------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 1191 1eke_A) ( 247 1az9 ) 0.3571 0.3571 5.7096 ( 0 6 10) 0 0.4788 0.4788 14 14 ( 1191 1eke_A) ( 345 1bco ) 0.5713 0.7268 4.9382 ( 0 17 28) 0 0.6411 0.8122 14 11 ( 1191 1eke_A) ( 463 1bu6_O) 0.2856 0.2222 12.2151 ( 0 2 6) 0 0.4202 0.3596 14 18 ( 1191 1eke_A) ( 464 1bu6_O) 0.2857 0.2353 6.2321 ( 0 2 6) 0 0.3293 0.3048 14 17 ( 1191 1eke_A) ( 471 1bup_A) 0.5712 0.4999 5.6671 ( 0 20 28) 0 0.5712 0.5094 14 16 ( 1191 1eke_A) ( 472 1bup_A) 0.4999 0.5832 5.1094 ( 0 13 21) 0 0.4999 0.5832 14 12 ( 1191 1eke_A) ( 592 1chm_A) 0.2857 0.3333 5.4211 ( 0 3 6) 0 0.4589 0.4839 14 12 ( 1191 1eke_A) ( 703 1cxq_A) 0.5714 0.7997 3.9424 ( 0 19 28) 0 0.6347 0.8595 14 10 ( 1191 1eke_A) ( 713 1cza_N) 0.5703 0.7938 5.6014 ( 1 20 28) 0 0.5703 0.7938 14 10 ( 1191 1eke_A) ( 714 1cza_N) 0.3568 0.3568 10.7605 ( 0 6 10) 0 0.5796 0.5796 14 14 ( 1191 1eke_A) ( 934 1dt9_A) 0.2972 0.3374 6.1503 ( 2 7 10) 0 0.3570 0.5543 14 9 ( 1191 1eke_A) ( 1021 1e3m_A) 0.2857 0.4444 4.6913 ( 0 0 6) 0 0.2857 0.4444 14 9 ( 1191 1eke_A) ( 1033 1e4f_T) 0.5712 0.5712 5.3005 ( 0 20 28) 0 0.5712 0.5712 14 14 ( 1191 1eke_A) ( 1034 1e4f_T) 0.5713 0.6152 4.8699 ( 0 21 28) 0 0.5713 0.6152 14 13 ( 1191 1eke_A) ( 1191 1eke_A) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 77 91) 0 1.0000 1.0000 14 14 ( 1191 1eke_A) ( 1223 1eo1_A) 0.3371 0.4588 5.2968 ( 1 5 10) 0 0.3790 0.4999 14 8 ( 1191 1eke_A) ( 1289 1ewq_A) 0.4256 0.4540 5.6753 ( 3 14 28) 0 0.4256 0.4999 14 10 ( 1191 1eke_A) ( 1305 1exq_A) 0.5000 0.7774 4.3977 ( 0 15 21) 0 0.5000 0.7774 14 9 ( 1191 1eke_A) ( 1522 1fjg_K) 0.5000 0.9985 4.4923 ( 0 9 21) 0 0.5000 0.9985 14 7 ( 1191 1eke_A) ( 1656 1fxx_A) 0.2857 0.1290 8.1076 ( 0 3 6) 0 0.3466 0.2272 14 31 ( 1191 1eke_A) ( 1778 1g99_A) 0.4999 0.6361 4.8525 ( 0 13 21) 0 0.4999 0.6361 14 11 ( 1191 1eke_A) ( 1779 1g99_A) 0.4224 0.3718 11.3503 ( 1 9 15) 0 0.4224 0.3718 14 16 ( 1191 1eke_A) ( 2218 1hjr_A) 0.2857 0.4000 4.9749 ( 0 2 6) 0 0.2945 0.4000 14 10 ( 1191 1eke_A) ( 2296 1hux_A) 0.3571 0.2778 3.9415 ( 0 6 10) 0 0.3862 0.3671 14 18 ( 1191 1eke_A) ( 2378 1i39_A) 0.9267 0.9973 2.7728 ( 2 63 78) 0 0.9267 0.9973 14 13 ( 1191 1eke_A) ( 2483 1ig8_A) 0.6418 0.8148 4.6264 ( 1 24 36) 0 0.6418 0.8148 14 11 ( 1191 1eke_A) ( 2484 1ig8_A) 0.2972 0.2869 7.9316 ( 2 7 10) 0 0.2972 0.2869 14 15 ( 1191 1eke_A) ( 2491 1ih7_A) 0.2857 0.1481 3.8288 ( 0 1 6) 0 0.5672 0.2961 14 27 ( 1191 1eke_A) ( 2619 1iv0_A) 0.4948 0.8775 3.9647 ( 1 11 21) 0 0.4948 0.8775 14 7 ( 1191 1eke_A) ( 2733 1j54_A) 