------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 5140 1px0_A) ( 42 1a4i_A) 0.3125 0.4999 5.7263 ( 0 1 10) 0 0.5000 0.7997 16 10 ( 5140 1px0_A) ( 265 1b16_A) 0.8712 0.8712 4.1941 ( 2 50 91) 0 0.8728 0.8728 16 16 ( 5140 1px0_A) ( 312 1b7g_O) 0.6237 0.7657 3.5346 ( 1 21 45) 0 0.6870 0.8447 16 13 ( 5140 1px0_A) ( 319 1b8p_A) 0.6241 0.9032 4.8563 ( 1 24 45) 0 0.6866 0.9943 16 11 ( 5140 1px0_A) ( 352 1bdb ) 0.9370 0.8330 3.5048 ( 1 64 105) 0 0.9370 0.8330 16 18 ( 5140 1px0_A) ( 377 1bg6 ) 0.3750 0.3333 2.6873 ( 0 7 15) 0 0.6166 0.5509 16 18 ( 5140 1px0_A) ( 506 1c1d_A) 0.3124 0.4163 9.4623 ( 0 2 10) 0 0.5620 0.7480 16 12 ( 5140 1px0_A) ( 707 1cyd_A) 0.9370 0.8330 3.4119 ( 1 60 105) 0 0.9370 0.8330 16 18 ( 5140 1px0_A) ( 781 1db3_A) 0.4998 0.3636 6.5931 ( 0 14 28) 0 0.7351 0.5423 16 22 ( 5140 1px0_A) ( 847 1dih ) 0.4375 0.9991 3.9252 ( 0 3 21) 0 0.4375 0.9991 16 7 ( 5140 1px0_A) ( 873 1dlj_A) 0.3125 0.3125 5.3072 ( 0 2 10) 0 0.6811 0.6811 16 16 ( 5140 1px0_A) ( 906 1dpg_A) 0.6249 0.7689 4.1373 ( 0 27 45) 0 0.7490 0.9201 16 13 ( 5140 1px0_A) ( 972 1dxy ) 0.3125 0.3125 2.7339 ( 0 3 10) 0 0.6248 0.6248 16 16 ( 5140 1px0_A) ( 1053 1e6u_A) 0.6100 0.5253 4.4817 ( 7 47 78) 0 0.6247 0.5253 16 22 ( 5140 1px0_A) ( 1071 1e7w_A) 0.9350 0.8805 3.5123 ( 2 61 105) 0 0.9350 0.8805 16 17 ( 5140 1px0_A) ( 1094 1ebf_A) 0.3749 0.4997 7.1953 ( 0 2 15) 0 0.5031 0.5809 16 12 ( 5140 1px0_A) ( 1117 1edz_A) 0.3750 0.5000 3.6150 ( 0 3 15) 0 0.5587 0.7347 16 12 ( 5140 1px0_A) ( 1189 1ek6_A) 0.4576 0.4320 5.6992 ( 10 47 78) 0 0.7489 0.5452 16 22 ( 5140 1px0_A) ( 1219 1enp ) 0.9372 0.8332 3.3041 ( 0 69 105) 0 0.9372 0.8332 16 18 ( 5140 1px0_A) ( 1221 1eny ) 0.8730 0.8221 3.1730 ( 2 58 91) 0 0.9138 0.8646 16 17 ( 5140 1px0_A) ( 1242 1eq2_A) 0.4779 0.4375 3.8647 ( 7 35 66) 0 0.7483 0.5451 16 22 ( 5140 1px0_A) ( 1355 1f14_A) 0.3193 0.3206 4.8878 ( 8 26 45) 0 0.6248 0.6664 16 15 ( 5140 1px0_A) ( 1436 1f8f_A) 0.4375 0.5000 3.4508 ( 0 7 21) 0 0.7471 0.8515 16 14 ( 5140 1px0_A) ( 1487 1ff9_A) 0.7492 0.7988 4.5625 ( 1 34 66) 0 0.7492 0.7988 16 15 ( 5140 1px0_A) ( 1531 1fjh_A) 0.3750 0.3750 5.5598 ( 0 3 15) 0 0.8115 0.8115 16 16 ( 5140 1px0_A) ( 1560 1fmc_A) 0.9371 0.8820 3.2530 ( 1 62 105) 0 0.9371 0.8820 16 17 ( 5140 1px0_A) ( 1804 1gdh_A) 0.3676 0.4147 3.6187 ( 1 7 15) 0 0.6864 0.7836 16 14 ( 5140 1px0_A) ( 1807 1gee_A) 0.9983 0.7994 3.3589 ( 2 75 120) 0 0.9983 0.7994 16 20 ( 5140 1px0_A) ( 1809 1geg_A) 0.9354 0.8808 3.3886 ( 2 64 105) 0 0.9354 0.8808 16 17 ( 5140 1px0_A) ( 1899 1gpj_A) 0.3125 0.4167 2.4360 ( 0 3 10) 0 0.6808 0.8898 16 12 ( 5140 1px0_A) ( 1922 1gr0_A) 0.6248 0.7139 4.8633 ( 0 20 45) 0 0.6248 0.7139 16 14 ( 5140 1px0_A) ( 1948 1gtm_A) 0.3125 0.3125 2.9502 ( 0 3 10) 0 0.6066 0.6066 16 16 ( 5140 1px0_A) ( 1956 1gu7_A) 0.3750 0.3529 3.5371 ( 0 6 15) 0 0.7426 0.7004 16 17 ( 5140 