------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 3412 1krw_A) ( 6 1a04_A) 0.9771 0.8946 3.3595 ( 1 18 45) 0 0.9771 0.8946 10 11 ( 3412 1krw_A) ( 26 1a2o_A) 0.9994 0.9994 3.5725 ( 0 18 45) 0 0.9994 0.9994 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 90 1a9x_B) 0.8997 0.5000 3.3564 ( 0 12 36) 0 0.8997 0.5000 10 18 ( 3412 1krw_A) ( 256 1b00_A) 0.8995 0.8995 3.8221 ( 0 15 36) 0 0.8995 0.8995 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 266 1b1c_A) 0.6999 0.6363 3.7610 ( 0 7 21) 0 0.8989 0.8175 10 11 ( 3412 1krw_A) ( 428 1bmt_A) 0.9994 0.9087 3.4685 ( 0 18 45) 0 0.9994 0.9087 10 11 ( 3412 1krw_A) ( 477 1bvy_F) 0.7997 0.8883 4.0067 ( 0 12 28) 0 0.7997 0.8884 10 9 ( 3412 1krw_A) ( 523 1c4k_A) 0.5000 0.6249 4.0482 ( 0 1 10) 0 0.5998 0.7493 10 8 ( 3412 1krw_A) ( 562 1ccw_A) 0.8994 0.8994 3.9614 ( 0 13 36) 0 0.8994 0.8994 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 745 1d4a_A) 0.8816 0.5975 5.2141 ( 1 17 36) 0 0.9797 0.6639 10 15 ( 3412 1krw_A) ( 786 1dbw_A) 0.9771 0.9771 3.3665 ( 1 18 45) 0 0.9771 0.9771 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 793 1dcf_A) 0.9844 0.9844 3.4699 ( 1 20 45) 0 0.9844 0.9844 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 971 1dxy ) 0.8998 0.9996 3.2370 ( 0 11 36) 0 0.8998 0.9996 10 9 ( 3412 1krw_A) ( 980 1dz3_A) 0.8998 0.8998 3.2422 ( 0 14 36) 0 0.8998 0.8998 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 1042 1e5d_A) 0.5996 0.5996 5.8734 ( 0 7 15) 0 0.8976 0.8976 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 1177 1eiw_A) 0.5735 0.5819 4.0789 ( 3 18 36) 0 0.6993 0.7767 10 9 ( 3412 1krw_A) ( 1252 1es9_A) 0.9980 0.8325 4.8199 ( 0 14 45) 0 0.9980 0.8325 10 12 ( 3412 1krw_A) ( 1253 1esc ) 0.9919 0.5877 6.8170 ( 0 19 45) 0 0.9919 0.5877 10 17 ( 3412 1krw_A) ( 1266 1euc_B) 0.9996 0.8332 3.2941 ( 0 16 45) 0 0.9996 0.8332 10 12 ( 3412 1krw_A) ( 1379 1f2v_A) 0.9715 0.6221 3.7494 ( 1 17 45) 0 0.9715 0.6221 10 16 ( 3412 1krw_A) ( 1397 1f4p_A) 0.6999 0.7776 3.7758 ( 0 8 21) 0 0.8984 0.9973 10 9 ( 3412 1krw_A) ( 1443 1f8y_A) 0.4999 0.4545 5.4363 ( 0 4 10) 0 0.8620 0.7938 10 11 ( 3412 1krw_A) ( 1516 1fjg_B) 0.4719 0.4488 3.6295 ( 1 5 21) 0 0.4719 0.4488 10 12 ( 3412 1krw_A) ( 1547 1flc_A) 0.8534 0.4972 5.1943 ( 1 13 36) 0 0.8534 0.4972 10 18 ( 3412 1krw_A) ( 1659 1fye_A) 0.6000 0.3333 3.5392 ( 0 7 15) 0 0.8720 0.4984 10 18 ( 3412 1krw_A) ( 1662 1fyx_A) 0.6632 0.6632 3.9221 ( 1 10 21) 0 0.7992 0.7992 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 1700 1g2i_A) 0.8823 0.6395 4.4553 ( 1 17 36) 0 0.9825 0.7109 10 14 ( 3412 1krw_A) ( 1803 1gdh_A) 0.9272 0.9272 3.6193 ( 1 13 45) 0 0.9272 