------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 3192 1k6j_A) ( 42 1a4i_A) 0.2083 0.5000 3.8245 ( 0 1 10) 0 0.4128 0.8972 24 10 ( 3192 1k6j_A) ( 265 1b16_A) 0.5417 0.8124 2.7957 ( 0 39 78) 0 0.5417 0.8124 24 16 ( 3192 1k6j_A) ( 312 1b7g_O) 0.4167 0.7692 2.9719 ( 0 19 45) 0 0.4582 0.8431 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 319 1b8p_A) 0.4583 0.9988 4.1955 ( 0 23 55) 0 0.4583 0.9988 24 11 ( 3192 1k6j_A) ( 352 1bdb ) 0.5833 0.7776 2.9532 ( 1 48 91) 0 0.6056 0.7776 24 18 ( 3192 1k6j_A) ( 377 1bg6 ) 0.3317 0.3436 4.3547 ( 10 35 66) 0 0.4045 0.5109 24 18 ( 3192 1k6j_A) ( 506 1c1d_A) 0.2500 0.4999 4.9419 ( 0 2 15) 0 0.4135 0.7540 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 707 1cyd_A) 0.5832 0.7774 3.3998 ( 1 43 91) 0 0.5832 0.7774 24 18 ( 3192 1k6j_A) ( 781 1db3_A) 0.7069 0.7705 4.0627 ( 4 97 136) 0 0.7069 0.7705 24 22 ( 3192 1k6j_A) ( 847 1dih ) 0.2917 0.9996 3.2558 ( 0 4 21) 0 0.2917 0.9997 24 7 ( 3192 1k6j_A) ( 873 1dlj_A) 0.2083 0.3125 3.6438 ( 0 3 10) 0 0.4808 0.6867 24 16 ( 3192 1k6j_A) ( 906 1dpg_A) 0.4989 0.9012 3.8759 ( 2 33 66) 0 0.4989 0.9012 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 972 1dxy ) 0.2913 0.4348 3.2565 ( 1 11 21) 0 0.4953 0.7174 24 16 ( 3192 1k6j_A) ( 1053 1e6u_A) 0.7057 0.7534 4.2441 ( 11 114 153) 0 0.7057 0.7634 24 22 ( 3192 1k6j_A) ( 1071 1e7w_A) 0.2917 0.4117 4.3415 ( 0 11 21) 0 0.5408 0.7597 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 1094 1ebf_A) 0.4158 0.8084 4.6413 ( 1 14 45) 0 0.4158 0.8084 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 1117 1edz_A) 0.2917 0.5833 2.6605 ( 0 9 21) 0 0.4412 0.7445 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 1189 1ek6_A) 0.7494 0.8016 4.2563 ( 11 124 171) 0 0.7494 0.8016 24 22 ( 3192 1k6j_A) ( 1219 1enp ) 0.5829 0.7759 3.1529 ( 2 50 91) 0 0.6064 0.7759 24 18 ( 3192 1k6j_A) ( 1221 1eny ) 0.5416 0.7644 2.6578 ( 1 42 78) 0 0.5416 0.7644 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 1242 1eq2_A) 0.6828 0.7347 3.9769 ( 8 90 136) 0 0.6828 0.7347 24 22 ( 3192 1k6j_A) ( 1355 1f14_A) 0.2500 0.4000 3.7216 ( 0 7 15) 0 0.4582 0.7322 24 15 ( 3192 1k6j_A) ( 1436 1f8f_A) 0.2917 0.5000 3.0267 ( 0 8 21) 0 0.4999 0.8562 24 14 ( 3192 1k6j_A) ( 1487 1ff9_A) 0.5416 0.8657 3.8139 ( 1 39 78) 0 0.6191 0.9450 24 15 ( 3192 1k6j_A) ( 1531 1fjh_A) 0.3239 0.3365 4.4558 ( 10 34 66) 0 0.4998 0.7488 24 16 ( 3192 1k6j_A) ( 1560 1fmc_A) 0.5833 0.8231 3.3353 ( 1 44 91) 0 0.5833 0.8231 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 1804 1gdh_A) 0.2913 0.4948 3.0979 ( 1 11 21) 0 0.5082 