------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 3189 1k66_A) ( 6 1a04_A) 0.9089 0.9089 2.9057 ( 0 19 45) 0 0.9089 0.9089 11 11 ( 3189 1k66_A) ( 26 1a2o_A) 0.9089 0.9997 3.0594 ( 0 21 45) 0 0.9089 0.9997 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 90 1a9x_B) 0.8180 0.5000 3.4116 ( 0 13 36) 0 0.8180 0.5000 11 18 ( 3189 1k66_A) ( 256 1b00_A) 0.9087 0.9993 3.6750 ( 0 19 45) 0 0.9087 0.9993 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 266 1b1c_A) 0.6815 0.6815 5.1505 ( 2 15 45) 0 0.9061 0.9061 11 11 ( 3189 1k66_A) ( 428 1bmt_A) 0.9085 0.9085 3.9612 ( 0 20 45) 0 0.9085 0.9085 11 11 ( 3189 1k66_A) ( 477 1bvy_F) 0.7272 0.8886 3.4174 ( 0 14 28) 0 0.7272 0.8887 11 9 ( 3189 1k66_A) ( 523 1c4k_A) 0.7267 0.9973 5.1668 ( 0 11 28) 0 0.7267 0.9973 11 8 ( 3189 1k66_A) ( 562 1ccw_A) 0.8177 0.8992 4.3204 ( 0 13 36) 0 0.8177 0.8992 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 745 1d4a_A) 0.8163 0.5996 6.0328 ( 0 16 36) 0 0.9076 0.6664 11 15 ( 3189 1k66_A) ( 786 1dbw_A) 0.9011 0.9873 2.9139 ( 1 21 45) 0 0.9011 0.9873 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 793 1dcf_A) 0.9089 0.9998 2.7925 ( 0 20 45) 0 0.9089 0.9998 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 971 1dxy ) 0.8180 0.9995 3.3324 ( 0 12 36) 0 0.8180 0.9995 11 9 ( 3189 1k66_A) ( 980 1dz3_A) 0.8181 0.8999 2.6537 ( 0 16 36) 0 0.8181 0.8999 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 1042 1e5d_A) 0.7372 0.7649 4.4627 ( 2 17 45) 0 0.9026 0.9896 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 1177 1eiw_A) 0.7006 0.7650 3.9242 ( 2 17 36) 0 0.8068 0.9702 11 9 ( 3189 1k66_A) ( 1252 1es9_A) 0.8963 0.8250 4.8420 ( 1 19 45) 0 0.9073 0.8322 11 12 ( 3189 1k66_A) ( 1253 1esc ) 0.3636 0.2353 7.6401 ( 0 0 6) 0 0.8171 0.5293 11 17 ( 3189 1k66_A) ( 1266 1euc_B) 0.9087 0.8331 3.6854 ( 0 18 45) 0 0.9087 0.8331 11 12 ( 3189 1k66_A) ( 1379 1f2v_A) 0.8910 0.6221 3.8052 ( 1 17 45) 0 0.8910 0.6221 11 16 ( 3189 1k66_A) ( 1397 1f4p_A) 0.7271 0.8884 3.9214 ( 0 13 28) 0 0.8170 0.9967 11 9 ( 3189 1k66_A) ( 1443 1f8y_A) 0.5995 0.5995 3.7777 ( 1 7 28) 0 0.7861 0.7861 11 11 ( 3189 1k66_A) ( 1516 1fjg_B) 0.4612 0.4488 3.4103 ( 1 5 21) 0 0.5447 0.4995 11 12 ( 3189 1k66_A) ( 1547 1flc_A) 0.7272 0.4444 3.5227 ( 0 9 28) 0 0.7272 0.4444 11 18 ( 3189 1k66_A) ( 1659 1fye_A) 0.4545 0.2778 4.6396 ( 0 2 10) 0 0.8459 0.5493 11 18 ( 3189 1k66_A) ( 1662 1fyx_A) 0.6961 0.7520 3.5402 ( 1 11 28) 0 0.7140 0.7790 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 1700 1g2i_A) 0.7272 0.5714 3.3154 ( 0 13 28) 0 0.8179 0.6428 11 14 ( 3189 1k66_A) ( 1803 1gdh_A) 0.8611 0.9269 4.1738 ( 1 13 45) 0 0.8611 