------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 5444 1qsg_A) ( 42 1a4i_A) 0.2778 0.4999 4.8803 ( 0 2 10) 0 0.4635 0.7993 18 10 ( 5444 1qsg_A) ( 265 1b16_A) 0.8319 0.9349 3.1659 ( 2 59 105) 0 0.8319 0.9349 18 16 ( 5444 1qsg_A) ( 312 1b7g_O) 0.5550 0.7665 4.1484 ( 1 23 45) 0 0.6106 0.8437 18 13 ( 5444 1qsg_A) ( 319 1b8p_A) 0.6104 0.9919 5.2105 ( 1 26 55) 0 0.6104 0.9922 18 11 ( 5444 1qsg_A) ( 352 1bdb ) 0.8859 0.8859 2.7623 ( 3 79 120) 0 0.8859 0.8859 18 18 ( 5444 1qsg_A) ( 377 1bg6 ) 0.2778 0.2778 4.3366 ( 0 2 10) 0 0.5554 0.5554 18 18 ( 5444 1qsg_A) ( 506 1c1d_A) 0.4777 0.6298 7.0129 ( 2 15 36) 0 0.4998 0.7487 18 12 ( 5444 1qsg_A) ( 707 1cyd_A) 0.9993 0.9993 2.6704 ( 2 95 153) 0 0.9993 0.9993 18 18 ( 5444 1qsg_A) ( 781 1db3_A) 0.7220 0.5908 3.0858 ( 1 45 78) 0 0.7426 0.6226 18 22 ( 5444 1qsg_A) ( 847 1dih ) 0.3889 0.9989 4.1119 ( 0 5 21) 0 0.3889 0.9993 18 7 ( 5444 1qsg_A) ( 873 1dlj_A) 0.3453 0.3470 5.4614 ( 14 49 78) 0 0.4991 0.5609 18 16 ( 5444 1qsg_A) ( 906 1dpg_A) 0.6665 0.9221 4.4545 ( 0 37 66) 0 0.6665 0.9221 18 13 ( 5444 1qsg_A) ( 972 1dxy ) 0.4667 0.4779 5.6449 ( 6 30 66) 0 0.6454 0.7134 18 16 ( 5444 1qsg_A) ( 1053 1e6u_A) 0.6649 0.5448 3.4970 ( 2 42 66) 0 0.6662 0.5453 18 22 ( 5444 1qsg_A) ( 1071 1e7w_A) 0.9423 0.9972 2.4311 ( 3 93 136) 0 0.9423 0.9972 18 17 ( 5444 1qsg_A) ( 1094 1ebf_A) 0.2939 0.2987 5.3615 ( 6 18 45) 0 0.5201 0.7452 18 12 ( 5444 1qsg_A) ( 1117 1edz_A) 0.3333 0.4999 5.0664 ( 0 5 15) 0 0.4636 0.6039 18 12 ( 5444 1qsg_A) ( 1189 1ek6_A) 0.7221 0.5909 3.6792 ( 0 44 78) 0 0.7695 0.6333 18 22 ( 5444 1qsg_A) ( 1219 1enp ) 0.9444 0.9444 2.1071 ( 1 97 136) 0 0.9444 0.9444 18 18 ( 5444 1qsg_A) ( 1221 1eny ) 0.9365 0.9895 2.2541 ( 4 88 136) 0 0.9365 0.9895 18 17 ( 5444 1qsg_A) ( 1242 1eq2_A) 0.7509 0.6260 3.5233 ( 4 50 91) 0 0.7509 0.6260 18 22 ( 5444 1qsg_A) ( 1355 1f14_A) 0.3333 0.4000 5.6497 ( 0 6 15) 0 0.4529 0.5330 18 15 ( 5444 1qsg_A) ( 1436 1f8f_A) 0.4444 0.5714 3.1640 ( 0 10 28) 0 0.6663 0.8557 18 14 ( 5444 1qsg_A) ( 1487 1ff9_A) 0.7216 0.8652 4.9099 ( 1 41 78) 0 0.7216 0.8652 18 15 ( 5444 1qsg_A) ( 1531 1fjh_A) 0.7221 0.8123 2.6520 ( 1 47 78) 0 0.7221 0.8123 18 16 ( 5444 1qsg_A) ( 1560 1fmc_A) 0.9409 0.9952 2.3452 ( 3 81 136) 0 0.9409 0.9952 18 17 ( 5444 1qsg_A) ( 1804 1gdh_A) 0.6024 0.7568 5.6466 ( 2 25 55) 0 0.6886 0.8538 18 14 ( 5444 1qsg_A) ( 1807 1gee_A) 0.9847 0.8909 2.7958 ( 5 100 153) 0 0.9847 0.8909 18 20 ( 5444 1qsg_A) ( 1809 1geg_A) 0.9352 0.9878 3.1249 ( 4 85 136) 0 0.9352 0.9878 18 17 ( 5444 1qsg_A) ( 1899 1gpj_A) 0.3333 0.5000 2.9904 ( 0 5 15) 0 0.6056 0.8780 18 12 ( 5444 1qsg_A) ( 1922 1gr0_A) 0.6101 0.7821 5.4125 ( 1 23 55) 0 0.6102 0.7825 18 14 ( 5444 1qsg_A) ( 1948 1gtm_A) 0.3333 0.3750 5.4217 ( 0 4 15) 0 0.6022 0.6718 18 16 ( 5444 1qsg_A) ( 1956 1gu7_A) 0.3333 0.3529 4.4437 ( 0 6 15) 0 0.7177 0.7587 18 17 ( 