0.8538 24 14 ( 3192 1k6j_A) ( 1807 1gee_A) 0.5833 0.6998 3.1734 ( 1 45 91) 0 0.5833 0.6998 24 20 ( 3192 1k6j_A) ( 1809 1geg_A) 0.5833 0.8231 3.3052 ( 1 46 91) 0 0.5833 0.8231 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 1899 1gpj_A) 0.2500 0.5000 3.4852 ( 0 6 15) 0 0.4583 0.9156 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 1922 1gr0_A) 0.4555 0.7477 4.0501 ( 2 23 55) 0 0.4874 0.7477 24 14 ( 3192 1k6j_A) ( 1948 1gtm_A) 0.2481 0.3619 4.2474 ( 1 6 15) 0 0.4741 0.6852 24 16 ( 3192 1k6j_A) ( 1956 1gu7_A) 0.3750 0.5294 3.3773 ( 0 18 36) 0 0.4992 0.7016 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 2004 1gy8_A) 0.3333 0.3478 3.2306 ( 0 17 28) 0 0.7380 0.7679 24 23 ( 3192 1k6j_A) ( 2016 1gz3_A) 0.2916 0.4116 7.6378 ( 0 12 21) 0 0.5415 0.7636 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 2017 1gz6_A) 0.5416 0.6498 3.0121 ( 1 38 78) 0 0.5580 0.6498 24 20 ( 3192 1k6j_A) ( 2046 1h2b_A) 0.2500 0.4286 2.7147 ( 0 6 15) 0 0.5399 0.9034 24 14 ( 3192 1k6j_A) ( 2090 1h5q_A) 0.5833 0.6998 3.2495 ( 1 45 91) 0 0.5833 0.6998 24 20 ( 3192 1k6j_A) ( 2095 1h6d_A) 0.4581 0.7827 4.2118 ( 1 23 55) 0 0.4583 0.7852 24 14 ( 3192 1k6j_A) ( 2180 1hdc_A) 0.5833 0.8232 2.8637 ( 1 46 91) 0 0.5833 0.8232 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 2189 1hdo_A) 0.5417 0.8666 2.6790 ( 0 45 78) 0 0.5585 0.8666 24 15 ( 3192 1k6j_A) ( 2194 1het_A) 0.3333 0.5333 2.8010 ( 0 12 28) 0 0.4999 0.7989 24 15 ( 3192 1k6j_A) ( 2270 1hrd_A) 0.2917 0.4375 3.3568 ( 0 7 21) 0 0.4558 0.6695 24 16 ( 3192 1k6j_A) ( 2309 1hwx_A) 0.2496 0.3507 9.4728 ( 1 9 15) 0 0.4164 0.5865 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 2316 1hxh_A) 0.5833 0.8746 2.8544 ( 1 47 91) 0 0.5833 0.8746 24 16 ( 3192 1k6j_A) ( 2328 1hye_A) 0.4583 0.9985 4.4570 ( 0 26 55) 0 0.4583 0.9985 24 11 ( 3192 1k6j_A) ( 2330 1hyh_A) 0.4582 0.9934 4.2219 ( 1 26 55) 0 0.4582 0.9934 24 11 ( 3192 1k6j_A) ( 2368 1i24_A) 0.8218 0.7342 3.7507 ( 8 137 190) 0 0.8348 0.7545 24 27 ( 3192 1k6j_A) ( 2376 1i36_A) 0.2500 0.4000 4.0611 ( 0 6 15) 0 0.4581 0.7310 24 15 ( 3192 1k6j_A) ( 2463 1id1_A) 0.4583 0.8460 2.9005 ( 0 22 55) 0 0.4583 0.8460 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 2615 1iuk_A) 0.3745 0.7351 3.7260 ( 1 14 36) 0 0.4166 0.8316 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 2657 1iy8_A) 0.3333 0.4706 3.0595 ( 0 16 28) 0 0.5405 0.7581 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 2674 1iz0_A) 0.3333 0.5333 2.6421 ( 0 8 28) 0 0.5405 0.8550 24 15 ( 3192 1k6j_A) ( 2725 1j3v_A) 0.2500 0.4286 4.0157 ( 0 4 15) 0 0.4166 