------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Top-ranked similarities (based on backbone shifts), as measured by a combination of score and contiguity. Some relevant parameters: HELIX min length: 5 STRAND min length: 3 shift-tolerance = -10 permissible-violations = 4 max-breaks = NIL retain-m = 100 best-n = 100 anglethresh = 0.5 septhresh = 5 min_length = 4 rmsd-tol = 9.9999999999999E12 Legend: ( ix1 chain1 ) ( ix2 chain2 ) rho___12 rho___21 L2_ERROR (Xbad Xsig Xtot) BRK maxrho12 maxrho21 SS1 SS2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ( 6129 1uwc_A) ( 76 1a8q ) 0.2760 0.2760 9.5315 ( 1 7 10) 0 0.3936 0.3936 18 18 ( 6129 1uwc_A) ( 98 1ac5 ) 0.2778 0.1724 4.6022 ( 0 6 10) 0 0.5076 0.3880 18 29 ( 6129 1uwc_A) ( 211 1auo_A) 0.3889 0.4118 4.2412 ( 0 10 21) 0 0.3889 0.4118 18 17 ( 6129 1uwc_A) ( 303 1b6g ) 0.3121 0.2751 6.9730 ( 2 9 15) 0 0.4509 0.4374 18 21 ( 6129 1uwc_A) ( 453 1brt ) 0.3333 0.3158 4.8375 ( 0 9 15) 0 0.3957 0.3928 18 19 ( 6129 1uwc_A) ( 465 1bu8_A) 0.3333 0.3000 3.9297 ( 0 5 15) 0 0.3471 0.3439 18 20 ( 6129 1uwc_A) ( 530 1c4x_A) 0.3333 0.3333 4.6570 ( 0 8 15) 0 0.4331 0.4331 18 18 ( 6129 1uwc_A) ( 575 1cex ) 0.3333 0.4614 5.8813 ( 0 5 15) 0 0.4440 0.5161 18 13 ( 6129 1uwc_A) ( 652 1cpy ) 0.2778 0.2000 5.0197 ( 0 5 10) 0 0.3674 0.3373 18 25 ( 6129 1uwc_A) ( 691 1cvl ) 0.2222 0.2000 6.8226 ( 0 5 6) 0 0.4602 0.4249 18 20 ( 6129 1uwc_A) ( 849 1din ) 0.3889 0.4666 4.0572 ( 0 10 21) 0 0.3889 0.4666 18 15 ( 6129 1uwc_A) ( 925 1dqz_A) 0.2781 0.2739 5.6475 ( 3 9 21) 0 0.4407 0.4307 18 19 ( 6129 1uwc_A) ( 960 1dx4_A) 0.3333 0.1818 5.6475 ( 0 7 15) 0 0.3974 0.3227 18 33 ( 6129 1uwc_A) ( 1082 1ea5_A) 0.2778 0.1471 4.4038 ( 0 4 10) 0 0.4839 0.3571 18 34 ( 6129 1uwc_A) ( 1165 1ehy_A) 0.3333 0.3158 4.2170 ( 0 7 15) 0 0.5493 0.5215 18 19 ( 6129 1uwc_A) ( 1173 1ei9_A) 0.2222 0.1905 4.9654 ( 0 0 6) 0 0.4988 0.4363 18 21 ( 6129 1uwc_A) ( 1513 1fj2_A) 0.3889 0.4117 4.2912 ( 0 10 21) 0 0.3889 0.4117 18 17 ( 6129 1uwc_A) ( 1740 1g66_A) 0.2778 0.4166 4.4286 ( 0 2 10) 0 0.4067 0.5000 18 12 ( 6129 1uwc_A) ( 1846 1gkl_A) 0.3333 0.3750 2.8612 ( 0 5 15) 0 0.4730 0.4904 18 16 ( 6129 1uwc_A) ( 2535 1imj_A) 0.3333 0.3158 4.8648 ( 0 10 15) 0 0.4178 0.4124 18 19 ( 6129 1uwc_A) ( 2595 1isp_A) 0.2778 0.4545 5.3269 ( 0 5 10) 0 0.3795 0.5450 18 11 ( 6129 1uwc_A) ( 2616 1iup_A) 0.3315 0.3119 5.5426 ( 2 8 21) 0 0.4444 0.4000 18 20 ( 6129 1uwc_A) ( 2632 1ivy_A) 0.2778 0.1667 4.4007 ( 0 6 10) 0 0.7050 0.4319 18 30 ( 6129 1uwc_A) ( 2697 1j1i_A) 0.3292 0.3292 6.6875 ( 1 7 15) 0 0.3292 0.3292 18 18 ( 6129 1uwc_A) ( 2855 1jfr_A) 0.4444 0.4705 5.1187 ( 0 16 28) 0 0.4557 0.4705 18 17 ( 6129 1uwc_A) ( 2934 1jjf_A) 0.4444 0.5333 3.7315 ( 0 15 28) 0 0.4444 0.5333 18 15 ( 6129 1uwc_A) ( 2946 1jkm_A) 0.3481 0.3237 5.5803 ( 2 9 21) 0 0.4370 0.4232 18 20 ( 6129 