------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 3199 1k7c_A) ( 6 1a04_A) 0.5999 0.8177 4.4073 ( 0 18 36) 0 0.5999 0.8177 15 11 ( 3199 1k7c_A) ( 26 1a2o_A) 0.5999 0.8993 4.1463 ( 0 19 36) 0 0.6651 0.9887 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 90 1a9x_B) 0.5818 0.4924 5.5703 ( 2 20 36) 0 0.6520 0.5495 15 18 ( 3199 1k7c_A) ( 256 1b00_A) 0.5998 0.8985 5.1142 ( 0 19 36) 0 0.5998 0.8985 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 266 1b1c_A) 0.3999 0.5451 6.6152 ( 0 4 15) 0 0.5332 0.7264 15 11 ( 3199 1k7c_A) ( 428 1bmt_A) 0.4664 0.6353 7.1691 ( 0 8 21) 0 0.5997 0.8168 15 11 ( 3199 1k7c_A) ( 477 1bvy_F) 0.4666 0.7764 5.9624 ( 0 9 21) 0 0.5332 0.8870 15 9 ( 3199 1k7c_A) ( 523 1c4k_A) 0.3333 0.6242 6.8166 ( 0 4 10) 0 0.4666 0.8741 15 8 ( 3199 1k7c_A) ( 562 1ccw_A) 0.5328 0.7957 7.6960 ( 0 14 28) 0 0.5997 0.8980 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 745 1d4a_A) 0.3333 0.3333 3.9825 ( 0 5 10) 0 0.6452 0.6452 15 15 ( 3199 1k7c_A) ( 786 1dbw_A) 0.5998 0.8987 4.8878 ( 0 14 36) 0 0.5998 0.8987 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 793 1dcf_A) 0.5999 0.8993 4.2241 ( 0 19 36) 0 0.5999 0.8993 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 971 1dxy ) 0.5333 0.8886 3.5404 ( 0 11 28) 0 0.5333 0.8886 15 9 ( 3199 1k7c_A) ( 980 1dz3_A) 0.5983 0.8873 5.3304 ( 1 19 36) 0 0.5983 0.8873 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 1042 1e5d_A) 0.4583 0.6459 7.8043 ( 1 9 21) 0 0.5955 0.8684 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 1177 1eiw_A) 0.4959 0.6450 5.1774 ( 2 14 28) 0 0.4959 0.7769 15 9 ( 3199 1k7c_A) ( 1252 1es9_A) 0.6000 0.7499 2.9069 ( 0 17 36) 0 0.6663 0.8324 15 12 ( 3199 1k7c_A) ( 1253 1esc ) 0.5996 0.5292 5.9508 ( 0 21 36) 0 0.5996 0.5292 15 17 ( 3199 1k7c_A) ( 1266 1euc_B) 0.5909 0.7237 3.6740 ( 1 12 36) 0 0.5995 0.7484 15 12 ( 3199 1k7c_A) ( 1379 1f2v_A) 0.3333 0.3125 2.9454 ( 0 3 10) 0 0.5331 0.4999 15 16 ( 3199 1k7c_A) ( 1397 1f4p_A) 0.3899 0.5729 7.6749 ( 1 7 15) 0 0.5227 0.7843 15 9 ( 3199 1k7c_A) ( 1443 1f8y_A) 0.3332 0.4540 9.1491 ( 0 3 10) 0 0.4627 0.6188 15 11 ( 3199 1k7c_A) ( 1516 1fjg_B) 0.2667 0.3333 7.2781 ( 0 3 6) 0 0.5272 0.6486 15 12 ( 3199 1k7c_A) ( 1547 1flc_A) 0.4678 0.4303 3.9636 ( 4 21 36) 0 0.4678 0.4303 15 18 ( 3199 1k7c_A) ( 1659 1fye_A) 0.4666 0.3889 4.9651 ( 0 10 21) 0 0.5595 0.4822 15 18 ( 3199 1k7c_A) ( 1662 1fyx_A) 0.2667 0.3999 6.8938 ( 0 2 6) 0 0.4316 0.5993 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 1700 1g2i_A) 0.3591 0.3671 6.0783 ( 3 12 21) 0 0.4061 0.4283 15 14 ( 3199 1k7c_A) ( 1803 1gdh_A) 0.5999 0.8990 4.5911 ( 0 14 36) 0 0.5999 0.8990 