0.7132 24 14 ( 3192 1k6j_A) ( 2736 1j5p_A) 0.3750 0.8996 3.7235 ( 0 12 36) 0 0.3750 0.8996 24 10 ( 3192 1k6j_A) ( 2781 1ja9_A) 0.3333 0.4706 2.8472 ( 0 16 28) 0 0.6139 0.8272 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 2789 1jax_A) 0.2083 0.2500 2.4650 ( 0 3 10) 0 0.5079 0.5778 24 20 ( 3192 1k6j_A) ( 3017 1jqb_A) 0.3333 0.5333 2.9186 ( 0 12 28) 0 0.4583 0.7331 24 15 ( 3192 1k6j_A) ( 3059 1jtv_A) 0.5818 0.7712 5.2344 ( 3 56 91) 0 0.5818 0.7712 24 18 ( 3192 1k6j_A) ( 3072 1jvb_A) 0.2500 0.4615 3.3539 ( 0 9 15) 0 0.4581 0.8420 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 3144 1k2w_A) 0.5833 0.8232 2.9992 ( 1 48 91) 0 0.5833 0.8232 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 3192 1k6j_A) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 224 276) 0 1.0000 1.0000 24 24 ( 3192 1k6j_A) ( 3257 1kbz_A) 0.6621 0.8278 3.8058 ( 5 82 120) 0 0.6646 0.8354 24 19 ( 3192 1k6j_A) ( 3385 1kol_A) 0.2500 0.3750 5.7847 ( 0 2 15) 0 0.5415 0.8110 24 16 ( 3192 1k6j_A) ( 3414 1ks9_A) 0.2462 0.2490 4.7663 ( 16 40 66) 0 0.4292 0.5709 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 3481 1kyq_A) 0.3333 0.7999 2.5773 ( 0 4 28) 0 0.3333 0.7999 24 10 ( 3192 1k6j_A) ( 3561 1l7d_A) 0.2913 0.4629 3.7902 ( 1 11 21) 0 0.4166 0.6664 24 15 ( 3192 1k6j_A) ( 3593 1lc0_A) 0.4581 0.9084 6.1930 ( 1 24 55) 0 0.4995 0.9842 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 3606 1ldn_A) 0.4582 0.9124 4.1396 ( 1 26 55) 0 0.4583 0.9143 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 3610 1leh_A) 0.3747 0.6855 6.2070 ( 1 16 36) 0 0.4571 0.8209 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 3633 1li4_A) 0.3326 0.6011 4.0953 ( 1 11 28) 0 0.4554 0.7928 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 3637 1lj8_A) 0.4583 0.5499 4.7860 ( 0 30 55) 0 0.4583 0.5499 24 20 ( 3192 1k6j_A) ( 3677 1lnq_A) 0.4999 0.6663 3.6524 ( 1 34 66) 0 0.4999 0.6663 24 18 ( 3192 1k6j_A) ( 3722 1lss_A) 0.4583 0.9165 2.7904 ( 0 21 55) 0 0.4583 0.9165 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 3724 1lsu_A) 0.4583 0.9165 2.7220 ( 0 22 55) 0 0.4583 0.9165 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 3734 1lu9_A) 0.2500 0.4286 3.5079 ( 0 7 15) 0 0.4583 0.7845 24 14 ( 3192 1k6j_A) ( 3854 1m66_A) 0.3332 0.4988 2.6282 ( 1 16 28) 0 0.4500 0.6338 24 16 ( 3192 1k6j_A) ( 4047 1mv8_A) 0.4141 0.5745 4.6930 ( 2 21 45) 0 0.4582 0.6465 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 4067 1mx3_A) 0.2917 0.5000 3.0970 ( 0 10 21) 0 0.4998 0.8549 24 14 ( 3192 1k6j_A) ( 4131 1n5d_A) 0.5416 0.7643 2.6688 ( 1 37 78) 0 