------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 1807 1gee_A) ( 42 1a4i_A) 0.2500 0.4999 5.2875 ( 0 2 10) 0 0.4000 0.7997 20 10 ( 1807 1gee_A) ( 265 1b16_A) 0.7499 0.9372 2.7391 ( 1 59 105) 0 0.7499 0.9372 20 16 ( 1807 1gee_A) ( 312 1b7g_O) 0.5000 0.7689 4.1499 ( 0 19 45) 0 0.5497 0.8439 20 13 ( 1807 1gee_A) ( 319 1b8p_A) 0.5499 0.9975 5.0771 ( 0 26 55) 0 0.5499 0.9975 20 11 ( 1807 1gee_A) ( 352 1bdb ) 0.8397 0.9273 4.1089 ( 5 91 136) 0 0.8397 0.9273 20 18 ( 1807 1gee_A) ( 377 1bg6 ) 0.4492 0.4987 5.5523 ( 1 16 36) 0 0.5000 0.5555 20 18 ( 1807 1gee_A) ( 506 1c1d_A) 0.3000 0.4999 5.9061 ( 0 1 15) 0 0.4667 0.7485 20 12 ( 1807 1gee_A) ( 707 1cyd_A) 0.8985 0.9975 2.3227 ( 3 96 153) 0 0.8985 0.9975 20 18 ( 1807 1gee_A) ( 781 1db3_A) 0.6499 0.5908 2.4560 ( 1 41 78) 0 0.6499 0.5908 20 22 ( 1807 1gee_A) ( 847 1dih ) 0.3500 0.9992 3.8263 ( 0 3 21) 0 0.3500 0.9993 20 7 ( 1807 1gee_A) ( 873 1dlj_A) 0.3791 0.3858 5.3550 ( 11 43 78) 0 0.5972 0.7416 20 16 ( 1807 1gee_A) ( 906 1dpg_A) 0.5999 0.9222 4.2587 ( 0 33 66) 0 0.5999 0.9222 20 13 ( 1807 1gee_A) ( 972 1dxy ) 0.3000 0.3750 3.4353 ( 0 7 15) 0 0.5967 0.7403 20 16 ( 1807 1gee_A) ( 1053 1e6u_A) 0.4094 0.4022 4.6865 ( 11 47 78) 0 0.6044 0.5610 20 22 ( 1807 1gee_A) ( 1071 1e7w_A) 0.8486 0.9968 1.4979 ( 3 89 136) 0 0.8486 0.9968 20 17 ( 1807 1gee_A) ( 1094 1ebf_A) 0.3000 0.4997 7.0681 ( 0 1 15) 0 0.4907 0.7405 20 12 ( 1807 1gee_A) ( 1117 1edz_A) 0.3000 0.5000 3.8154 ( 0 2 15) 0 0.4431 0.6785 20 12 ( 1807 1gee_A) ( 1189 1ek6_A) 0.6931 0.6320 3.7248 ( 3 47 91) 0 0.6931 0.6320 20 22 ( 1807 1gee_A) ( 1219 1enp ) 0.8498 0.9442 3.0434 ( 1 92 136) 0 0.8498 0.9442 20 18 ( 1807 1gee_A) ( 1221 1eny ) 0.8482 0.9960 2.9866 ( 3 86 136) 0 0.8482 0.9960 20 17 ( 1807 1gee_A) ( 1242 1eq2_A) 0.6633 0.6126 3.5351 ( 5 50 91) 0 0.6633 0.6126 20 22 ( 1807 1gee_A) ( 1355 1f14_A) 0.2811 0.2835 5.1587 ( 13 37 66) 0 0.5346 0.6767 20 15 ( 1807 1gee_A) ( 1436 1f8f_A) 0.4000 0.5714 3.0739 ( 0 9 28) 0 0.5997 0.8556 20 14 ( 1807 1gee_A) ( 1487 1ff9_A) 0.6498 0.8658 4.6074 ( 0 40 78) 0 0.6498 0.8658 20 15 ( 1807 1gee_A) ( 1531 1fjh_A) 0.6500 0.8124 2.7351 ( 0 44 78) 0 0.6974 0.8670 20 16 ( 1807 1gee_A) ( 1560 1fmc_A) 0.8353 0.9681 1.3720 ( 5 82 136) 0 0.8353 0.9681 