------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 1312 1eyb_A) ( 701 1cx4_A) 0.2754 0.6313 4.2835 ( 2 19 28) 0 0.2754 0.6313 29 12 ( 1312 1eyb_A) ( 702 1cx4_A) 0.2413 0.5754 3.3402 ( 1 12 21) 0 0.2758 0.6647 29 12 ( 1312 1eyb_A) ( 799 1dcs ) 0.2068 0.2604 2.9528 ( 1 9 15) 0 0.3774 0.4722 29 23 ( 1312 1eyb_A) ( 836 1dgw_A) 0.2759 0.5333 2.9322 ( 0 17 28) 0 0.4102 0.7209 29 15 ( 1312 1eyb_A) ( 930 1ds1_A) 0.1656 0.2044 7.2083 ( 3 8 10) 0 0.3383 0.4308 29 22 ( 1312 1eyb_A) ( 1045 1e5s_A) 0.1724 0.3125 4.4269 ( 0 5 10) 0 0.3783 0.6695 29 16 ( 1312 1eyb_A) ( 1230 1ep0_A) 0.1724 0.3333 5.7516 ( 0 7 10) 0 0.3715 0.6630 29 15 ( 1312 1eyb_A) ( 1312 1eyb_A) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 322 406) 0 1.0000 1.0000 29 29 ( 1312 1eyb_A) ( 1505 1fi2_A) 0.3103 0.6428 3.2756 ( 0 19 36) 0 0.3446 0.7052 29 14 ( 1312 1eyb_A) ( 1624 1ft9_A) 0.2758 0.7195 4.0914 ( 1 16 28) 0 0.2758 0.7195 29 11 ( 1312 1eyb_A) ( 1894 1gp6_A) 0.1724 0.2272 10.9700 ( 0 6 10) 0 0.4136 0.5447 29 22 ( 1312 1eyb_A) ( 1946 1gtf_A) 0.1724 0.7140 4.4286 ( 0 6 10) 0 0.2414 0.9998 29 7 ( 1312 1eyb_A) ( 2049 1h2k_A) 0.1724 0.2000 5.9630 ( 0 7 10) 0 0.3255 0.3633 29 25 ( 1312 1eyb_A) ( 2409 1i5z_A) 0.2413 0.6810 3.6284 ( 1 12 21) 0 0.2759 0.7980 29 10 ( 1312 1eyb_A) ( 2477 1ig0_A) 0.2759 0.7999 3.2349 ( 0 11 28) 0 0.2759 0.7999 29 10 ( 1312 1eyb_A) ( 2479 1ig3_A) 0.1615 0.2322 6.2769 ( 3 7 10) 0 0.2757 0.9272 29 8 ( 1312 1eyb_A) ( 2699 1j1l_A) 0.3103 0.3600 4.5263 ( 0 22 36) 0 0.3648 0.3995 29 25 ( 1312 1eyb_A) ( 2735 1j58_A) 0.3103 0.3214 2.8865 ( 0 21 36) 0 0.5746 0.5935 29 28 ( 1312 1eyb_A) ( 3004 1jop_A) 0.2069 0.4999 4.5654 ( 0 8 15) 0 0.3271 0.7467 29 12 ( 1312 1eyb_A) ( 3032 1jr7_A) 0.1680 0.2045 5.7850 ( 2 6 10) 0 0.2984 0.3417 29 23 ( 1312 1eyb_A) ( 3066 1juh_A) 0.2069 0.2308 5.5827 ( 0 8 15) 0 0.5807 0.6444 29 26 ( 1312 1eyb_A) ( 3708 1lrh_A) 0.3425 0.4414 3.2661 ( 8 36 55) 0 0.3448 0.7663 29 13 ( 1312 1eyb_A) ( 3833 1m4o_A) 0.1379 0.3333 7.0623 ( 0 3 6) 0 0.2294 0.4389 29 12 ( 1312 1eyb_A) ( 4207 1ne6_A) 0.2413 0.5331 3.5807 ( 1 12 21) 0 0.2755 