0.9272 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 1901 1gpm_A) 0.7999 0.5000 2.9161 ( 0 10 28) 0 0.7999 0.5000 10 16 ( 3412 1krw_A) ( 2027 1h05_A) 0.8998 0.8181 3.0377 ( 0 8 36) 0 0.8998 0.8181 10 11 ( 3412 1krw_A) ( 2427 1i7q_B) 0.6475 0.4719 3.0698 ( 2 14 36) 0 0.8994 0.5000 10 18 ( 3412 1krw_A) ( 2470 1iex_A) 0.9432 0.8088 3.7523 ( 1 14 45) 0 0.9432 0.8088 10 12 ( 3412 1krw_A) ( 2714 1j2y_A) 0.8994 0.8178 4.0947 ( 0 11 36) 0 0.8994 0.8178 10 11 ( 3412 1krw_A) ( 2729 1j4a_A) 0.9648 0.9648 3.2494 ( 1 16 45) 0 0.9648 0.9648 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 2809 1jbe_A) 0.9813 0.9813 3.2673 ( 1 19 45) 0 0.9813 0.9813 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 3034 1jrl_A) 0.8988 0.8988 4.8170 ( 0 12 36) 0 0.8988 0.8988 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 3073 1jvn_A) 0.8768 0.4727 5.6027 ( 1 16 36) 0 0.8768 0.4727 10 19 ( 3412 1krw_A) ( 3189 1k66_A) 0.9997 0.9089 3.0186 ( 0 18 45) 0 0.9997 0.9089 10 11 ( 3412 1krw_A) ( 3190 1k68_A) 0.9998 0.9998 2.8261 ( 0 18 45) 0 0.9998 0.9998 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 3199 1k7c_A) 0.8994 0.5999 4.0689 ( 0 12 36) 0 0.8994 0.5999 10 15 ( 3412 1krw_A) ( 3234 1k9v_F) 0.7998 0.4444 3.6042 ( 0 14 28) 0 0.8772 0.4987 10 18 ( 3412 1krw_A) ( 3238 1ka9_H) 0.7997 0.5000 4.0675 ( 0 13 28) 0 0.7997 0.5000 10 16 ( 3412 1krw_A) ( 3295 1kgs_A) 0.8650 0.8650 3.1397 ( 1 14 36) 0 0.8650 0.8650 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 3412 1krw_A) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 22 45) 0 1.0000 1.0000 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 3462 1kwg_A) 0.8995 0.5625 3.8300 ( 0 13 36) 0 0.8995 0.5625 10 16 ( 3412 1krw_A) ( 3560 1l7d_A) 0.6120 0.4833 3.8916 ( 2 13 36) 0 0.9755 0.5864 10 17 ( 3412 1krw_A) ( 3581 1l9x_A) 0.6473 0.3823 4.6158 ( 2 14 36) 0 0.7989 0.3823 10 23 ( 3412 1krw_A) ( 3632 1li4_A) 0.9989 0.5555 4.1459 ( 0 16 45) 0 0.9989 0.5555 10 18 ( 3412 1krw_A) ( 3801 1m2e_A) 0.8993 0.9989 4.1301 ( 0 16 36) 0 0.8993 0.9989 10 9 ( 3412 1krw_A) ( 3896 1mb3_A) 0.9773 0.9773 2.7112 ( 1 18 45) 0 0.9773 0.9773 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 4066 1mx3_A) 0.5000 0.4545 3.6157 ( 0 2 10) 0 0.8984 0.8172 10 11 ( 3412 1krw_A) ( 4130 1n57_A) 0.4204 0.2715 5.6708 ( 1 5 10) 0 0.7839 0.4859 10 18 ( 3412 1krw_A) ( 4185 1nat ) 0.9998 0.9998 2.6787 ( 0 15 45) 0 0.9998 0.9998 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 4323 1nni_1) 0.7997 0.7271 4.0838 ( 0 10 28) 0 0.8988 0.8174 10 11 ( 3412 1krw_A) ( 4433 1ny5_A) 0.9947 0.9947 6.1268 ( 0 14 45) 0 0.9947 0.9947 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 