0.5416 0.7643 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 4341 1np3_A) 0.2083 0.2941 2.8007 ( 0 3 10) 0 0.4221 0.5872 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 4351 1npy_A) 0.2917 0.5384 4.4255 ( 0 7 21) 0 0.4997 0.9158 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 4404 1nvm_B) 0.4167 0.8331 3.4723 ( 0 16 45) 0 0.4582 0.9111 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 4409 1nvt_A) 0.2917 0.5833 3.9455 ( 0 8 21) 0 0.4167 0.8331 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 4417 1nwc_A) 0.4164 0.8945 6.1246 ( 1 19 45) 0 0.4583 0.9965 24 11 ( 3192 1k6j_A) ( 4430 1nxq_A) 0.5828 0.7756 2.9540 ( 2 48 91) 0 0.5828 0.7756 24 18 ( 3192 1k6j_A) ( 4447 1nyt_A) 0.2917 0.5384 3.4109 ( 0 8 21) 0 0.4727 0.8115 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 4499 1o5i_A) 0.4999 0.7053 3.6288 ( 1 32 66) 0 0.5403 0.7570 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 4520 1o6z_A) 0.4582 0.9931 4.4673 ( 1 26 55) 0 0.4582 0.9931 24 11 ( 3192 1k6j_A) ( 4549 1o89_A) 0.2917 0.5385 2.5079 ( 0 8 21) 0 0.4998 0.9192 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 4573 1oaa ) 0.5416 0.8124 3.1124 ( 0 34 78) 0 0.6100 0.8744 24 16 ( 3192 1k6j_A) ( 4585 1obb_A) 0.4582 0.8432 3.4895 ( 1 25 55) 0 0.4992 0.9071 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 4588 1obf_O) 0.4165 0.8280 3.7107 ( 1 21 45) 0 0.4166 0.8322 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 4668 1oi7_A) 0.4167 0.9996 3.2160 ( 0 22 45) 0 0.4167 0.9996 24 10 ( 3192 1k6j_A) ( 4730 1ono_A) 0.2917 0.5833 3.1172 ( 0 5 21) 0 0.4667 0.9108 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 4739 1ooe_A) 0.5000 0.8566 4.2114 ( 0 36 66) 0 0.5345 0.8566 24 14 ( 3192 1k6j_A) ( 4765 1orr_A) 0.7816 0.7406 3.9723 ( 13 131 210) 0 0.7816 0.7406 24 26 ( 3192 1k6j_A) ( 4863 1p1j_A) 0.4577 0.4445 4.9316 ( 5 31 66) 0 0.4577 0.4445 24 25 ( 3192 1k6j_A) ( 4943 1p9l_A) 0.4583 0.9993 3.7168 ( 0 27 55) 0 0.4583 0.9993 24 11 ( 3192 1k6j_A) ( 5029 1pjq_A) 0.3750 0.8999 2.2148 ( 0 12 36) 0 0.3750 0.8999 24 10 ( 3192 1k6j_A) ( 5045 1pl7_A) 0.2500 0.4615 4.3554 ( 0 6 15) 0 0.5381 0.9342 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 5082 1pqw_A) 0.2917 0.4375 3.0698 ( 0 6 21) 0 0.5579 0.7368 24 16 ( 3192 1k6j_A) ( 5097 1psd_A) 0.2917 0.5833 3.9186 ( 0 10 21) 0 0.4583 0.9158 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 5140 1px0_A) 0.3332 0.4988 2.6797 ( 1 16 28) 0 0.4987 0.7404 24 16 ( 3192 1k6j_A) ( 5227 1q7c_A) 0.3333 0.4444 3.2845 ( 0 15 28) 0 0.5406 0.7179 24 18 ( 3192 1k6j_A) ( 5362 