0.9269 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 1901 1gpm_A) 0.7272 0.5000 2.7216 ( 0 12 28) 0 0.7272 0.5000 11 16 ( 3189 1k66_A) ( 2027 1h05_A) 0.8181 0.8181 3.0599 ( 0 9 36) 0 0.8181 0.8181 11 11 ( 3189 1k66_A) ( 2427 1i7q_B) 0.7605 0.5370 3.2387 ( 2 18 45) 0 0.7605 0.5370 11 18 ( 3189 1k66_A) ( 2470 1iex_A) 0.9085 0.8330 3.9677 ( 0 13 45) 0 0.9085 0.8330 11 12 ( 3189 1k66_A) ( 2714 1j2y_A) 0.8179 0.8179 3.6133 ( 0 13 36) 0 0.8179 0.8179 11 11 ( 3189 1k66_A) ( 2729 1j4a_A) 0.9087 0.9993 3.6805 ( 0 16 45) 0 0.9087 0.9993 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 2809 1jbe_A) 0.9089 0.9998 2.7897 ( 0 20 45) 0 0.9089 0.9998 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 3034 1jrl_A) 0.8175 0.8989 4.7246 ( 0 11 36) 0 0.8175 0.8989 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 3073 1jvn_A) 0.7650 0.4697 4.3310 ( 2 22 36) 0 0.8173 0.4736 11 19 ( 3189 1k66_A) ( 3189 1k66_A) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 31 55) 0 1.0000 1.0000 11 11 ( 3189 1k66_A) ( 3190 1k68_A) 0.9091 0.9999 1.2139 ( 0 21 45) 0 0.9091 0.9999 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 3199 1k7c_A) 0.8178 0.5999 4.1636 ( 0 12 36) 0 0.9029 0.6653 11 15 ( 3189 1k66_A) ( 3234 1k9v_F) 0.7271 0.4444 3.8294 ( 0 14 28) 0 0.8173 0.4999 11 18 ( 3189 1k66_A) ( 3238 1ka9_H) 0.7649 0.5532 4.6611 ( 2 22 36) 0 0.7649 0.5532 11 16 ( 3189 1k66_A) ( 3295 1kgs_A) 0.7958 0.8651 2.7966 ( 1 14 36) 0 0.8171 0.8983 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 3412 1krw_A) 0.9089 0.9997 3.0186 ( 0 18 45) 0 0.9089 0.9997 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 3462 1kwg_A) 0.8181 0.5625 2.7120 ( 0 14 36) 0 0.8181 0.5625 11 16 ( 3189 1k66_A) ( 3560 1l7d_A) 0.7785 0.5244 4.9181 ( 1 12 36) 0 0.9077 0.5881 11 17 ( 3189 1k66_A) ( 3581 1l9x_A) 0.6562 0.3844 3.4912 ( 2 15 36) 0 0.8954 0.4344 11 23 ( 3189 1k66_A) ( 3632 1li4_A) 0.9358 0.6048 3.6934 ( 2 27 55) 0 0.9358 0.6048 11 18 ( 3189 1k66_A) ( 3801 1m2e_A) 0.8175 0.9983 4.6250 ( 0 18 36) 0 0.8175 0.9983 11 9 ( 3189 1k66_A) ( 3896 1mb3_A) 0.9090 0.9999 2.4014 ( 0 19 45) 0 0.9090 0.9999 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 4066 1mx3_A) 0.8178 0.8178 4.0898 ( 0 11 36) 0 0.8178 0.8178 11 11 ( 3189 1k66_A) ( 4130 1n57_A) 0.6562 0.4780 3.4104 ( 2 15 36) 0 0.8006 0.5370 11 18 ( 3189 1k66_A) ( 4185 1nat ) 0.9090 0.9999 2.2452 ( 0 17 45) 0 0.9090 0.9999 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 4323 1nni_1) 0.9351 0.9351 4.5957 ( 2 27 55) 0 0.9351 0.9351 11 11 ( 3189 1k66_A) ( 4433 1ny5_A) 0.9068 0.9963 5.6033 ( 0 16 45) 0 0.9068 0.9963 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 