1fzp_B) ( 5180 1q1h_A) 0.6460 0.5615 14.5209 ( 0 4 6) 0 0.6460 0.5615 6 7 ( 1664 1fzp_B) ( 5508 1qzz_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 5612 1rep_C) nil ( 1664 1fzp_B) ( 5613 1rep_C) nil ( 1664 1fzp_B) ( 5750 1s29_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 5764 1s3j_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 5776 1s7a_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 5829 1smt_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 5959 1ub9_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 5972 1ucr_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 6025 1uhw_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 6346 1xgs_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 6450 2fok_A) nil ( 1664 1fzp_B) ( 6451 2fok_A) 0.6631 0.3635 9.2211 ( 0 5 6) 0 0.6631 0.3635 6 11 ( 1664 1fzp_B) ( 6476 2hts ) nil ( 1664 1fzp_B) ( 6480 2irf_G) nil -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------