0.5983 29 13 ( 1312 1eyb_A) ( 4421 1nx4_A) 0.1724 0.2632 5.4893 ( 0 6 10) 0 0.3690 0.5124 29 19 ( 1312 1eyb_A) ( 4429 1nxm_A) 0.1724 0.3125 5.8603 ( 0 4 10) 0 0.4107 0.6990 29 16 ( 1312 1eyb_A) ( 4484 1o4t_A) 0.3103 0.8178 3.9552 ( 0 21 36) 0 0.3774 0.9025 29 11 ( 1312 1eyb_A) ( 4501 1o5l_A) 0.2413 0.6243 3.5836 ( 1 12 21) 0 0.2414 0.6363 29 11 ( 1312 1eyb_A) ( 4503 1o5u_A) 0.1724 0.4999 5.5124 ( 0 5 10) 0 0.3103 0.8886 29 10 ( 1312 1eyb_A) ( 4536 1o7f_A) 0.2413 0.5331 3.1284 ( 1 12 21) 0 0.2758 0.6141 29 13 ( 1312 1eyb_A) ( 4538 1o7f_A) 0.2413 0.6243 2.8480 ( 1 12 21) 0 0.2759 0.7270 29 11 ( 1312 1eyb_A) ( 4600 1od5_A) 0.2069 0.3750 2.9604 ( 0 5 15) 0 0.3796 0.6873 29 16 ( 1312 1eyb_A) ( 4601 1od5_A) 0.3103 0.5624 4.0190 ( 0 19 36) 0 0.4134 0.7424 29 16 ( 1312 1eyb_A) ( 4606 1odm_A) 0.1724 0.2500 6.0058 ( 0 8 10) 0 0.3701 0.4465 29 20 ( 1312 1eyb_A) ( 4631 1ofn_A) 0.1724 0.2941 5.4362 ( 0 7 10) 0 0.3394 0.5006 29 17 ( 1312 1eyb_A) ( 4671 1oih_A) 0.1724 0.2381 6.7888 ( 0 6 10) 0 0.3383 0.4468 29 21 ( 1312 1eyb_A) ( 4713 1omi_A) 0.2752 0.7070 7.0617 ( 2 18 28) 0 0.2757 0.7625 29 10 ( 1312 1eyb_A) ( 4782 1otj_A) 0.1724 0.2381 7.0923 ( 0 6 10) 0 0.2995 0.3567 29 21 ( 1312 1eyb_A) ( 5002 1pg6_A) 0.2412 0.3176 4.0223 ( 1 11 21) 0 0.4657 0.5781 29 22 ( 1312 1eyb_A) ( 5054 1pmi ) 0.2300 0.2285 5.5964 ( 35 81 136) 0 0.6051 0.5080 29 35 ( 1312 1eyb_A) ( 5193 1q3e_A) 0.2402 0.4175 3.0400 ( 2 13 21) 0 0.2755 0.4937 29 16 ( 1312 1eyb_A) ( 5480 1qwr_A) 0.2414 0.2500 2.3779 ( 0 11 21) 0 0.4133 0.4279 29 28 ( 1312 1eyb_A) ( 5489 1qxr_A) 0.2069 0.4286 1.9697 ( 0 5 15) 0 0.2714 0.4998 29 14 ( 1312 1eyb_A) ( 5604 1rc6_A) 0.1724 0.2381 5.8161 ( 0 1 10) 0 0.4424 0.5920 29 21 ( 1312 1eyb_A) ( 5840 1sq4_A) 0.3103 0.4737 4.1630 ( 0 22 36) 0 0.4089 0.4749 29 19 ( 1312 1eyb_A) ( 5856 1su4_A) 0.2069 0.9993 3.6479 ( 0 8 15) 0 0.2069 0.9993 29 6 ( 1312 1eyb_A) ( 6277 1vj2_A) 0.3443 0.8544 3.6009 ( 2 25 45) 0 0.3741 0.9056 29 11 ( 1312 1eyb_A) ( 6395 2arc_A) 0.3445 0.7502 2.6473 ( 2 27 45) 0 0.3448 0.7662 29 13 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------