------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 1487 1ff9_A) ( 42 1a4i_A) 0.4000 0.5998 5.3055 ( 0 1 15) 0 0.5999 0.8992 15 10 ( 1487 1ff9_A) ( 265 1b16_A) 0.8657 0.8118 4.7967 ( 0 39 78) 0 0.8657 0.8118 15 16 ( 1487 1ff9_A) ( 312 1b7g_O) 0.6666 0.7690 3.7974 ( 0 26 45) 0 0.7321 0.8437 15 13 ( 1487 1ff9_A) ( 319 1b8p_A) 0.7323 0.9951 3.8820 ( 1 28 55) 0 0.7329 0.9978 15 11 ( 1487 1ff9_A) ( 352 1bdb ) 0.8659 0.7219 4.5586 ( 0 39 78) 0 0.8659 0.7219 15 18 ( 1487 1ff9_A) ( 377 1bg6 ) 0.4545 0.4458 5.2319 ( 11 51 78) 0 0.6656 0.5551 15 18 ( 1487 1ff9_A) ( 506 1c1d_A) 0.3333 0.4166 4.4222 ( 0 2 10) 0 0.5498 0.6658 15 12 ( 1487 1ff9_A) ( 707 1cyd_A) 0.8657 0.7218 4.8199 ( 0 35 78) 0 0.8657 0.7218 15 18 ( 1487 1ff9_A) ( 781 1db3_A) 0.8650 0.5907 4.9282 ( 1 39 78) 0 0.8650 0.5907 15 22 ( 1487 1ff9_A) ( 847 1dih ) 0.4667 0.9999 2.1999 ( 0 6 21) 0 0.4667 0.9999 15 7 ( 1487 1ff9_A) ( 873 1dlj_A) 0.8462 0.7975 5.2977 ( 3 47 78) 0 0.8462 0.7975 15 16 ( 1487 1ff9_A) ( 906 1dpg_A) 0.7920 0.9070 4.2146 ( 2 36 66) 0 0.7983 0.9195 15 13 ( 1487 1ff9_A) ( 972 1dxy ) 0.4000 0.3750 5.3678 ( 0 4 15) 0 0.7971 0.7479 15 16 ( 1487 1ff9_A) ( 1053 1e6u_A) 0.7314 0.4997 4.5290 ( 1 24 55) 0 0.7314 0.5192 15 22 ( 1487 1ff9_A) ( 1071 1e7w_A) 0.7997 0.7057 4.0405 ( 0 29 66) 0 0.8649 0.7638 15 17 ( 1487 1ff9_A) ( 1094 1ebf_A) 0.5998 0.7495 4.9289 ( 0 11 36) 0 0.5998 0.7495 15 12 ( 1487 1ff9_A) ( 1117 1edz_A) 0.6000 0.7500 2.3221 ( 0 19 36) 0 0.6000 0.7500 15 12 ( 1487 1ff9_A) ( 1189 1ek6_A) 0.8658 0.5908 4.6326 ( 0 40 78) 0 0.8658 0.6241 15 22 ( 1487 1ff9_A) ( 1219 1enp ) 0.8657 0.7218 4.7900 ( 0 44 78) 0 0.8657 0.7218 15 18 ( 1487 1ff9_A) ( 1221 1eny ) 0.8655 0.7641 4.5486 ( 1 44 78) 0 0.8655 0.7641 15 17 ( 1487 1ff9_A) ( 1242 1eq2_A) 0.7990 0.5453 4.2039 ( 1 34 66) 0 0.8646 0.5906 15 22 ( 1487 1ff9_A) ( 1355 1f14_A) 0.7435 0.7435 4.8373 ( 4 42 66) 0 0.7435 0.7435 15 15 ( 1487 1ff9_A) ( 1436 1f8f_A) 0.3999 0.4284 7.7927 ( 0 8 15) 0 0.8651 0.9264 15 14 ( 1487 1ff9_A) ( 1487 1ff9_A) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 76 105) 0 1.0000 1.0000 15 15 ( 1487 1ff9_A) ( 1531 1fjh_A) 0.5904 0.5663 4.9838 ( 2 15 45) 0 0.7325 0.6869 15 16 ( 1487 1ff9_A) ( 1560 1fmc_A) 0.7996 0.7057 4.0918 ( 0 28 66) 0 0.8530 0.7573 15 17 ( 1487 1ff9_A) ( 1804 1gdh_A) 0.4666 0.4999 4.9529 ( 0 9 21) 0 0.7874 0.8396 15 14 ( 1487 1ff9_A) ( 1807 1gee_A) 0.8658 0.6498 4.6074 ( 0 40 78) 0 0.8658 0.6498 15 20 ( 1487 1ff9_A) ( 1809 1geg_A) 0.8653 0.7640 4.7555 ( 1 41 78) 0 0.8653 0.7640 15 17 ( 1487 1ff9_A) ( 1899 1gpj_A) 0.4667 0.5833 3.3618 ( 0 10 21) 0 0.7318 0.9120 15 12 ( 1487 1ff9_A) ( 1922 1gr0_A) 0.7331 0.7855 3.8848 ( 0 24 55) 0 0.7331 0.7855 15 14 ( 1487 1ff9_A) ( 1948 1gtm_A) 0.5323 0.4992 3.4948 ( 1 18 28) 0 0.6639 0.6230 15 16 ( 1487 1ff9_A) ( 1956 1gu7_A) 0.5333 0.4706 2.6417 ( 0 16 28) 0 0.7990 0.7054 