------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 5906 1tgo_A) ( 247 1az9 ) 0.1852 0.3569 10.2731 ( 0 5 10) 0 0.3703 0.7135 27 14 ( 5906 1tgo_A) ( 345 1bco ) 0.2222 0.5445 8.5194 ( 0 9 15) 0 0.2259 0.5445 27 11 ( 5906 1tgo_A) ( 463 1bu6_O) 0.2739 0.3414 6.4121 ( 5 19 28) 0 0.2962 0.4441 27 18 ( 5906 1tgo_A) ( 464 1bu6_O) 0.1614 0.1905 8.9962 ( 3 6 10) 0 0.3328 0.5244 27 17 ( 5906 1tgo_A) ( 471 1bup_A) 0.2892 0.4302 6.1200 ( 4 21 28) 0 0.2892 0.4375 27 16 ( 5906 1tgo_A) ( 472 1bup_A) 0.1850 0.4077 13.9901 ( 1 8 10) 0 0.2320 0.4077 27 12 ( 5906 1tgo_A) ( 592 1chm_A) 0.1852 0.4166 5.4960 ( 0 8 10) 0 0.3333 0.7482 27 12 ( 5906 1tgo_A) ( 703 1cxq_A) 0.2210 0.2653 8.0675 ( 6 16 21) 0 0.2222 0.5982 27 10 ( 5906 1tgo_A) ( 713 1cza_N) 0.2962 0.7921 6.1625 ( 1 19 28) 0 0.2962 0.7921 27 10 ( 5906 1tgo_A) ( 714 1cza_N) 0.1982 0.2180 9.5117 ( 5 11 21) 0 0.2570 0.3566 27 14 ( 5906 1tgo_A) ( 934 1dt9_A) 0.2963 0.8836 7.0942 ( 0 21 28) 0 0.2963 0.8836 27 9 ( 5906 1tgo_A) ( 1021 1e3m_A) 0.2963 0.8878 4.7464 ( 0 15 28) 0 0.2963 0.8878 27 9 ( 5906 1tgo_A) ( 1033 1e4f_T) 0.2222 0.4285 6.0980 ( 0 9 15) 0 0.2960 0.5639 27 14 ( 5906 1tgo_A) ( 1034 1e4f_T) 0.2591 0.5330 5.6961 ( 1 12 21) 0 0.2591 0.5330 27 13 ( 5906 1tgo_A) ( 1191 1eke_A) 0.1850 0.3532 12.5791 ( 1 8 10) 0 0.2624 0.3532 27 14 ( 5906 1tgo_A) ( 1223 1eo1_A) 0.2593 0.8726 5.8993 ( 0 15 21) 0 0.2593 0.8726 27 8 ( 5906 1tgo_A) ( 1289 1ewq_A) 0.2963 0.7994 4.7286 ( 0 16 28) 0 0.2963 0.7994 27 10 ( 5906 1tgo_A) ( 1305 1exq_A) 0.1859 0.2193 9.9551 ( 5 11 15) 0 0.2920 0.5701 27 9 ( 5906 1tgo_A) ( 1522 1fjg_K) 0.2222 0.8568 3.7428 ( 0 8 15) 0 0.2241 0.8568 27 7 ( 5906 1tgo_A) ( 1656 1fxx_A) 0.2222 0.1935 6.7370 ( 0 8 15) 0 0.4364 0.4018 27 31 ( 5906 1tgo_A) ( 1778 1g99_A) 0.3021 0.3944 5.7841 ( 5 20 36) 0 0.3021 0.4544 27 11 ( 5906 1tgo_A) ( 1779 1g99_A) 0.1850 0.3095 5.9210 ( 1 7 10) 0 0.2962 0.4992 27 16 ( 5906 1tgo_A) ( 2218 1hjr_A) 0.3333 0.8937 5.8493 ( 1 25 36) 0 0.3702 0.9821 27 10 ( 5906 1tgo_A) ( 2296 1hux_A) 0.2962 0.4441 6.0468 ( 1 20 28) 0 0.3273 0.4442 27 18 ( 5906 1tgo_A) ( 2378 1i39_A) 0.2445 0.2825 8.4575 ( 7 20 28) 0 0.2644 0.3358 27 13 ( 5906 1tgo_A) ( 2483 1ig8_A) 0.2591 0.6195 5.0234 ( 1 11 21) 0 0.2739 0.6353 27 11 ( 5906 1tgo_A) ( 2484 1ig8_A) 0.2172 0.3363 6.5355 ( 3 12 15) 0 0.2644 0.3899 27 15 ( 5906 1tgo_A) ( 2491 1ih7_A) 0.7802 0.7802 4.5532 ( 15 186 231) 0 0.7802 0.7802 27 27 ( 5906 1tgo_A) ( 2619 1iv0_A) 0.2222 0.8570 3.0202 ( 0 8 15) 0 0.2222 0.8570 27 7 ( 5906 1tgo_A) ( 2733 1j54_A) 0.3704 0.8322 3.7600 ( 1 33 45) 