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 1901 1gpm_A) 0.5296 0.4973 3.7331 ( 1 13 28) 0 0.5296 0.4984 15 16 ( 3199 1k7c_A) ( 2027 1h05_A) 0.4667 0.6363 2.5634 ( 0 7 21) 0 0.5385 0.7267 15 11 ( 3199 1k7c_A) ( 2427 1i7q_B) 0.5288 0.4668 4.5062 ( 3 20 36) 0 0.6289 0.5392 15 18 ( 3199 1k7c_A) ( 2470 1iex_A) 0.5998 0.7495 4.8882 ( 0 16 36) 0 0.5998 0.7495 15 12 ( 3199 1k7c_A) ( 2714 1j2y_A) 0.5331 0.7264 5.7965 ( 0 12 28) 0 0.5992 0.8146 15 11 ( 3199 1k7c_A) ( 2729 1j4a_A) 0.5999 0.8994 3.9829 ( 0 16 36) 0 0.5999 0.8994 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 2809 1jbe_A) 0.5998 0.8986 4.9953 ( 0 15 36) 0 0.5998 0.8986 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 3034 1jrl_A) 0.6000 0.8998 3.1677 ( 0 20 36) 0 0.6000 0.8998 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 3073 1jvn_A) 0.3333 0.2632 3.7844 ( 0 3 10) 0 0.5322 0.4245 15 19 ( 3199 1k7c_A) ( 3189 1k66_A) 0.5999 0.8178 4.1636 ( 0 12 36) 0 0.6653 0.9029 15 11 ( 3199 1k7c_A) ( 3190 1k68_A) 0.5999 0.8995 3.7829 ( 0 12 36) 0 0.6654 0.9906 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 3199 1k7c_A) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 90 105) 0 1.0000 1.0000 15 15 ( 3199 1k7c_A) ( 3234 1k9v_F) 0.5320 0.4439 4.6504 ( 1 17 28) 0 0.5652 0.4849 15 18 ( 3199 1k7c_A) ( 3238 1ka9_H) 0.3333 0.3125 4.0775 ( 0 5 10) 0 0.5539 0.5277 15 16 ( 3199 1k7c_A) ( 3295 1kgs_A) 0.5332 0.7993 4.8621 ( 0 8 28) 0 0.5988 0.8910 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 3412 1krw_A) 0.5999 0.8994 4.0689 ( 0 12 36) 0 0.5999 0.8994 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 3462 1kwg_A) 0.5295 0.4972 4.8222 ( 1 13 28) 0 0.5945 0.5585 15 16 ( 3199 1k7c_A) ( 3560 1l7d_A) 0.5996 0.5292 5.8855 ( 0 23 36) 0 0.5997 0.5292 15 17 ( 3199 1k7c_A) ( 3581 1l9x_A) 0.5317 0.3476 4.0428 ( 1 16 28) 0 0.5990 0.4314 15 23 ( 3199 1k7c_A) ( 3632 1li4_A) 0.5999 0.5000 3.6591 ( 0 16 36) 0 0.6665 0.5555 15 18 ( 3199 1k7c_A) ( 3801 1m2e_A) 0.5332 0.8866 5.7276 ( 0 15 28) 0 0.5333 0.8884 15 9 ( 3199 1k7c_A) ( 3896 1mb3_A) 0.5999 0.8992 4.4093 ( 0 17 36) 0 0.5999 0.8992 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 4066 1mx3_A) 0.5232 0.5973 6.1956 ( 2 13 36) 0 0.5331 0.7263 15 11 ( 3199 1k7c_A) ( 4130 1n57_A) 0.5599 0.4825 5.6460 ( 2 16 36) 0 0.5599 0.4825 15 18 ( 3199 1k7c_A) ( 4185 1nat ) 0.5999 0.8995 3.8652 ( 0 13 36) 0 0.5999 0.8995 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 4323 1nni_1) 0.4666 0.6360 5.3545 ( 0 8 21) 0 0.5312 0.7173 15 11 ( 3199 1k7c_A) ( 4433 1ny5_A) 0.5989 0.8917 7.8455 ( 0 14 36) 0 0.5989 0.8920 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 