------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 2463 1id1_A) ( 42 1a4i_A) 0.4614 0.5997 5.8156 ( 0 7 15) 0 0.6071 0.7711 13 10 ( 2463 1id1_A) ( 265 1b16_A) 0.8459 0.6874 3.6573 ( 0 26 55) 0 0.8459 0.6874 13 16 ( 2463 1id1_A) ( 312 1b7g_O) 0.7682 0.7682 5.6875 ( 0 24 45) 0 0.7691 0.7691 13 13 ( 2463 1id1_A) ( 319 1b8p_A) 0.8444 0.9960 3.9617 ( 1 30 55) 0 0.8444 0.9960 13 11 ( 2463 1id1_A) ( 352 1bdb ) 0.9213 0.6663 3.8752 ( 1 34 66) 0 0.9213 0.6663 13 18 ( 2463 1id1_A) ( 377 1bg6 ) 0.8317 0.6082 4.0004 ( 2 33 55) 0 0.8317 0.6082 13 18 ( 2463 1id1_A) ( 506 1c1d_A) 0.5384 0.5833 3.8421 ( 0 8 21) 0 0.6148 0.6658 13 12 ( 2463 1id1_A) ( 707 1cyd_A) 0.8457 0.6110 3.9586 ( 0 21 55) 0 0.8459 0.6111 13 18 ( 2463 1id1_A) ( 781 1db3_A) 0.8426 0.4997 3.6896 ( 1 24 55) 0 0.8426 0.4997 13 22 ( 2463 1id1_A) ( 847 1dih ) 0.5384 0.9996 3.1872 ( 0 6 21) 0 0.5384 0.9996 13 7 ( 2463 1id1_A) ( 873 1dlj_A) 0.8320 0.6824 2.8165 ( 2 33 55) 0 0.8328 0.6827 13 16 ( 2463 1id1_A) ( 906 1dpg_A) 0.8459 0.8459 3.6296 ( 0 31 55) 0 0.8459 0.8459 13 13 ( 2463 1id1_A) ( 972 1dxy ) 0.4615 0.3750 5.5315 ( 0 4 15) 0 0.8224 0.6788 13 16 ( 2463 1id1_A) ( 1053 1e6u_A) 0.5224 0.3169 4.2615 ( 1 9 21) 0 0.8437 0.4998 13 22 ( 2463 1id1_A) ( 1071 1e7w_A) 0.9204 0.7052 4.2957 ( 1 31 66) 0 0.9204 0.7052 13 17 ( 2463 1id1_A) ( 1094 1ebf_A) 0.3846 0.4167 3.6336 ( 0 3 10) 0 0.5383 0.5831 13 12 ( 2463 1id1_A) ( 1117 1edz_A) 0.6152 0.6663 5.0537 ( 0 18 28) 0 0.6419 0.6792 13 12 ( 2463 1id1_A) ( 1189 1ek6_A) 0.8458 0.5000 3.8520 ( 0 28 55) 0 0.8458 0.5000 13 22 ( 2463 1id1_A) ( 1219 1enp ) 0.8459 0.6111 3.4654 ( 0 28 55) 0 0.8459 0.6111 13 18 ( 2463 1id1_A) ( 1221 1eny ) 0.8459 0.6470 3.3948 ( 0 29 55) 0 0.8459 0.6554 13 17 ( 2463 1id1_A) ( 1242 1eq2_A) 0.8066 0.4968 3.5930 ( 2 25 55) 0 0.8445 0.5244 13 22 ( 2463 1id1_A) ( 1355 1f14_A) 0.8450 0.7328 3.5006 ( 1 33 55) 0 0.8450 0.7328 13 15 ( 2463 1id1_A) ( 1436 1f8f_A) 0.7692 0.7143 2.5882 ( 0 18 45) 0 0.7692 0.7143 13 14 ( 2463 1id1_A) ( 1487 1ff9_A) 0.8442 0.7324 3.3189 ( 1 28 55) 0 0.8458 0.7331 13 15 ( 2463 1id1_A) ( 1531 1fjh_A) 0.6920 0.5624 4.7565 ( 0 12 36) 0 0.8318 0.6823 13 16 ( 2463 1id1_A) ( 1560 1fmc_A) 0.9204 0.7052 4.3554 ( 1 31 66) 0 0.9204 0.7052 13 17 ( 2463 1id1_A) ( 1804 1gdh_A) 0.6119 0.5690 4.4882 ( 1 16 28) 0 0.8192 0.7667 13 14 ( 2463 1id1_A) ( 1807 1gee_A) 0.8458 0.5500 3.7356 ( 0 26 55) 0 0.8458 0.5500 13 20 ( 2463 1id1_A) ( 1809 1geg_A) 0.9210 0.7053 4.2900 ( 1 34 66) 0 0.9210 0.7053 13 17 ( 2463 1id1_A) ( 1899 1gpj_A) 0.7782 0.8218 4.0174 ( 3 32 55) 0 0.7782 0.8332 13 12 ( 2463 1id1_A) ( 1922 1gr0_A) 0.6922 0.6428 3.8657 ( 0 17 36) 0 0.7684 0.7137 13 14 ( 2463 1id1_A) ( 1948 1gtm_A) 0.6818 0.5587 5.5322 ( 1 14 36) 0 0.7281 0.6093 13 16 ( 2463 1id1_A) ( 1956 1gu7_A) 0.5001 0.4744 3.7832 ( 6 31 55) 0 0.7691 0.5882 13 17 ( 2463 1id1_A) ( 2004 1gy8_A) 