0 0.4074 0.9149 27 12 ( 5906 1tgo_A) ( 2775 1j9a_A) 0.1703 0.2238 7.3557 ( 3 7 10) 0 0.3695 0.6932 27 14 ( 5906 1tgo_A) ( 2821 1jce_A) 0.2593 0.5831 5.1742 ( 0 14 21) 0 0.2593 0.5831 27 12 ( 5906 1tgo_A) ( 2822 1jce_A) 0.2592 0.4651 5.8914 ( 1 14 21) 0 0.3092 0.4651 27 15 ( 5906 1tgo_A) ( 2910 1jj2_M) 0.1481 0.3636 6.0363 ( 0 4 6) 0 0.2952 0.6519 27 11 ( 5906 1tgo_A) ( 2954 1jl1_A) 0.2151 0.2329 7.5053 ( 9 21 28) 0 0.2259 0.3999 27 10 ( 5906 1tgo_A) ( 3210 1k8k_A) 0.1481 0.2500 8.0549 ( 0 3 6) 0 0.2534 0.3791 27 16 ( 5906 1tgo_A) ( 3260 1kcf_A) 0.3333 0.7474 5.5508 ( 1 24 36) 0 0.3333 0.7474 27 12 ( 5906 1tgo_A) ( 3286 1kfs_A) 0.4008 0.7135 3.3351 ( 5 40 55) 0 0.4065 0.8711 27 12 ( 5906 1tgo_A) ( 3925 1mgt_A) 0.1481 0.6664 4.9216 ( 0 2 6) 0 0.1614 0.6664 27 6 ( 5906 1tgo_A) ( 4043 1mus_A) 0.1852 0.1852 5.9256 ( 0 5 10) 0 0.3163 0.3163 27 27 ( 5906 1tgo_A) ( 4057 1mwm_A) 0.2963 0.7265 5.6226 ( 0 19 28) 0 0.2963 0.7265 27 11 ( 5906 1tgo_A) ( 4058 1mwm_A) 0.1852 0.4545 5.3591 ( 0 7 10) 0 0.2952 0.6512 27 11 ( 5906 1tgo_A) ( 4191 1nbw_A) 0.2222 0.3333 4.4648 ( 0 8 15) 0 0.2838 0.3758 27 18 ( 5906 1tgo_A) ( 4193 1nbw_A) 0.2489 0.3503 8.0280 ( 4 16 21) 0 0.3245 0.4776 27 16 ( 5906 1tgo_A) ( 4281 1nk4_A) 0.4065 0.8710 4.2065 ( 3 40 55) 0 0.4065 0.8710 27 12 ( 5906 1tgo_A) ( 4391 1nu0_A) 0.2963 0.9940 6.3098 ( 0 19 28) 0 0.2963 0.9940 27 8 ( 5906 1tgo_A) ( 4469 1o13_A) 0.2593 0.8734 5.3840 ( 0 16 21) 0 0.2593 0.8734 27 8 ( 5906 1tgo_A) ( 4935 1p90_A) 0.2593 0.6992 6.0307 ( 0 15 21) 0 0.3205 0.6992 27 10 ( 5906 1tgo_A) ( 5120 1pv9_A) 0.1851 0.4120 6.1126 ( 1 9 10) 0 0.3222 0.6663 27 12 ( 5906 1tgo_A) ( 5243 1q8i_A) 0.8418 0.8130 4.0845 ( 11 202 253) 0 0.8418 0.8130 27 28 ( 5906 1tgo_A) ( 5447 1qtm_A) 0.1481 0.4444 2.9812 ( 0 3 6) 0 0.3328 0.9049 27 9 ( 5906 1tgo_A) ( 5500 1qz5_A) 0.2592 0.6274 4.7060 ( 1 13 21) 0 0.2592 0.6274 27 11 ( 5906 1tgo_A) ( 5501 1qz5_A) 0.1852 0.2776 13.1178 ( 0 6 10) 0 0.2445 0.2776 27 18 ( 5906 1tgo_A) ( 5883 1t7p_A) 0.3718 0.4894 6.0667 ( 8 40 55) 0 0.3718 0.8197 27 12 ( 5906 1tgo_A) ( 5906 1tgo_A) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 300 351) 0 1.0000 1.0000 27 27 ( 5906 1tgo_A) ( 6064 1uoc_A) 0.3702 0.5861 3.2270 ( 2 34 45) 0 0.4443 0.7042 27 17 ( 5906 1tgo_A) ( 6249 1vhx_A) 0.2963 0.7985 5.8943 ( 0 20 28) 0 0.2963 0.7985 27 10 ( 5906 1tgo_A) ( 6299 1vk0_A) 0.2201 0.3671 2.8222 ( 2 10 15) 0 0.4137 0.7265 27 15 ( 5906 1tgo_A) ( 6323 1vrt_A) 0.2222 0.7495 4.7974 ( 0 7 15) 0 0.2427 0.7495 27 8 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------