4474 1o1y_A) 0.4613 0.3667 3.2670 ( 1 10 21) 0 0.5817 0.4752 15 19 ( 3199 1k7c_A) ( 4590 1obo_A) 0.3333 0.4999 5.1130 ( 0 4 10) 0 0.5995 0.8960 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 4669 1oi7_A) 0.4667 0.6363 2.8685 ( 0 6 21) 0 0.5994 0.8153 15 11 ( 3199 1k7c_A) ( 4787 1ou0_A) 0.5234 0.4833 3.8883 ( 2 13 36) 0 0.5288 0.4868 15 17 ( 3199 1k7c_A) ( 4813 1oxb_B) 0.5999 0.8990 4.6314 ( 0 17 36) 0 0.5999 0.8990 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 4871 1p2f_A) 0.5999 0.8992 4.3817 ( 0 15 36) 0 0.6651 0.9881 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 4905 1p5f_A) 0.5959 0.6372 5.5951 ( 1 15 36) 0 0.5959 0.6372 15 14 ( 3199 1k7c_A) ( 4916 1p6u_A) 0.5332 0.7993 4.9371 ( 0 9 28) 0 0.5995 0.8963 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 4926 1p80_A) 0.4629 0.5310 3.5450 ( 1 11 21) 0 0.4932 0.5382 15 13 ( 3199 1k7c_A) ( 5096 1psd_A) 0.5333 0.8880 4.4893 ( 0 5 28) 0 0.5333 0.8881 15 9 ( 3199 1k7c_A) ( 5234 1q7r_A) 0.3333 0.2778 7.9889 ( 0 6 10) 0 0.5999 0.5000 15 18 ( 3199 1k7c_A) ( 5289 1qcz_A) 0.5180 0.7085 3.8969 ( 1 9 28) 0 0.5331 0.7985 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 5297 1qdl_B) 0.5781 0.5173 4.6028 ( 2 19 36) 0 0.5951 0.5268 15 17 ( 3199 1k7c_A) ( 5364 1qkk_A) 0.5985 0.8889 8.4496 ( 0 14 36) 0 0.5999 0.8994 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 5397 1qo0_D) 0.5304 0.6578 11.6289 ( 0 16 28) 0 0.6590 0.8108 15 12 ( 3199 1k7c_A) ( 5470 1qvz_A) 0.3258 0.3070 7.4801 ( 1 6 10) 0 0.3961 0.3722 15 16 ( 3199 1k7c_A) ( 5673 1rli_A) 0.5504 0.6302 6.0154 ( 2 15 36) 0 0.6182 0.7465 15 12 ( 3199 1k7c_A) ( 5752 1s2d_A) 0.2666 0.4440 9.1958 ( 0 3 6) 0 0.4666 0.7774 15 9 ( 3199 1k7c_A) ( 5785 1say_A) 0.6312 0.5145 5.2482 ( 2 19 45) 0 0.6651 0.5258 15 19 ( 3199 1k7c_A) ( 5842 1sqs_A) 0.5906 0.6297 6.1411 ( 1 12 36) 0 0.5928 0.6328 15 14 ( 3199 1k7c_A) ( 5920 1tmy ) 0.5999 0.8992 4.3184 ( 0 18 36) 0 0.5999 0.8992 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 6242 1vhq_A) 0.3333 0.3571 6.9706 ( 0 6 10) 0 0.5276 0.5634 15 14 ( 3199 1k7c_A) ( 6258 1vi6_A) 0.3999 0.4614 6.1416 ( 0 3 15) 0 0.5332 0.6150 15 13 ( 3199 1k7c_A) ( 6283 1vjg_A) 0.5986 0.7459 4.8355 ( 1 20 36) 0 0.5997 0.7491 15 12 ( 3199 1k7c_A) ( 6496 2nac_A) 0.6510 0.7386 6.1601 ( 1 12 45) 0 0.6510 0.7386 15 13 ( 3199 1k7c_A) ( 6624 5nul ) 0.5331 0.7986 5.8311 ( 0 11 28) 0 0.5929 0.8514 15 10 ( 3199 1k7c_A) ( 6640 7req_A) 0.5998 0.7495 4.8862 ( 0 18 36) 0 0.5998 0.7495 15 12 ( 3199 1k7c_A) ( 6642 7req_B) 0.5333 0.6153 3.8045 ( 0 10 28) 0 0.6649 0.7656 15 13 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------