1qki_A) 0.4555 0.8419 3.6586 ( 2 23 55) 0 0.4555 0.8419 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 5387 1qmg_A) 0.2083 0.2632 3.6503 ( 0 2 10) 0 0.4166 0.5262 24 19 ( 3192 1k6j_A) ( 5406 1qor_A) 0.3333 0.6153 4.4569 ( 0 13 28) 0 0.4999 0.9215 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 5409 1qp8_A) 0.2917 0.5384 3.8989 ( 0 10 21) 0 0.4824 0.8457 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 5444 1qsg_A) 0.5828 0.7755 3.3207 ( 2 48 91) 0 0.5828 0.7755 24 18 ( 3192 1k6j_A) ( 5493 1qyc_A) 0.8697 0.8697 3.2457 ( 7 156 210) 0 0.8697 0.8697 24 24 ( 3192 1k6j_A) ( 5571 1r6d_A) 0.7744 0.7744 3.7823 ( 12 131 190) 0 0.7744 0.7744 24 24 ( 3192 1k6j_A) ( 5654 1rjw_A) 0.3750 0.6000 2.9389 ( 0 15 36) 0 0.4991 0.7908 24 15 ( 3192 1k6j_A) ( 5665 1rkx_A) 0.6657 0.7601 3.7144 ( 3 75 120) 0 0.6657 0.7601 24 21 ( 3192 1k6j_A) ( 5786 1say_A) 0.2500 0.4997 6.8435 ( 0 3 15) 0 0.4583 0.9152 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 5838 1spx_A) 0.4167 0.5882 3.0889 ( 0 26 45) 0 0.5402 0.7564 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 5877 1t2d_A) 0.4582 0.9928 3.9935 ( 1 25 55) 0 0.4582 0.9928 24 11 ( 3192 1k6j_A) ( 5942 1u8x_X) 0.4583 0.9155 4.6199 ( 0 24 55) 0 0.4999 0.9960 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 5954 1uay_A) 0.5000 0.7500 2.3021 ( 0 35 66) 0 0.5524 0.8101 24 16 ( 3192 1k6j_A) ( 6085 1ur5_A) 0.4582 0.9127 3.6707 ( 1 26 55) 0 0.4582 0.9127 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 6114 1uuf_A) 0.2917 0.5000 3.2851 ( 0 9 21) 0 0.5378 0.8785 24 14 ( 3192 1k6j_A) ( 6257 1vi2_A) 0.2917 0.5383 5.6560 ( 0 10 21) 0 0.4583 0.8453 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 6274 1vj0_A) 0.2500 0.3750 2.9175 ( 0 6 15) 0 0.4843 0.6875 24 16 ( 3192 1k6j_A) ( 6276 1vj1_A) 0.2917 0.5000 2.7493 ( 0 8 21) 0 0.5414 0.9242 24 14 ( 3192 1k6j_A) ( 6292 1vjp_A) 0.4779 0.6681 4.5508 ( 4 30 66) 0 0.4779 0.7853 24 14 ( 3192 1k6j_A) ( 6341 1xcb_A) 0.2917 0.8744 4.1931 ( 0 9 21) 0 0.3020 0.8746 24 8 ( 3192 1k6j_A) ( 6388 2ae1 ) 0.5833 0.8231 3.2863 ( 1 44 91) 0 0.5833 0.8231 24 17 ( 3192 1k6j_A) ( 6420 2cmd ) 0.4582 0.9121 3.6957 ( 1 25 55) 0 0.4582 0.9121 24 12 ( 3192 1k6j_A) ( 6426 2dap ) 0.4167 0.9989 4.1328 ( 0 20 45) 0 0.4167 0.9989 24 10 ( 3192 1k6j_A) ( 6497 2nac_A) 0.2895 0.4995 3.4356 ( 1 7 21) 0 0.4580 0.8388 24 13 ( 3192 1k6j_A) ( 6505 2pgd ) 0.2916 0.4993 8.6444 ( 0 10 21) 0 0.4582 0.7832 24 14 ( 3192 1k6j_A) ( 6627 6ldh ) 0.4583 0.8459 3.5543 ( 0 26 55) 0 0.4583 0.8459 24 13 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------