------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 6114 1uuf_A) ( 42 1a4i_A) 0.6410 0.8901 4.5488 ( 1 20 36) 0 0.6427 0.8990 14 10 ( 6114 1uuf_A) ( 265 1b16_A) 0.5707 0.4996 7.3994 ( 0 6 28) 0 0.8317 0.7365 14 16 ( 6114 1uuf_A) ( 312 1b7g_O) 0.4998 0.5382 6.1373 ( 0 10 21) 0 0.7744 0.8299 14 13 ( 6114 1uuf_A) ( 319 1b8p_A) 0.6932 0.8460 4.4364 ( 2 24 45) 0 0.7826 0.9896 14 11 ( 6114 1uuf_A) ( 352 1bdb ) 0.4993 0.3887 8.6111 ( 0 5 21) 0 0.8349 0.6601 14 18 ( 6114 1uuf_A) ( 377 1bg6 ) 0.7133 0.5553 3.3956 ( 1 27 45) 0 0.7133 0.5553 14 18 ( 6114 1uuf_A) ( 506 1c1d_A) 0.5643 0.6516 3.0359 ( 1 12 28) 0 0.6881 0.7806 14 12 ( 6114 1uuf_A) ( 707 1cyd_A) 0.4999 0.3889 5.5662 ( 0 5 21) 0 0.8561 0.6664 14 18 ( 6114 1uuf_A) ( 781 1db3_A) 0.3571 0.2273 6.0960 ( 0 2 10) 0 0.8532 0.5450 14 22 ( 6114 1uuf_A) ( 847 1dih ) 0.5000 0.9990 4.0407 ( 0 6 21) 0 0.5000 0.9993 14 7 ( 6114 1uuf_A) ( 873 1dlj_A) 0.5000 0.4375 2.7138 ( 0 12 21) 0 0.7850 0.6871 14 16 ( 6114 1uuf_A) ( 906 1dpg_A) 0.4285 0.4614 6.0143 ( 0 2 15) 0 0.7851 0.8453 14 13 ( 6114 1uuf_A) ( 972 1dxy ) 0.5714 0.5000 2.7683 ( 0 13 28) 0 0.7714 0.6800 14 16 ( 6114 1uuf_A) ( 1053 1e6u_A) 0.3571 0.2273 5.9847 ( 0 2 10) 0 0.8539 0.5451 14 22 ( 6114 1uuf_A) ( 1071 1e7w_A) 0.5000 0.4118 3.4781 ( 0 5 21) 0 0.8395 0.6990 14 17 ( 6114 1uuf_A) ( 1094 1ebf_A) 0.5000 0.5833 3.8644 ( 0 9 21) 0 0.5499 0.6234 14 12 ( 6114 1uuf_A) ( 1117 1edz_A) 0.4999 0.5831 5.2032 ( 0 11 21) 0 0.6178 0.6997 14 12 ( 6114 1uuf_A) ( 1189 1ek6_A) 0.4999 0.3182 4.7813 ( 0 8 21) 0 0.8536 0.5451 14 22 ( 6114 1uuf_A) ( 1219 1enp ) 0.4284 0.3333 7.6910 ( 0 5 15) 0 0.7978 0.6478 14 18 ( 6114 1uuf_A) ( 1221 1eny ) 0.5706 0.4703 7.7443 ( 0 11 28) 0 0.7851 0.6468 14 17 ( 6114 1uuf_A) ( 1242 1eq2_A) 0.4286 0.2727 2.7841 ( 0 7 15) 0 0.8563 0.5454 14 22 ( 6114 1uuf_A) ( 1355 1f14_A) 0.6690 0.6334 4.1408 ( 3 29 45) 0 0.7128 0.6656 14 15 ( 6114 1uuf_A) ( 1436 1f8f_A) 0.9958 0.9958 2.4041 ( 2 56 91) 0 0.9958 0.9958 14 14 ( 6114 1uuf_A) ( 1487 1ff9_A) 0.5000 0.4667 2.4415 ( 0 12 21) 0 0.9213 0.8615 14 15 ( 6114 1uuf_A) ( 1531 1fjh_A) 0.4285 0.3750 6.1823 ( 0 1 15) 0 0.7847 0.6870 14 16 ( 6114 1uuf_A) ( 1560 1fmc_A) 0.5708 0.4704 7.1147 ( 0 5 28) 0 0.8284 0.6945 14 17 ( 6114 1uuf_A) ( 1804 1gdh_A) 0.7126 0.7126 3.1020 ( 1 23 45) 0 0.8087 0.8087 14 14 ( 6114 1uuf_A) ( 1807 1gee_A) 0.5708 0.3999 7.2860 ( 0 7 28) 0 0.8339 0.5959 14 20 ( 6114 1uuf_A) ( 1809 1geg_A) 0.5708 0.4703 7.2899 ( 0 6 28) 0 0.7850 0.6716 14 17 ( 6114 1uuf_A) ( 1899 1gpj_A) 0.7132 0.8310 3.2370 ( 1 26 45) 0 0.7132 0.8310 14 12 ( 6114 1uuf_A) ( 1922 1gr0_A) 0.3688 0.3688 7.4927 ( 2 9 15) 0 0.7508 0.7508 14 14 ( 6114 1uuf_A) ( 1948 1gtm_A) 0.7745 0.6816 3.8428 ( 2 32 55) 0 0.7745 0.6816 14 16 ( 6114 1uuf_A) ( 1956 1gu7_A) 0.9248 0.7633 2.2154 ( 2 52 78) 0 0.9248 0.7855 14 17 ( 6114 1uuf_A) ( 2004 