0.8430 0.4781 3.8585 ( 1 25 55) 0 0.8449 0.4782 13 23 ( 2463 1id1_A) ( 2016 1gz3_A) 0.7649 0.5871 3.5707 ( 1 20 45) 0 0.7672 0.6178 13 17 ( 2463 1id1_A) ( 2017 1gz6_A) 0.8457 0.5499 4.0930 ( 0 21 55) 0 0.8457 0.5500 13 20 ( 2463 1id1_A) ( 2046 1h2b_A) 0.7692 0.7142 2.8501 ( 0 20 45) 0 0.7692 0.7142 13 14 ( 2463 1id1_A) ( 2090 1h5q_A) 0.8458 0.5500 3.7184 ( 0 25 55) 0 0.8458 0.5500 13 20 ( 2463 1id1_A) ( 2095 1h6d_A) 0.7690 0.7141 3.9567 ( 0 20 45) 0 0.7690 0.7141 13 14 ( 2463 1id1_A) ( 2180 1hdc_A) 0.8459 0.6470 3.3873 ( 0 24 55) 0 0.8459 0.6470 13 17 ( 2463 1id1_A) ( 2189 1hdo_A) 0.7668 0.6655 2.8266 ( 1 23 45) 0 0.8420 0.7313 13 15 ( 2463 1id1_A) ( 2194 1het_A) 0.8222 0.7213 5.1874 ( 2 29 55) 0 0.8222 0.7213 13 15 ( 2463 1id1_A) ( 2270 1hrd_A) 0.5854 0.5486 4.8297 ( 4 25 55) 0 0.6914 0.5622 13 16 ( 2463 1id1_A) ( 2309 1hwx_A) 0.3846 0.2941 2.8225 ( 0 4 10) 0 0.6917 0.5293 13 17 ( 2463 1id1_A) ( 2316 1hxh_A) 0.8459 0.6874 3.5759 ( 0 24 55) 0 0.8459 0.6874 13 16 ( 2463 1id1_A) ( 2328 1hye_A) 0.8448 0.9968 4.0958 ( 1 33 55) 0 0.8448 0.9968 13 11 ( 2463 1id1_A) ( 2330 1hyh_A) 0.8300 0.9644 3.8603 ( 2 32 55) 0 0.8300 0.9644 13 11 ( 2463 1id1_A) ( 2368 1i24_A) 0.8456 0.4074 4.2126 ( 0 27 55) 0 0.8456 0.4241 13 27 ( 2463 1id1_A) ( 2376 1i36_A) 0.7621 0.6877 5.5380 ( 3 30 55) 0 0.7686 0.6877 13 15 ( 2463 1id1_A) ( 2463 1id1_A) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 53 78) 0 1.0000 1.0000 13 13 ( 2463 1id1_A) ( 2615 1iuk_A) 0.7332 0.7818 6.7550 ( 2 23 45) 0 0.7653 0.8275 13 12 ( 2463 1id1_A) ( 2657 1iy8_A) 0.8459 0.6470 3.6552 ( 0 23 55) 0 0.8459 0.6470 13 17 ( 2463 1id1_A) ( 2674 1iz0_A) 0.6650 0.6234 3.6065 ( 4 30 55) 0 0.8454 0.7330 13 15 ( 2463 1id1_A) ( 2725 1j3v_A) 0.7437 0.6963 3.8574 ( 2 25 45) 0 0.7681 0.7135 13 14 ( 2463 1id1_A) ( 2736 1j5p_A) 0.6153 0.7997 3.8719 ( 0 12 28) 0 0.6921 0.8993 13 10 ( 2463 1id1_A) ( 2781 1ja9_A) 0.8458 0.6470 3.7797 ( 0 24 55) 0 0.8458 0.6470 13 17 ( 2463 1id1_A) ( 2789 1jax_A) 0.8448 0.5498 3.7716 ( 1 32 55) 0 0.8448 0.5498 13 20 ( 2463 1id1_A) ( 3017 1jqb_A) 0.7692 0.6666 2.5326 ( 0 21 45) 0 0.7692 0.6666 13 15 ( 2463 1id1_A) ( 3059 1jtv_A) 0.8436 0.6106 4.2208 ( 1 27 55) 0 0.8440 0.6107 13 18 ( 2463 1id1_A) ( 3072 1jvb_A) 0.6923 0.6923 2.2968 ( 0 18 36) 0 0.7844 0.7844 13 13 ( 2463 1id1_A) ( 3144 1k2w_A) 0.8459 0.6470 3.5355 ( 0 27 55) 0 0.8459 0.6470 13 17 ( 2463 1id1_A) ( 3192 1k6j_A) 0.8460 0.4583 2.9005 ( 0 22 55) 0 0.8460 0.4583 13 24 ( 2463 1id1_A) ( 3257 1kbz_A) 0.4615 0.3158 3.9594 ( 0 5 15) 0 0.8452 0.5788 13 19 ( 2463 1id1_A) ( 3385 1kol_A) 0.7692 0.6250 2.7267 ( 0 23 45) 0 0.8677 0.7287 13 16 ( 2463 1id1_A) ( 3414 1ks9_A) 0.7470 0.5821 4.4133 ( 2 26 45) 0 0.7470 0.5821 13 17 ( 2463 1id1_A) ( 3481 1kyq_A) 0.5385 0.7000 1.9738 ( 0 6 21) 0 0.5857 0.7086 13 10 ( 2463 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