5444 1qsg_A) ( 2004 1gy8_A) 0.7118 0.5621 3.9415 ( 3 44 78) 0 0.7199 0.5645 18 23 ( 5444 1qsg_A) ( 2016 1gz3_A) 0.5553 0.5879 5.9802 ( 0 14 45) 0 0.6108 0.6467 18 17 ( 5444 1qsg_A) ( 2017 1gz6_A) 0.8332 0.7499 3.1013 ( 0 52 105) 0 0.8828 0.7964 18 20 ( 5444 1qsg_A) ( 2046 1h2b_A) 0.4443 0.5710 6.4046 ( 0 6 28) 0 0.6662 0.8557 18 14 ( 5444 1qsg_A) ( 2090 1h5q_A) 0.9936 0.8962 2.3598 ( 4 100 153) 0 0.9936 0.8962 18 20 ( 5444 1qsg_A) ( 2095 1h6d_A) 0.6109 0.7851 4.8741 ( 0 26 55) 0 0.6278 0.7851 18 14 ( 5444 1qsg_A) ( 2180 1hdc_A) 0.8830 0.9333 2.6250 ( 3 66 120) 0 0.8830 0.9333 18 17 ( 5444 1qsg_A) ( 2189 1hdo_A) 0.6665 0.7995 2.9417 ( 1 37 66) 0 0.6665 0.7995 18 15 ( 5444 1qsg_A) ( 2194 1het_A) 0.4444 0.5333 3.2285 ( 0 10 28) 0 0.6663 0.7990 18 15 ( 5444 1qsg_A) ( 2270 1hrd_A) 0.3889 0.4374 5.3943 ( 0 7 21) 0 0.5554 0.6247 18 16 ( 5444 1qsg_A) ( 2309 1hwx_A) 0.2778 0.2941 6.4508 ( 0 4 10) 0 0.5165 0.5384 18 17 ( 5444 1qsg_A) ( 2316 1hxh_A) 0.8699 0.9669 2.6466 ( 4 65 120) 0 0.8699 0.9669 18 16 ( 5444 1qsg_A) ( 2328 1hye_A) 0.6061 0.9478 5.3802 ( 2 29 55) 0 0.6061 0.9478 18 11 ( 5444 1qsg_A) ( 2330 1hyh_A) 0.5886 0.8250 5.4416 ( 3 29 55) 0 0.5886 0.9075 18 11 ( 5444 1qsg_A) ( 2368 1i24_A) 0.7221 0.4815 3.8783 ( 0 43 78) 0 0.7997 0.5508 18 27 ( 5444 1qsg_A) ( 2376 1i36_A) 0.2778 0.3333 3.4437 ( 0 1 10) 0 0.4998 0.5996 18 15 ( 5444 1qsg_A) ( 2463 1id1_A) 0.6111 0.8459 3.6790 ( 0 29 55) 0 0.6111 0.8459 18 13 ( 5444 1qsg_A) ( 2615 1iuk_A) 0.3333 0.4999 5.4980 ( 0 2 15) 0 0.5552 0.8306 18 12 ( 5444 1qsg_A) ( 2657 1iy8_A) 0.9436 0.9988 2.4973 ( 2 79 136) 0 0.9436 0.9988 18 17 ( 5444 1qsg_A) ( 2674 1iz0_A) 0.4443 0.5329 6.9899 ( 0 6 28) 0 0.6663 0.7992 18 15 ( 5444 1qsg_A) ( 2725 1j3v_A) 0.3333 0.4286 4.0084 ( 0 4 15) 0 0.4997 0.6419 18 14 ( 5444 1qsg_A) ( 2736 1j5p_A) 0.4999 0.8990 4.5428 ( 0 13 36) 0 0.5546 0.9829 18 10 ( 5444 1qsg_A) ( 2781 1ja9_A) 0.9438 0.9991 2.6700 ( 2 88 136) 0 0.9438 0.9991 18 17 ( 5444 1qsg_A) ( 2789 1jax_A) 0.2778 0.2500 3.5593 ( 0 4 10) 0 0.5548 0.4995 18 20 ( 5444 1qsg_A) ( 3017 1jqb_A) 0.4444 0.5333 3.3347 ( 0 12 28) 0 0.6111 0.7332 18 15 ( 5444 1qsg_A) ( 3059 1jtv_A) 0.8321 0.8321 3.3195 ( 2 63 105) 0 0.8321 0.8321 18 18 ( 5444 1qsg_A) ( 3072 1jvb_A) 0.4443 0.6148 6.4480 ( 0 6 28) 0 0.6109 0.8453 18 13 ( 5444 1qsg_A) ( 3144 1k2w_A) 0.9436 0.9988 3.3704 ( 2 87 136) 0 0.9436 0.9988 18 17 ( 5444 1qsg_A) ( 3192 1k6j_A) 0.7755 0.5828 3.3207 ( 2 48 91) 0 0.7755 0.5828 18 24 ( 5444 1qsg_A) ( 3257 1kbz_A) 0.6661 0.6312 4.0194 ( 1 30 66) 0 0.6999 0.6669 18 19 ( 5444 1qsg_A) ( 3385 1kol_A) 0.3889 0.4375 4.0544 ( 0 10 21) 0 0.6664 0.7495 18 16 ( 5444 1qsg_A) ( 3414 1ks9_A) 0.2939 0.2951 6.0643 ( 9 27 45) 0 0.3965 0.4049 18 17 ( 5444 1qsg_A) ( 3481 1kyq_A) 0.4444 0.7998 3.6599 ( 0 9 28) 0 0.4444 0.7998 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