1gy8_A) 0.4285 0.2609 5.1641 ( 0 6 15) 0 0.8530 0.5214 14 23 ( 6114 1uuf_A) ( 2016 1gz3_A) 0.5000 0.4118 3.7373 ( 0 7 21) 0 0.7113 0.5871 14 17 ( 6114 1uuf_A) ( 2017 1gz6_A) 0.5709 0.3999 7.0179 ( 0 9 28) 0 0.7849 0.5499 14 20 ( 6114 1uuf_A) ( 2046 1h2b_A) 0.9961 0.9961 2.3723 ( 2 57 91) 0 0.9961 0.9961 14 14 ( 6114 1uuf_A) ( 2090 1h5q_A) 0.5707 0.3999 7.3975 ( 0 6 28) 0 0.8318 0.5955 14 20 ( 6114 1uuf_A) ( 2095 1h6d_A) 0.4284 0.4284 7.8032 ( 0 8 15) 0 0.7530 0.7530 14 14 ( 6114 1uuf_A) ( 2180 1hdc_A) 0.5000 0.4118 3.2976 ( 0 7 21) 0 0.8545 0.7049 14 17 ( 6114 1uuf_A) ( 2189 1hdo_A) 0.4284 0.3999 6.9598 ( 0 7 15) 0 0.7822 0.7308 14 15 ( 6114 1uuf_A) ( 2194 1het_A) 0.9827 0.9209 2.7591 ( 3 58 91) 0 0.9827 0.9209 14 15 ( 6114 1uuf_A) ( 2270 1hrd_A) 0.4887 0.4316 3.5763 ( 1 9 21) 0 0.7137 0.6247 14 16 ( 6114 1uuf_A) ( 2309 1hwx_A) 0.4887 0.4074 3.6550 ( 1 9 21) 0 0.5988 0.5111 14 17 ( 6114 1uuf_A) ( 2316 1hxh_A) 0.4999 0.4375 5.1995 ( 0 3 21) 0 0.7852 0.6998 14 16 ( 6114 1uuf_A) ( 2328 1hye_A) 0.7304 0.8529 5.3668 ( 3 31 55) 0 0.7304 0.9020 14 11 ( 6114 1uuf_A) ( 2330 1hyh_A) 0.7304 0.8530 5.2838 ( 3 31 55) 0 0.7304 0.9052 14 11 ( 6114 1uuf_A) ( 2368 1i24_A) 0.4998 0.2593 6.1092 ( 0 5 21) 0 0.8541 0.4443 14 27 ( 6114 1uuf_A) ( 2376 1i36_A) 0.4922 0.4611 7.0031 ( 1 10 21) 0 0.7132 0.6659 14 15 ( 6114 1uuf_A) ( 2463 1id1_A) 0.6316 0.6591 2.9438 ( 3 24 45) 0 0.7142 0.7692 14 13 ( 6114 1uuf_A) ( 2615 1iuk_A) 0.5714 0.6666 2.7364 ( 0 8 28) 0 0.7112 0.8267 14 12 ( 6114 1uuf_A) ( 2657 1iy8_A) 0.5707 0.4703 7.4426 ( 0 6 28) 0 0.8545 0.7049 14 17 ( 6114 1uuf_A) ( 2674 1iz0_A) 0.9847 0.9224 2.8642 ( 3 60 91) 0 0.9847 0.9224 14 15 ( 6114 1uuf_A) ( 2725 1j3v_A) 0.7128 0.7128 5.8337 ( 1 29 45) 0 0.7682 0.7682 14 14 ( 6114 1uuf_A) ( 2736 1j5p_A) 0.5000 0.6999 3.8609 ( 0 9 21) 0 0.6428 0.8996 14 10 ( 6114 1uuf_A) ( 2781 1ja9_A) 0.5707 0.4703 7.4266 ( 0 6 28) 0 0.8320 0.6960 14 17 ( 6114 1uuf_A) ( 2789 1jax_A) 0.4045 0.2955 5.1688 ( 1 6 15) 0 0.7108 0.5303 14 20 ( 6114 1uuf_A) ( 3017 1jqb_A) 0.9115 0.8544 2.8422 ( 3 53 78) 0 0.9115 0.8544 14 15 ( 6114 1uuf_A) ( 3059 1jtv_A) 0.6353 0.4978 6.2159 ( 1 14 36) 0 0.8133 0.6531 14 18 ( 6114 1uuf_A) ( 3072 1jvb_A) 0.9283 0.9996 1.9886 ( 1 53 78) 0 0.9283 0.9996 14 13 ( 6114 1uuf_A) ( 3144 1k2w_A) 0.5707 0.4703 7.5603 ( 0 10 28) 0 0.8393 0.6989 14 17 ( 6114 1uuf_A) ( 3192 1k6j_A) 0.4286 0.2500 3.4140 ( 0 6 15) 0 0.8785 0.5378 14 24 ( 6114 1uuf_A) ( 3257 1kbz_A) 0.4285 0.3158 5.7957 ( 0 2 15) 0 0.8556 0.6313 14 19 ( 6114 1uuf_A) ( 3385 1kol_A) 0.7776 0.7342 2.6732 ( 7 61 91) 0 0.8207 0.7504 14 16 ( 6114 1uuf_A) ( 3414 1ks9_A) 0.6410 0.5287 6.4247 ( 1 22 36) 0 0.6427 0.5294 14 17 ( 6114 1uuf_A) ( 3481 1kyq_A) 0.5503 0.7085 3.5086 ( 1 9 28) 0 0.5714 0.7996 14 10 ( 6114 1uuf_A) ( 3561 1l7d_A) 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