1px0_A) ( 2004 1gy8_A) 0.4679 0.4231 4.5611 ( 8 39 66) 0 0.6868 0.4781 16 23 ( 5140 1px0_A) ( 2016 1gz3_A) 0.3750 0.3529 3.4946 ( 0 4 15) 0 0.6872 0.6469 16 17 ( 5140 1px0_A) ( 2017 1gz6_A) 0.8678 0.6976 2.7454 ( 2 41 91) 0 0.8678 0.6976 16 20 ( 5140 1px0_A) ( 2046 1h2b_A) 0.4375 0.5000 3.2661 ( 0 8 21) 0 0.7475 0.8523 16 14 ( 5140 1px0_A) ( 2090 1h5q_A) 0.9781 0.7926 3.4834 ( 4 73 120) 0 0.9909 0.7970 16 20 ( 5140 1px0_A) ( 2095 1h6d_A) 0.7468 0.8510 7.2907 ( 1 31 66) 0 0.7468 0.8510 16 14 ( 5140 1px0_A) ( 2180 1hdc_A) 0.9370 0.8820 3.1187 ( 1 55 105) 0 0.9370 0.8820 16 17 ( 5140 1px0_A) ( 2189 1hdo_A) 0.6867 0.7322 3.3206 ( 1 27 55) 0 0.6867 0.7322 16 15 ( 5140 1px0_A) ( 2194 1het_A) 0.4375 0.4667 2.8063 ( 0 8 21) 0 0.7476 0.7967 16 15 ( 5140 1px0_A) ( 2270 1hrd_A) 0.3750 0.3750 5.3346 ( 0 4 15) 0 0.6247 0.6247 16 16 ( 5140 1px0_A) ( 2309 1hwx_A) 0.3125 0.2941 3.0687 ( 0 3 10) 0 0.5620 0.5291 16 17 ( 5140 1px0_A) ( 2316 1hxh_A) 0.9196 0.9196 3.0997 ( 3 53 105) 0 0.9196 0.9196 16 16 ( 5140 1px0_A) ( 2328 1hye_A) 0.5884 0.7447 5.5458 ( 3 26 45) 0 0.6862 0.9916 16 11 ( 5140 1px0_A) ( 2330 1hyh_A) 0.5624 0.8175 4.7252 ( 0 17 36) 0 0.6784 0.9466 16 11 ( 5140 1px0_A) ( 2368 1i24_A) 0.5020 0.4202 5.0437 ( 9 47 78) 0 0.5613 0.4289 16 27 ( 5140 1px0_A) ( 2376 1i36_A) 0.3125 0.3333 3.9317 ( 0 5 10) 0 0.6229 0.6638 16 15 ( 5140 1px0_A) ( 2463 1id1_A) 0.6249 0.7691 3.5230 ( 0 22 45) 0 0.7485 0.9190 16 13 ( 5140 1px0_A) ( 2615 1iuk_A) 0.5576 0.7303 4.3861 ( 1 13 36) 0 0.6231 0.8253 16 12 ( 5140 1px0_A) ( 2657 1iy8_A) 0.9372 0.8821 3.2242 ( 0 62 105) 0 0.9372 0.8821 16 17 ( 5140 1px0_A) ( 2674 1iz0_A) 0.4375 0.4667 3.5936 ( 0 8 21) 0 0.7478 0.7970 16 15 ( 5140 1px0_A) ( 2725 1j3v_A) 0.3125 0.3571 3.3840 ( 0 4 10) 0 0.6227 0.7098 16 14 ( 5140 1px0_A) ( 2736 1j5p_A) 0.5624 0.8990 4.5812 ( 0 12 36) 0 0.5624 0.8990 16 10 ( 5140 1px0_A) ( 2781 1ja9_A) 0.9589 0.9101 4.2907 ( 5 77 120) 0 0.9589 0.9101 16 17 ( 5140 1px0_A) ( 2789 1jax_A) 0.3125 0.2500 4.9531 ( 0 4 10) 0 0.5323 0.4393 16 20 ( 5140 1px0_A) ( 3017 1jqb_A) 0.4375 0.4667 3.4378 ( 0 9 21) 0 0.6872 0.7329 16 15 ( 5140 1px0_A) ( 3059 1jtv_A) 0.8121 0.7220 3.2334 ( 1 43 78) 0 0.8121 0.7220 16 18 ( 5140 1px0_A) ( 3072 1jvb_A) 0.3750 0.4615 3.3981 ( 0 4 15) 0 0.6860 0.8420 16 13 ( 5140 1px0_A) ( 3144 1k2w_A) 0.9373 0.8822 3.0324 ( 0 65 105) 0 0.9373 0.8822 16 17 ( 5140 1px0_A) ( 3192 1k6j_A) 0.4988 0.3332 2.6797 ( 1 16 28) 0 0.7404 0.4987 16 24 ( 5140 1px0_A) ( 3257 1kbz_A) 0.5625 0.4737 3.4568 ( 0 15 36) 0 0.6857 0.5782 16 19 ( 5140 1px0_A) ( 3385 1kol_A) 0.5625 0.5625 3.5857 ( 0 18 36) 0 0.7490 0.7490 16 16 ( 5140 1px0_A) ( 3414 1ks9_A) 0.5000 0.4706 4.0011 ( 0 11 28) 0 0.5000 0.4706 16 17 ( 5140 1px0_A) ( 3481 1kyq_A) 0.3898 0.4719 3.7099 ( 1 5 21) 0 0.4999 0.7992 16 10 ( 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