PAM 250

Biochemical properties of the amino acids
C
  sulfhydryl
V, L, I, M
   small, hydrophobic
S, T, P, A ,G
  small, hydrophyllic
N, D, E, Q
  acidic, amide side chains
F, W, Y
  aromatic
H, K, R
   basic

  C S T P A G N D E Q H R K M I L V F Y W
C

12

                                      
S

0

2

                                    
T

-2

1

3

                                  
P

-3

1

0

6

                                
A

-2

1

1

1

2

                              
G

-3

1

0

-1

1

5

                            
N

-4

1

0

-1

0

0

2

                          
D

-5

0

0

-1

0

1

2

4

                        
E

-5

0

0

-1

0

0

1

3

4

                      
Q

-5

-1

-1

0

0

-1

1

2

2

4

                    
H

-3

-1

-1

0

-1

-2

2

1

1

3

6

                  
R

-4

0

-1

0

-2

-3

0

-1

-1

1

2

6

                
K

-5

0

0

-1

-1

-2

1

0

0

1

0

3

5

              
M

-5

-2

-1

-2

-1

-3

-2

-3

-2

-1

-2

0

0

6

            
I

-2

-1

0

-2

-1

-3

-2

-2

-2

-2

-2

-2

-2

2

5

          
L

-6

-3

-2

-3

-2

-4

-3

-4

-3

-2

-2

-3

-3

4

2

6

        
V

-2

-1

0

-1

0

-1

-2

-2

-2

-2

-2

-2

-2

2

4

2

4

      
F

-4

-3

-3

-5

-4

-5

-4

-6

-5

-5

-2

-4

-5

0

1

2

-1

9

    
Y

0

-3

-3

-5

-3

-5

-2

-4

-4

-4

0

-4

-4

-2

-1

-1

-2

7

10

  
W

-8

-2

-5

-6

-6

-7

-4

-7

-7

-5

-3

2

-3

-4

-5

-2

-6

0

0

17



Last modified: November 17th, 2004.
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