4474 1o1y_A) 0.7000 0.3684 2.7434 ( 0 8 21) 0 0.7000 0.3988 10 19 ( 3412 1krw_A) ( 4590 1obo_A) 0.5995 0.5995 6.3689 ( 0 7 15) 0 0.8989 0.8989 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 4669 1oi7_A) 0.8998 0.8180 3.1566 ( 0 11 36) 0 0.8998 0.8180 10 11 ( 3412 1krw_A) ( 4787 1ou0_A) 0.9989 0.5882 4.0770 ( 0 16 45) 0 0.9989 0.5882 10 17 ( 3412 1krw_A) ( 4813 1oxb_B) 0.9846 0.9846 3.2154 ( 1 20 45) 0 0.9846 0.9846 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 4871 1p2f_A) 0.9769 0.9769 3.5828 ( 1 18 45) 0 0.9991 0.9991 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 4905 1p5f_A) 0.6796 0.5770 4.1117 ( 2 15 36) 0 0.8753 0.6380 10 14 ( 3412 1krw_A) ( 4916 1p6u_A) 0.8994 0.8994 3.9700 ( 0 13 36) 0 0.8994 0.8994 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 4926 1p80_A) 0.8825 0.6874 4.2363 ( 1 17 36) 0 0.8987 0.6920 10 13 ( 3412 1krw_A) ( 5096 1psd_A) 0.8994 0.9989 4.0971 ( 0 4 36) 0 0.8994 0.9989 10 9 ( 3412 1krw_A) ( 5234 1q7r_A) 0.8393 0.4962 4.8792 ( 1 12 36) 0 0.8989 0.4999 10 18 ( 3412 1krw_A) ( 5289 1qcz_A) 0.8990 0.8990 4.5953 ( 0 11 36) 0 0.8990 0.8990 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 5297 1qdl_B) 0.9550 0.5847 4.1975 ( 1 15 45) 0 0.9550 0.5847 10 17 ( 3412 1krw_A) ( 5364 1qkk_A) 0.9929 0.9929 6.5986 ( 0 18 45) 0 0.9929 0.9929 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 5397 1qo0_D) 0.8592 0.7326 10.0855 ( 1 16 36) 0 0.8759 0.7400 10 12 ( 3412 1krw_A) ( 5470 1qvz_A) 0.8993 0.5624 4.1808 ( 0 17 36) 0 0.9822 0.6232 10 16 ( 3412 1krw_A) ( 5673 1rli_A) 0.7645 0.7071 5.1840 ( 2 17 45) 0 0.8989 0.7496 10 12 ( 3412 1krw_A) ( 5752 1s2d_A) 0.5385 0.5736 5.1663 ( 1 7 15) 0 0.7970 0.8838 10 9 ( 3412 1krw_A) ( 5785 1say_A) 0.8998 0.4737 3.0633 ( 0 13 36) 0 0.9985 0.5263 10 19 ( 3412 1krw_A) ( 5842 1sqs_A) 0.8538 0.6334 4.7169 ( 1 13 36) 0 0.9917 0.7127 10 14 ( 3412 1krw_A) ( 5920 1tmy ) 0.9997 0.9997 3.0107 ( 0 18 45) 0 0.9997 0.9997 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 6242 1vhq_A) 0.7646 0.5643 3.7452 ( 1 12 28) 0 0.8987 0.6426 10 14 ( 3412 1krw_A) ( 6258 1vi6_A) 0.4996 0.3845 7.7735 ( 0 1 10) 0 0.7997 0.6153 10 13 ( 3412 1krw_A) ( 6283 1vjg_A) 0.8964 0.7486 6.3319 ( 0 12 36) 0 0.8977 0.7491 10 12 ( 3412 1krw_A) ( 6496 2nac_A) 0.9993 0.7690 3.6530 ( 0 15 45) 0 0.9993 0.7690 10 13 ( 3412 1krw_A) ( 6624 5nul ) 0.6999 0.6999 3.8558 ( 0 9 21) 0 0.9937 0.9937 10 10 ( 3412 1krw_A) ( 6640 7req_A) 0.9809 0.8255 3.9222 ( 1 19 45) 0 0.9944 0.8311 10 12 ( 3412 1krw_A) ( 6642 7req_B) 0.8198 0.6673 4.6000 ( 1 11 36) 0 0.8971 0.6915 10 13 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------