20 17 ( 1807 1gee_A) ( 1804 1gdh_A) 0.5448 0.7571 5.1040 ( 2 25 55) 0 0.5998 0.8559 20 14 ( 1807 1gee_A) ( 1807 1gee_A) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 144 190) 0 1.0000 1.0000 20 20 ( 1807 1gee_A) ( 1809 1geg_A) 0.8443 0.9874 2.3446 ( 4 84 136) 0 0.8443 0.9874 20 17 ( 1807 1gee_A) ( 1899 1gpj_A) 0.3000 0.5000 2.9618 ( 0 5 15) 0 0.5499 0.9152 20 12 ( 1807 1gee_A) ( 1922 1gr0_A) 0.5491 0.7804 5.0064 ( 1 20 55) 0 0.5492 0.7811 20 14 ( 1807 1gee_A) ( 1948 1gtm_A) 0.3000 0.3750 5.3165 ( 0 3 15) 0 0.5292 0.6247 20 16 ( 1807 1gee_A) ( 1956 1gu7_A) 0.3500 0.4117 4.6408 ( 0 7 21) 0 0.5961 0.6972 20 17 ( 1807 1gee_A) ( 2004 1gy8_A) 0.5000 0.4348 3.1430 ( 0 19 45) 0 0.6233 0.5660 20 23 ( 1807 1gee_A) ( 2016 1gz3_A) 0.3500 0.4117 4.4980 ( 0 5 21) 0 0.5498 0.6467 20 17 ( 1807 1gee_A) ( 2017 1gz6_A) 0.7490 0.7490 1.8212 ( 2 55 105) 0 0.7799 0.7799 20 20 ( 1807 1gee_A) ( 2046 1h2b_A) 0.3999 0.5710 6.4285 ( 0 5 28) 0 0.5998 0.8559 20 14 ( 1807 1gee_A) ( 2090 1h5q_A) 0.8998 0.8998 1.6936 ( 2 101 153) 0 0.8998 0.8998 20 20 ( 1807 1gee_A) ( 2095 1h6d_A) 0.5499 0.7850 4.9572 ( 0 22 55) 0 0.5995 0.8543 20 14 ( 1807 1gee_A) ( 2180 1hdc_A) 0.8000 0.9411 1.7824 ( 0 68 120) 0 0.8000 0.9411 20 17 ( 1807 1gee_A) ( 2189 1hdo_A) 0.6000 0.7999 2.9901 ( 0 34 66) 0 0.6000 0.7999 20 15 ( 1807 1gee_A) ( 2194 1het_A) 0.4000 0.5333 2.9001 ( 0 10 28) 0 0.5998 0.7990 20 15 ( 1807 1gee_A) ( 2270 1hrd_A) 0.3500 0.4375 5.3245 ( 0 6 21) 0 0.4999 0.6248 20 16 ( 1807 1gee_A) ( 2309 1hwx_A) 0.2500 0.2941 2.5595 ( 0 2 10) 0 0.4715 0.5309 20 17 ( 1807 1gee_A) ( 2316 1hxh_A) 0.7993 0.9979 1.8711 ( 2 66 120) 0 0.7993 0.9979 20 16 ( 1807 1gee_A) ( 2328 1hye_A) 0.5499 0.9974 5.1049 ( 0 26 55) 0 0.5499 0.9974 20 11 ( 1807 1gee_A) ( 2330 1hyh_A) 0.5496 0.9919 5.2145 ( 1 26 55) 0 0.5499 0.9973 20 11 ( 1807 1gee_A) ( 2368 1i24_A) 0.6499 0.4815 4.0222 ( 0 41 78) 0 0.6981 0.5181 20 27 ( 1807 1gee_A) ( 2376 1i36_A) 0.3398 0.3619 5.0434 ( 4 15 36) 0 0.4014 0.4662 20 15 ( 1807 1gee_A) ( 2463 1id1_A) 0.5500 0.8458 3.7356 ( 0 26 55) 0 0.5500 0.8458 20 13 ( 1807 1gee_A) ( 2615 1iuk_A) 0.4500 0.7495 4.7519 ( 0 16 36) 0 0.5494 0.9095 20 12 ( 1807 1gee_A) ( 2657 1iy8_A) 0.8495 0.9989 1.5685 ( 2 78 136) 0 0.8495 0.9989 20 17 ( 1807 1gee_A) ( 2674 1iz0_A) 0.3999 0.5330 6.6075 ( 0 4 28) 0 0.5998 0.7993 20 15 ( 1807 1gee_A) ( 2725 1j3v_A) 0.3000 0.4286 3.5883 ( 0 4 15) 0 0.5728 0.7808 20 14 ( 1807 1gee_A) ( 2736 1j5p_A) 0.4500 0.8991 4.4943 ( 0 11 36) 0 0.4997 0.9906 20 10 ( 1807 1gee_A) ( 2781 1ja9_A) 0.8377 0.9732 2.3893 ( 5 86 136) 0 0.8377 0.9732 20 17 ( 1807 1gee_A) ( 2789 1jax_A) 0.2801 0.2801 6.9725 ( 3 9 28) 0 0.5232 0.5232 20 20 ( 1807 1gee_A) ( 3017 1jqb_A) 0.4000 0.5333 3.1022 ( 0 11 28) 0 0.5500 0.7332 20 15 ( 1807 1gee_A) ( 3059 1jtv_A) 0.7499 0.8332 2.7317 ( 1 62 105) 0 0.7499 0.8332 20 18 ( 1807 1gee_A) ( 3072 1jvb_A) 0.3999 0.6148 6.5275 ( 0 5 28) 0 0.5499 0.8455 20 13 ( 1807 1gee_A) ( 3144 1k2w_A) 0.8392 0.9763 2.8439 ( 5 89 136) 0 0.8392 0.9763 20 17 ( 1807 1gee_A) ( 3192 1k6j_A) 0.6998 0.5833 3.1734 ( 1 45 91) 0 0.6998 0.5833 20 24 ( 1807 1gee_A) ( 3257 1kbz_A) 0.5000 0.5263 3.7660 ( 0 19 45) 0 0.5489 0.5776 20 19 ( 1807 1gee_A) ( 3385 1kol_A) 0.3500 0.4375 3.4533 ( 0 7 21) 0 0.5998 0.7495 20 16 ( 1807 1gee_A) ( 3414 1ks9_A) 0.2631 0.2669 4.9017 ( 7 19 36) 0 0.5196 0.5858 20 17 ( 1807 1gee_A) ( 3481 1kyq_A) 0.3962 0.7086 3.1280 ( 1 9 28) 0 0.4000 0.7996 20 10 ( 1807 1gee_A) ( 3561 1l7d_A) 0.3500 0.4667 3.5850 ( 0 7 21) 0 0.4999 0.6664 20 15 ( 1807 1gee_A) ( 3593 1lc0_A) 0.4990 0.8211 4.6116 ( 1 17 45) 0 0.5991 0.9884 20 12 ( 1807 1gee_A) ( 3606 1ldn_A) 0.5496 0.9118 4.8863 ( 1 26 55) 0 0.5497 0.9125 20 12 ( 1807 1gee_A) ( 3610 1leh_A) 0.4291 0.5702 7.3819 ( 3 20 36) 0 0.4995 0.7653 20 13 ( 1807 1gee_A) ( 3633 1li4_A) 0.3000 0.4615 4.5878 ( 0 4 15) 0 0.4999 0.7687 20 13 ( 1807 1gee_A) ( 3637 1lj8_A) 0.5499 0.5499 4.9005 ( 0 26 55) 0 0.5638 0.5638 20 20 ( 1807 1gee_A) ( 3677 1lnq_A) 0.5983 0.6638 5.2013 ( 2 38 66) 0 0.6293 0.6886 20 18 ( 1807 1gee_A) ( 3722 1lss_A) 0.5980 0.9754 5.0197 ( 2 36 66) 0 0.5995 0.9942 20 12 ( 1807 1gee_A) ( 3724 1lsu_A) 0.5500 0.9162 3.7202 ( 0 26 55) 0 0.5500 0.9162 20 12 ( 1807 1gee_A) ( 3734 1lu9_A) 0.3500 0.5000 2.7223 ( 0 6 21) 0 0.5500 0.7855 20 14 ( 1807 1gee_A) ( 3854 1m66_A) 0.3000 0.3750 5.5420 ( 0 9 15) 0 0.5992 0.7477 20 16 ( 1807 1gee_A) ( 4047 1mv8_A) 0.4115 0.4198 5.5551 ( 10 43 78) 0 0.5995 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