0.3571 0.4165 7.4685 ( 0 6 10) 0 0.3571 0.4165 14 12 ( 1191 1eke_A) ( 2775 1j9a_A) 0.3962 0.3962 6.7905 ( 2 11 15) 0 0.3962 0.3962 14 14 ( 1191 1eke_A) ( 2821 1jce_A) 0.5714 0.6665 3.9965 ( 0 20 28) 0 0.5714 0.6665 14 12 ( 1191 1eke_A) ( 2822 1jce_A) 0.6424 0.5997 5.6160 ( 0 26 36) 0 0.6424 0.5997 14 15 ( 1191 1eke_A) ( 2910 1jj2_M) 0.3537 0.4434 4.5989 ( 1 8 10) 0 0.4282 0.5441 14 11 ( 1191 1eke_A) ( 2954 1jl1_A) 0.5713 0.7992 5.1062 ( 0 16 28) 0 0.5713 0.7992 14 10 ( 1191 1eke_A) ( 3210 1k8k_A) 0.2818 0.2480 15.0553 ( 1 6 6) 0 0.2972 0.2763 14 16 ( 1191 1eke_A) ( 3260 1kcf_A) 0.3571 0.4166 5.9172 ( 0 7 10) 0 0.3571 0.4166 14 12 ( 1191 1eke_A) ( 3286 1kfs_A) 0.2857 0.3333 6.2994 ( 0 3 6) 0 0.3118 0.3333 14 12 ( 1191 1eke_A) ( 3925 1mgt_A) 0.2785 0.4665 7.9239 ( 1 5 6) 0 0.2785 0.4665 14 6 ( 1191 1eke_A) ( 4043 1mus_A) 0.5712 0.2963 5.4826 ( 0 18 28) 0 0.6415 0.3579 14 27 ( 1191 1eke_A) ( 4057 1mwm_A) 0.5594 0.6901 5.3825 ( 2 21 28) 0 0.5594 0.6901 14 11 ( 1191 1eke_A) ( 4058 1mwm_A) 0.2857 0.3636 7.6532 ( 0 2 6) 0 0.2965 0.3636 14 11 ( 1191 1eke_A) ( 4191 1nbw_A) 0.2856 0.2222 9.7715 ( 0 2 6) 0 0.2856 0.2261 14 18 ( 1191 1eke_A) ( 4193 1nbw_A) 0.5701 0.4993 5.1013 ( 1 19 28) 0 0.5701 0.5030 14 16 ( 1191 1eke_A) ( 4281 1nk4_A) 0.2857 0.3333 6.2384 ( 0 3 6) 0 0.2857 0.3333 14 12 ( 1191 1eke_A) ( 4391 1nu0_A) 0.2857 0.4999 4.8907 ( 0 3 6) 0 0.2857 0.4999 14 8 ( 1191 1eke_A) ( 4469 1o13_A) 0.2857 0.4998 6.6803 ( 0 2 6) 0 0.2857 0.4998 14 8 ( 1191 1eke_A) ( 4935 1p90_A) 0.3512 0.4713 9.0265 ( 1 7 10) 0 0.3512 0.4713 14 10 ( 1191 1eke_A) ( 5120 1pv9_A) 0.4973 0.5775 4.3990 ( 1 13 21) 0 0.4973 0.5775 14 12 ( 1191 1eke_A) ( 5243 1q8i_A) 0.4783 0.2813 6.2956 ( 3 17 28) 0 0.4783 0.2813 14 28 ( 1191 1eke_A) ( 5447 1qtm_A) 0.2857 0.4440 8.9526 ( 0 5 6) 0 0.3467 0.4839 14 9 ( 1191 1eke_A) ( 5500 1qz5_A) 0.5714 0.7271 4.0793 ( 0 19 28) 0 0.6330 0.7871 14 11 ( 1191 1eke_A) ( 5501 1qz5_A) 0.2857 0.2222 5.7257 ( 0 3 6) 0 0.5452 0.4364 14 18 ( 1191 1eke_A) ( 5883 1t7p_A) 0.4285 0.4999 5.4850 ( 0 10 15) 0 0.4285 0.4999 14 12 ( 1191 1eke_A) ( 5906 1tgo_A) 0.3532 0.1850 12.5791 ( 1 8 10) 0 0.3532 0.2624 14 27 ( 1191 1eke_A) ( 6064 1uoc_A) 0.4285 0.3529 6.2935 ( 0 8 15) 0 0.4285 0.3529 14 17 ( 1191 1eke_A) ( 6249 1vhx_A) 0.5694 0.7896 6.9627 ( 1 18 28) 0 0.5694 0.7896 14 10 ( 1191 1eke_A) ( 6299 1vk0_A) 0.4997 0.4665 6.9495 ( 0 12 21) 0 0.4997 0.4665 14 15 ( 1191 1eke_A) ( 6323 1vrt_A) 0.4972 0.8342 4.8698 ( 1 13 21) 0 0.4972 0.8342 14 8 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------