4474 1o1y_A) 0.5124 0.3911 2.8936 ( 2 11 28) 0 0.7045 0.4195 11 19 ( 3189 1k66_A) ( 4590 1obo_A) 0.7600 0.7926 5.0014 ( 2 18 45) 0 0.8176 0.8990 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 4669 1oi7_A) 0.8180 0.8180 3.3620 ( 0 12 36) 0 0.8180 0.8180 11 11 ( 3189 1k66_A) ( 4787 1ou0_A) 0.9086 0.5882 3.8369 ( 0 15 45) 0 0.9086 0.5882 11 17 ( 3189 1k66_A) ( 4813 1oxb_B) 0.9090 0.9998 2.6139 ( 0 20 45) 0 0.9090 0.9998 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 4871 1p2f_A) 0.9089 0.9997 2.9011 ( 0 18 45) 0 0.9089 0.9997 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 4905 1p5f_A) 0.9346 0.7640 5.0104 ( 2 27 55) 0 0.9346 0.7640 11 14 ( 3189 1k66_A) ( 4916 1p6u_A) 0.9088 0.9995 3.3720 ( 0 24 45) 0 0.9088 0.9995 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 4926 1p80_A) 0.7272 0.6153 3.2861 ( 0 13 28) 0 0.8042 0.7028 11 13 ( 3189 1k66_A) ( 5096 1psd_A) 0.8178 0.9989 4.1369 ( 0 4 36) 0 0.8178 0.9989 11 9 ( 3189 1k66_A) ( 5234 1q7r_A) 0.8537 0.5501 4.9587 ( 2 25 45) 0 0.8537 0.5501 11 18 ( 3189 1k66_A) ( 5289 1qcz_A) 0.8178 0.8994 4.0032 ( 0 13 36) 0 0.8178 0.8994 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 5297 1qdl_B) 0.8181 0.5294 2.7734 ( 0 12 36) 0 0.8181 0.5294 11 17 ( 3189 1k66_A) ( 5364 1qkk_A) 0.9054 0.9940 6.3111 ( 0 20 45) 0 0.9054 0.9940 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 5397 1qo0_D) 0.8049 0.7413 9.9750 ( 0 15 36) 0 0.8049 0.7413 11 12 ( 3189 1k66_A) ( 5470 1qvz_A) 0.9080 0.6248 4.6436 ( 0 24 45) 0 0.9080 0.6248 11 16 ( 3189 1k66_A) ( 5673 1rli_A) 0.9947 0.9132 4.3064 ( 1 28 55) 0 0.9947 0.9132 11 12 ( 3189 1k66_A) ( 5752 1s2d_A) 0.4545 0.5555 4.6618 ( 0 5 10) 0 0.6356 0.7758 11 9 ( 3189 1k66_A) ( 5785 1say_A) 0.8180 0.4737 3.2068 ( 0 12 36) 0 0.8941 0.5253 11 19 ( 3189 1k66_A) ( 5842 1sqs_A) 0.5470 0.5213 4.4351 ( 3 17 45) 0 0.7883 0.6334 11 14 ( 3189 1k66_A) ( 5920 1tmy ) 0.9090 0.9999 2.3923 ( 0 21 45) 0 0.9090 0.9999 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 6242 1vhq_A) 0.8008 0.6375 3.7983 ( 1 15 36) 0 0.8961 0.7103 11 14 ( 3189 1k66_A) ( 6258 1vi6_A) 0.5124 0.4861 3.2348 ( 2 11 28) 0 0.7650 0.6674 11 13 ( 3189 1k66_A) ( 6283 1vjg_A) 0.8168 0.7491 5.6110 ( 0 12 36) 0 0.8168 0.7491 11 12 ( 3189 1k66_A) ( 6496 2nac_A) 0.9086 0.7690 3.8095 ( 0 15 45) 0 0.9086 0.7690 11 13 ( 3189 1k66_A) ( 6624 5nul ) 0.7271 0.7998 3.6989 ( 0 13 28) 0 0.8173 0.8986 11 10 ( 3189 1k66_A) ( 6640 7req_A) 0.9085 0.8330 3.8960 ( 0 20 45) 0 0.9085 0.8330 11 12 ( 3189 1k66_A) ( 6642 7req_B) 0.9083 0.7689 4.3156 ( 0 16 45) 0 0.9083 0.7689 11 13 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------