1uwc_A) ( 2975 1jmk_C) 0.2778 0.3846 4.7949 ( 0 5 10) 0 0.3911 0.4613 18 13 ( 6129 1uwc_A) ( 3062 1ju3_A) 0.2778 0.2000 5.8785 ( 0 5 10) 0 0.3109 0.3070 18 25 ( 6129 1uwc_A) ( 3218 1k8q_A) 0.3333 0.2400 5.3922 ( 0 8 15) 0 0.6657 0.4798 18 25 ( 6129 1uwc_A) ( 3433 1ku0_A) 0.2778 0.2000 6.4551 ( 0 4 10) 0 0.3878 0.3363 18 25 ( 6129 1uwc_A) ( 3558 1l7a_A) 0.3333 0.3000 4.1368 ( 0 8 15) 0 0.4586 0.4461 18 20 ( 6129 1uwc_A) ( 3657 1llf_A) 0.2778 0.1515 4.6752 ( 0 4 10) 0 0.5015 0.3437 18 33 ( 6129 1uwc_A) ( 3679 1lns_A) 0.2778 0.2381 5.3900 ( 0 4 10) 0 0.4460 0.4225 18 21 ( 6129 1uwc_A) ( 3769 1lzl_A) 0.3333 0.3333 4.3204 ( 0 8 15) 0 0.4434 0.4434 18 18 ( 6129 1uwc_A) ( 3814 1m33_A) 0.3333 0.3529 5.1284 ( 0 8 15) 0 0.3333 0.3529 18 17 ( 6129 1uwc_A) ( 3943 1mj5_A) 0.2778 0.2500 3.8228 ( 0 5 10) 0 0.4177 0.4037 18 20 ( 6129 1uwc_A) ( 3984 1mna_A) 0.2777 0.2940 11.6910 ( 0 6 10) 0 0.4413 0.4665 18 17 ( 6129 1uwc_A) ( 4033 1mtz_A) 0.2760 0.2618 8.7317 ( 1 7 10) 0 0.4604 0.4560 18 19 ( 6129 1uwc_A) ( 4065 1mx1_A) 0.2778 0.1515 4.3769 ( 0 4 10) 0 0.4507 0.3170 18 33 ( 6129 1uwc_A) ( 4422 1nx9_A) 0.3333 0.2400 3.9554 ( 0 10 15) 0 0.5090 0.4129 18 25 ( 6129 1uwc_A) ( 4769 1orv_A) 0.3333 0.3529 4.5047 ( 0 6 15) 0 0.5554 0.5880 18 17 ( 6129 1uwc_A) ( 5028 1pja_A) 0.2222 0.2222 5.9788 ( 0 3 6) 0 0.3911 0.3911 18 18 ( 6129 1uwc_A) ( 5168 1q0r_A) 0.2403 0.2403 6.9891 ( 4 10 21) 0 0.4315 0.4315 18 18 ( 6129 1uwc_A) ( 5301 1qe3_A) 0.3332 0.1935 8.7133 ( 0 10 15) 0 0.4526 0.3283 18 31 ( 6129 1uwc_A) ( 5315 1qfm_A) 0.3333 0.3529 4.4675 ( 0 9 15) 0 0.5928 0.6231 18 17 ( 6129 1uwc_A) ( 5352 1qj4_A) 0.2222 0.2222 4.2257 ( 0 1 6) 0 0.3888 0.3888 18 18 ( 6129 1uwc_A) ( 5380 1qlw_A) 0.3889 0.3182 3.4998 ( 0 11 21) 0 0.3889 0.3588 18 22 ( 6129 1uwc_A) ( 5400 1qo7_A) 0.2555 0.2181 9.9061 ( 2 7 10) 0 0.3258 0.3149 18 22 ( 6129 1uwc_A) ( 5450 1qtr_A) 0.3333 0.2857 4.2390 ( 0 9 15) 0 0.3371 0.3326 18 21 ( 6129 1uwc_A) ( 5498 1qz3_A) 0.2778 0.2632 5.0473 ( 0 6 10) 0 0.4425 0.4196 18 19 ( 6129 1uwc_A) ( 5522 1r1d_A) 0.3333 0.3750 4.4873 ( 0 7 15) 0 0.3671 0.3778 18 16 ( 6129 1uwc_A) ( 5894 1tca ) 0.3333 0.2727 3.9259 ( 0 7 15) 0 0.3661 0.3475 18 22 ( 6129 1uwc_A) ( 5912 1tht_A) 0.2778 0.2381 6.8039 ( 0 6 10) 0 0.3835 0.3575 18 21 ( 6129 1uwc_A) ( 5913 1tib ) 0.8872 0.9389 2.3833 ( 3 91 120) 0 0.8872 0.9389 18 17 ( 6129 1uwc_A) ( 6006 1ufo_A) 0.3333 0.3750 4.8125 ( 0 8 15) 0 0.4296 0.4454 18 16 ( 6129 1uwc_A) ( 6129 1uwc_A) 1.0000 1.0000 0.0000 ( 0 123 153) 0 1.0000 1.0000 18 18 ( 6129 1uwc_A) ( 6279 1vj5_A) 0.2222 0.2000 6.3839 ( 0 2 6) 0 0.3915 0.3833 18 20 ( 6129 1uwc_A) ( 6404 2bce ) 0.2211 0.1608 7.4326 ( 3 7 15) 1 0.4027 0.2964 18 35 ( 6129 1uwc_A) ( 6599 3tgl ) 0.9966 0.9448 2.4460 ( 4 118 153) 0 0.9966 0.9448 18 19 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------