15 17 ( 1487 1ff9_A) ( 2004 1gy8_A) 0.8655 0.5651 5.0531 ( 0 43 78) 0 0.8655 0.5651 15 23 ( 1487 1ff9_A) ( 2016 1gz3_A) 0.4666 0.4117 4.4654 ( 0 4 21) 0 0.7331 0.6469 15 17 ( 1487 1ff9_A) ( 2017 1gz6_A) 0.8654 0.6497 5.1113 ( 0 37 78) 0 0.8654 0.6497 15 20 ( 1487 1ff9_A) ( 2046 1h2b_A) 0.4000 0.4286 3.6917 ( 0 7 15) 0 0.8655 0.9270 15 14 ( 1487 1ff9_A) ( 2090 1h5q_A) 0.8657 0.6498 4.7550 ( 0 39 78) 0 0.8657 0.6498 15 20 ( 1487 1ff9_A) ( 2095 1h6d_A) 0.7310 0.7824 3.2610 ( 1 22 55) 0 0.7317 0.7835 15 14 ( 1487 1ff9_A) ( 2180 1hdc_A) 0.8659 0.7643 4.4490 ( 0 38 78) 0 0.8659 0.7643 15 17 ( 1487 1ff9_A) ( 2189 1hdo_A) 0.7994 0.7994 4.6627 ( 0 35 66) 0 0.7994 0.7994 15 15 ( 1487 1ff9_A) ( 2194 1het_A) 0.5333 0.5333 2.1640 ( 0 11 28) 0 0.7309 0.7309 15 15 ( 1487 1ff9_A) ( 2270 1hrd_A) 0.4666 0.4375 4.0366 ( 0 10 21) 0 0.5999 0.5624 15 16 ( 1487 1ff9_A) ( 2309 1hwx_A) 0.3671 0.3339 3.7566 ( 1 5 15) 0 0.6643 0.5869 15 17 ( 1487 1ff9_A) ( 2316 1hxh_A) 0.8654 0.8116 4.3887 ( 1 38 78) 0 0.8654 0.8116 15 16 ( 1487 1ff9_A) ( 2328 1hye_A) 0.7330 0.9986 4.4030 ( 0 29 55) 0 0.7330 0.9986 15 11 ( 1487 1ff9_A) ( 2330 1hyh_A) 0.7216 0.9494 4.1902 ( 2 29 55) 0 0.7322 0.9946 15 11 ( 1487 1ff9_A) ( 2368 1i24_A) 0.9323 0.5185 4.4352 ( 0 49 91) 0 0.9323 0.5185 15 27 ( 1487 1ff9_A) ( 2376 1i36_A) 0.7080 0.7080 5.5284 ( 4 36 66) 0 0.7214 0.7214 15 15 ( 1487 1ff9_A) ( 2463 1id1_A) 0.7324 0.8442 3.3189 ( 1 28 55) 0 0.7331 0.8458 15 13 ( 1487 1ff9_A) ( 2615 1iuk_A) 0.5819 0.7001 3.7284 ( 1 10 36) 0 0.6637 0.8245 15 12 ( 1487 1ff9_A) ( 2657 1iy8_A) 0.8658 0.7642 4.6278 ( 0 37 78) 0 0.8658 0.7642 15 17 ( 1487 1ff9_A) ( 2674 1iz0_A) 0.5333 0.5333 3.6760 ( 0 9 28) 0 0.8660 0.8660 15 15 ( 1487 1ff9_A) ( 2725 1j3v_A) 0.7327 0.7848 3.9064 ( 1 33 55) 0 0.7327 0.7848 15 14 ( 1487 1ff9_A) ( 2736 1j5p_A) 0.6000 0.8999 2.6704 ( 0 12 36) 0 0.6000 0.8999 15 10 ( 1487 1ff9_A) ( 2781 1ja9_A) 0.8659 0.7643 4.5534 ( 0 39 78) 0 0.8659 0.7643 15 17 ( 1487 1ff9_A) ( 2789 1jax_A) 0.7955 0.5989 4.2287 ( 2 42 66) 0 0.7955 0.5989 15 20 ( 1487 1ff9_A) ( 3017 1jqb_A) 0.5333 0.5333 2.5030 ( 0 12 28) 0 0.7994 0.7994 15 15 ( 1487 1ff9_A) ( 3059 1jtv_A) 0.8657 0.7218 4.7440 ( 0 42 78) 0 0.8657 0.7218 15 18 ( 1487 1ff9_A) ( 3072 1jvb_A) 0.3999 0.4613 7.6236 ( 0 8 15) 0 0.7995 0.9220 15 13 ( 1487 1ff9_A) ( 3144 1k2w_A) 0.8659 0.7643 4.4949 ( 0 41 78) 0 0.8659 0.7643 15 17 ( 1487 1ff9_A) ( 3192 1k6j_A) 0.8657 0.5416 3.8139 ( 1 39 78) 0 0.9450 0.6191 15 24 ( 1487 1ff9_A) ( 3257 1kbz_A) 0.7981 0.6310 4.6127 ( 1 28 66) 0 0.7981 0.6310 15 19 ( 1487 1ff9_A) ( 3385 1kol_A) 0.4000 0.3750 3.3711 ( 0 5 15) 0 0.8654 0.8116 15 16 ( 1487 1ff9_A) ( 3414 1ks9_A) 0.4244 0.4191 5.8883 ( 9 39 66) 0 0.5999 0.5294 15 17 ( 1487 1ff9_A) ( 3481 1kyq_A) 0.4667 0.7000 2.1096 ( 0 5 21) 0 0.5333 0.7998 15 10 ( 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